MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 chromosome

Total Repeats: 13504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017562	CTT	2	6	961478	961483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017562	TGA	2	6	961507	961512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017562	ACC	2	6	961545	961550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_017562	ATC	2	6	961610	961615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017562	CCAT	2	8	961719	961726	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_017562	GCA	2	6	961789	961794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017562	TCT	2	6	961800	961805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017562	ACCA	2	8	961841	961848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_017562	GC	3	6	961860	961865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_017562	ACACC	2	10	961882	961891	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5011	NC_017562	CG	3	6	961972	961977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_017562	CTC	2	6	961991	961996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_017562	TGTAG	2	10	962006	962015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017562	CAA	2	6	962026	962031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017562	CAC	2	6	962155	962160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_017562	TGAT	2	8	962196	962203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017562	AT	4	8	962243	962250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017562	AAT	2	6	962273	962278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017562	ATCA	2	8	962324	962331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_017562	GC	3	6	962342	962347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_017562	ACCA	2	8	962396	962403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017562	TCA	2	6	962475	962480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017562	AGC	3	9	962501	962509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017562	ATC	2	6	962624	962629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017562	TTGG	2	8	962750	962757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017562	GCTC	2	8	962871	962878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_017562	GAC	2	6	962911	962916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017562	ATT	2	6	962942	962947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017562	GGA	2	6	962972	962977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017562	GAA	2	6	962981	962986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017562	GCA	2	6	963000	963005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017562	GAT	2	6	963157	963162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017562	ATC	2	6	963167	963172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017562	ACA	2	6	963174	963179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017562	CA	3	6	963199	963204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_017562	TTC	2	6	963266	963271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017562	CTT	2	6	963325	963330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017562	ACCA	2	8	963362	963369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_017562	AAAT	2	8	963397	963404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017562	CCT	2	6	963426	963431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_017562	GGC	2	6	963437	963442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017562	CAT	2	6	963454	963459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017562	AT	3	6	963463	963468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017562	TAGA	2	8	963519	963526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017562	CAC	2	6	963531	963536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_017562	CCGA	2	8	963563	963570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017562	GTC	2	6	963647	963652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017562	ATCA	2	8	963655	963662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017562	CAA	2	6	963774	963779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017562	GTCA	2	8	963793	963800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017562	CAC	2	6	963819	963824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_017562	TCA	2	6	963860	963865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017562	A	6	6	963892	963897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017562	CAA	2	6	963937	963942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017562	TG	3	6	964071	964076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017562	A	6	6	964096	964101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017562	CTCG	2	8	964137	964144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017562	TCA	2	6	964176	964181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017562	AACG	2	8	964263	964270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_017562	AGC	2	6	964366	964371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017562	CTT	2	6	964552	964557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017562	CG	3	6	964611	964616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017562	TAACG	2	10	964627	964636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5064	NC_017562	T	6	6	964750	964755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017562	CAG	2	6	964856	964861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017562	CTT	2	6	964906	964911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017562	CCGC	2	8	964920	964927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5068	NC_017562	TCA	2	6	965305	965310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017562	AGA	2	6	966037	966042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017562	TAAA	2	8	966070	966077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017562	GTG	2	6	966202	966207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017562	A	6	6	967533	967538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017562	A	6	6	967600	967605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017562	T	6	6	967620	967625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017562	GAC	2	6	967659	967664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017562	GCT	2	6	968690	968695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017562	ACTC	2	8	968723	968730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_017562	AAC	2	6	968750	968755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017562	CCG	2	6	968778	968783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_017562	A	6	6	968788	968793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017562	CCG	2	6	968809	968814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_017562	AAC	2	6	968851	968856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017562	ACT	2	6	970250	970255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017562	TGG	2	6	970294	970299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017562	ACC	2	6	970316	970321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_017562	CAG	2	6	970334	970339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017562	CCT	2	6	970375	970380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_017562	ATT	2	6	970409	970414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017562	CATT	2	8	970437	970444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5090	NC_017562	TAAA	2	8	970452	970459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017562	CAA	2	6	970468	970473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017562	ACA	2	6	970510	970515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017562	A	6	6	970528	970533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017562	GCA	2	6	970556	970561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017562	TCCT	2	8	970598	970605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_017562	CG	3	6	970650	970655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_017562	GCG	2	6	970753	970758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017562	GCAC	2	8	970785	970792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_017562	AGTAA	2	10	970808	970817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017562	AGC	2	6	970841	970846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017562	ACT	2	6	970851	970856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017562	CTC	2	6	970871	970876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_017562	CTC	2	6	970931	970936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_017562	TCATCC	2	12	971100	971111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017562	CAG	2	6	971116	971121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017562	TC	3	6	971159	971164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_017562	C	13	13	971192	971204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5108	NC_017562	GCA	2	6	971210	971215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017562	AAT	2	6	971323	971328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017562	AAC	2	6	971343	971348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017562	CAC	2	6	971412	971417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_017562	GACAC	2	10	971528	971537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5113	NC_017562	ACACT	2	10	971736	971745	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5114	NC_017562	AGC	2	6	971758	971763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017562	CAAT	2	8	973036	973043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_017562	ACTG	2	8	973057	973064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_017562	AGCA	2	8	973096	973103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_017562	A	7	7	974122	974128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017562	AGC	2	6	974238	974243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_017562	CA	3	6	974275	974280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_017562	TCG	2	6	977551	977556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017562	CCT	2	6	979961	979966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_017562	GCCA	2	8	980016	980023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_017562	CA	3	6	980022	980027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_017562	CAA	2	6	980038	980043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017562	CCA	2	6	980055	980060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_017562	CTAC	2	8	980073	980080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_017562	ACAG	2	8	980093	980100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_017562	CCT	2	6	980113	980118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_017562	A	7	7	980159	980165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017562	CA	3	6	980166	980171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_017562	CACC	2	8	980191	980198	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5133	NC_017562	ACC	2	6	980217	980222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_017562	CAA	2	6	980269	980274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_017562	AATC	2	8	980346	980353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5137	NC_017562	CAAT	2	8	982665	982672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5405	NC_017562	GCC	2	6	1026654	1026659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5406	NC_017562	C	6	6	1026658	1026663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5407	NC_017562	AC	4	8	1026664	1026671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5408	NC_017562	ACT	2	6	1026697	1026702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5409	NC_017562	AC	3	6	1026704	1026709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5410	NC_017562	TGA	2	6	1026735	1026740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5414	NC_017562	CCT	2	6	1026810	1026815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5418	NC_017562	CAT	2	6	1026976	1026981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5442	NC_017562	GCC	2	6	1029617	1029622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5452	NC_017562	CTG	2	6	1030033	1030038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5455	NC_017562	TCA	2	6	1030139	1030144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5500	NC_017562	TC	3	6	1036365	1036370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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