MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017562	AC	4	8	1036389	1036396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_017562	CGC	2	6	1036440	1036445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_017562	AC	3	6	1041002	1041007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_017562	TGAC	2	8	1041035	1041042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_017562	TCA	2	6	1041072	1041077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017562	AC	3	6	1041127	1041132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5507	NC_017562	CACC	2	8	1041172	1041179	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5508	NC_017562	AC	4	8	1041203	1041210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_017562	CCT	2	6	1041211	1041216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_017562	C	6	6	1041226	1041231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5511	NC_017562	GCTACC	2	12	1041292	1041303	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_017562	CCT	2	6	1041311	1041316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_017562	CGG	3	9	1041378	1041386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017562	GC	3	6	1041394	1041399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_017562	TTC	2	6	1042425	1042430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_017562	ATGCA	2	10	1042490	1042499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5517	NC_017562	CTG	2	6	1042511	1042516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017562	TAA	2	6	1042617	1042622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017562	ACA	2	6	1042653	1042658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017562	CAAC	2	8	1042659	1042666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_017562	TGAT	2	8	1042743	1042750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017562	ATAA	2	8	1042777	1042784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017562	CAAC	2	8	1042795	1042802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_017562	ACT	2	6	1042894	1042899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017562	C	6	6	1045625	1045630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5526	NC_017562	AC	3	6	1045678	1045683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_017562	CTG	2	6	1045693	1045698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_017562	C	6	6	1047508	1047513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5529	NC_017562	CAA	2	6	1047548	1047553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017562	TCA	2	6	1047565	1047570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_017562	CAG	2	6	1047743	1047748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017562	TCA	3	9	1047840	1047848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_017562	TGC	2	6	1047928	1047933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017562	CGA	2	6	1047938	1047943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017562	TCA	2	6	1049231	1049236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017562	CGT	2	6	1049697	1049702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017562	CGA	2	6	1049706	1049711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017562	GCA	2	6	1050001	1050006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_017562	CCGT	2	8	1050046	1050053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_017562	TCC	2	6	1050219	1050224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_017562	CGC	2	6	1050233	1050238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_017562	TCC	2	6	1050294	1050299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_017562	CGG	2	6	1050348	1050353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017562	CAGC	2	8	1050396	1050403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_017562	CGG	2	6	1057938	1057943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017562	GCC	2	6	1057980	1057985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_017562	GCC	2	6	1058017	1058022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_017562	TCC	2	6	1058038	1058043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_017562	GAT	2	6	1058046	1058051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017562	TCAA	2	8	1058143	1058150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_017562	TTA	2	6	1058158	1058163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017562	GAAT	2	8	1058179	1058186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017562	TCG	2	6	1058198	1058203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017562	TCC	2	6	1058218	1058223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_017562	TTC	2	6	1058236	1058241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017562	CAA	3	9	1058256	1058264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017562	TGA	2	6	1058294	1058299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017562	CAT	3	9	1058318	1058326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_017562	CAG	2	6	1058342	1058347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017562	ATC	2	6	1058439	1058444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017562	GCC	2	6	1058509	1058514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_017562	CGA	2	6	1058519	1058524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017562	CTC	2	6	1058568	1058573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_017562	TTG	2	6	1058629	1058634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017562	CAAA	2	8	1058636	1058643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_017562	GAAA	2	8	1058679	1058686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017562	CCAC	2	8	1058774	1058781	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5568	NC_017562	GTA	2	6	1058879	1058884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017562	AAC	2	6	1058925	1058930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017562	CTC	3	9	1058999	1059007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_017562	C	6	6	1059014	1059019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5572	NC_017562	C	6	6	1059027	1059032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5573	NC_017562	GCA	2	6	1059039	1059044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_017562	CGT	2	6	1059072	1059077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017562	TGC	2	6	1059096	1059101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_017562	TAA	2	6	1059117	1059122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017562	T	6	6	1059214	1059219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017562	CAA	2	6	1059272	1059277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_017562	GCC	2	6	1059297	1059302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_017562	CTT	2	6	1059305	1059310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_017562	CAA	2	6	1059391	1059396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_017562	CGT	2	6	1059434	1059439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_017562	CTGC	2	8	1059462	1059469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_017562	TCA	2	6	1059573	1059578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_017562	CAC	3	9	1059584	1059592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_017562	TGC	2	6	1059612	1059617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_017562	TGG	2	6	1059652	1059657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017562	ATG	2	6	1059663	1059668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017562	CCG	2	6	1059703	1059708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_017562	CGC	2	6	1059725	1059730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_017562	CCA	2	6	1059787	1059792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_017562	ACA	2	6	1059796	1059801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017562	GTG	2	6	1059873	1059878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017562	GCC	2	6	1059897	1059902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_017562	CTG	3	9	1059914	1059922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_017562	TG	3	6	1059924	1059929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017562	CAA	2	6	1059989	1059994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_017562	AGC	2	6	1060038	1060043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_017562	CCA	2	6	1060112	1060117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_017562	TCTTAC	2	12	1060144	1060155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017562	CTC	2	6	1060172	1060177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_017562	GCAC	2	8	1060188	1060195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_017562	TGA	2	6	1060231	1060236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017562	AAC	2	6	1060257	1060262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_017562	CGC	2	6	1060330	1060335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_017562	TCAAC	2	10	1060342	1060351	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5607	NC_017562	TCA	2	6	1060429	1060434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_017562	GTT	2	6	1060445	1060450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_017562	TCG	2	6	1060497	1060502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_017562	T	6	6	1060543	1060548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017562	A	6	6	1060587	1060592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017562	TTG	2	6	1060623	1060628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017562	TGA	2	6	1060717	1060722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017562	GCT	2	6	1060725	1060730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017562	CAA	2	6	1060795	1060800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_017562	TGCTC	2	10	1060804	1060813	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5617	NC_017562	CA	3	6	1060818	1060823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_017562	CCT	2	6	1060866	1060871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_017562	GTA	2	6	1060894	1060899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017562	CTG	2	6	1060906	1060911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017562	GCG	2	6	1060912	1060917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_017562	GGCA	2	8	1060930	1060937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_017562	CCA	2	6	1064020	1064025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_017562	C	8	8	1064137	1064144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5625	NC_017562	GGA	2	6	1064145	1064150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017562	CAACA	2	10	1064183	1064192	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5627	NC_017562	ACC	2	6	1064193	1064198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_017562	ATG	2	6	1064213	1064218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_017562	CAC	2	6	1064259	1064264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_017562	CA	3	6	1064277	1064282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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