MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 16318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017271	CGG	2	6	388137	388142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017271	GTC	2	6	388561	388566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017271	GGCG	2	8	389161	389168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_017271	CTT	2	6	389213	389218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017271	CAC	2	6	389320	389325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_017271	TGC	2	6	389344	389349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017271	CG	3	6	389355	389360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_017271	CGA	2	6	389374	389379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_017271	TTTG	2	8	390608	390615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017271	TGGT	2	8	390623	390630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017271	TTGA	2	8	390632	390639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017271	GCG	2	6	390643	390648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017271	CCG	2	6	390650	390655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_017271	GAGT	2	8	390669	390676	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017271	TGC	2	6	390820	390825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017271	T	7	7	390857	390863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017271	GC	3	6	390879	390884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_017271	GC	3	6	390953	390958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_017271	AGC	2	6	391027	391032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017271	CGC	2	6	391258	391263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_017271	AGC	2	6	391284	391289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017271	GCC	2	6	392706	392711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_017271	GC	3	6	395549	395554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017271	CGC	2	6	395631	395636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017271	GCAA	2	8	395656	395663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_017271	TGA	2	6	396070	396075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017271	GC	3	6	398019	398024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017271	GC	4	8	398053	398060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017271	CG	3	6	398090	398095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_017271	CCTGC	2	10	398125	398134	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1531	NC_017271	ACT	2	6	399289	399294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017271	GCCT	2	8	399295	399302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_017271	GC	4	8	399304	399311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017271	GCCC	2	8	399344	399351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1535	NC_017271	CGG	2	6	399412	399417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_017271	GCC	2	6	399421	399426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_017271	CGG	2	6	402647	402652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_017271	GGCAA	2	10	402662	402671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_017271	GAC	2	6	402690	402695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017271	AGC	2	6	402906	402911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_017271	GCC	2	6	402930	402935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_017271	GGCG	2	8	402937	402944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_017271	TCC	2	6	402988	402993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_017271	CACC	2	8	403004	403011	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1545	NC_017271	GCT	2	6	403017	403022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_017271	TGC	2	6	404327	404332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017271	CCGG	2	8	404344	404351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_017271	GGGT	2	8	404404	404411	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017271	GCA	2	6	404417	404422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017271	TGC	2	6	404626	404631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017271	GC	3	6	404655	404660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_017271	TCGG	2	8	405898	405905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_017271	GC	3	6	405929	405934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_017271	GCT	2	6	405936	405941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017271	TGCA	2	8	405957	405964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_017271	TGCA	2	8	406604	406611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_017271	GC	4	8	406631	406638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_017271	GCG	2	6	407610	407615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_017271	TCT	2	6	407659	407664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_017271	CGG	2	6	407667	407672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017271	GCC	2	6	407682	407687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_017271	TGCG	2	8	409288	409295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017271	GAGG	2	8	409305	409312	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017271	TGGC	2	8	409324	409331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_017271	CG	3	6	409375	409380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_017271	CAT	2	6	409409	409414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017271	CG	3	6	409451	409456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_017271	TGCG	2	8	409487	409494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_017271	CGA	2	6	409530	409535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017271	GC	4	8	409542	409549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_017271	GCCG	2	8	409553	409560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_017271	GCG	2	6	410952	410957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017271	CGC	2	6	410963	410968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_017271	AAG	2	6	410983	410988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017271	GCT	2	6	411789	411794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1577	NC_017271	GCA	2	6	412947	412952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017271	CGG	2	6	412966	412971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_017271	CAG	2	6	412983	412988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017271	CGC	2	6	412999	413004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_017271	CGGC	2	8	413903	413910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_017271	CGT	2	6	413961	413966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_017271	GCC	2	6	413977	413982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_017271	GC	3	6	416001	416006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_017271	GC	3	6	416029	416034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_017271	AGG	2	6	416159	416164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017271	GGC	2	6	416997	417002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_017271	GCG	2	6	417010	417015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017271	GC	3	6	417043	417048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_017271	GCC	2	6	417113	417118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_017271	GCC	2	6	417129	417134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_017271	TGCGC	2	10	417136	417145	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1594	NC_017271	CAG	2	6	417865	417870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017271	GCA	2	6	418223	418228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017271	CGTG	2	8	418266	418273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_017271	GTC	2	6	419863	419868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017271	CGGT	2	8	419894	419901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_017271	CCG	2	6	420161	420166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_017271	GCA	2	6	420191	420196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017271	GGC	2	6	420266	420271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017271	GAG	2	6	420404	420409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017271	CGA	2	6	422263	422268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017271	CTG	2	6	422275	422280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_017271	CG	3	6	422302	422307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_017271	GGCG	2	8	423244	423251	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_017271	GAGTG	2	10	423253	423262	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017271	AAACGC	2	12	423326	423337	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017271	CGT	2	6	423354	423359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017271	GGC	3	9	423999	424007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017271	AGT	2	6	424037	424042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017271	GCT	2	6	424050	424055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017271	AAAC	2	8	424709	424716	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_017271	CAA	2	6	424745	424750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017271	ATC	2	6	424754	424759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_017271	GCG	2	6	424777	424782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017271	GCGCC	2	10	424816	424825	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1618	NC_017271	GA	3	6	425094	425099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017271	GCATG	2	10	425299	425308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1620	NC_017271	AGC	2	6	427338	427343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_017271	ACT	2	6	427351	427356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_017271	TCC	2	6	427420	427425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_017271	CACC	2	8	427436	427443	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1624	NC_017271	GAC	2	6	427445	427450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017271	GGC	2	6	427494	427499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_017271	CG	3	6	427508	427513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_017271	CGC	2	6	427515	427520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_017271	GCA	2	6	427521	427526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017271	ACA	2	6	427550	427555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_017271	GTT	3	9	427573	427581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017271	GC	3	6	427616	427621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_017271	GT	3	6	428508	428513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017271	CGC	2	6	428575	428580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_017271	CG	4	8	428584	428591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1636	NC_017271	TGG	2	6	431381	431386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1909	NC_017271	GCT	2	6	486041	486046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1913	NC_017271	AGT	2	6	486311	486316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_017271	CTT	2	6	486339	486344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_017271	TGCAG	2	10	489826	489835	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1927	NC_017271	TCG	2	6	500283	500288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1943	NC_017271	GCG	2	6	505231	505236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_017271	GC	3	6	505263	505268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1951	NC_017271	GTC	2	6	505397	505402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1972	NC_017271	TCC	2	6	512117	512122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1982	NC_017271	GCGCG	2	10	513846	513855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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