MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 16318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017271	GT	3	6	93443	93448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017271	GGA	2	6	93454	93459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017271	TCT	2	6	93530	93535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017271	GCA	2	6	94644	94649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017271	ATGCA	2	10	94653	94662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
506	NC_017271	ACG	2	6	94838	94843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017271	CA	4	8	95966	95973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017271	GCTT	2	8	95999	96006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_017271	ACG	2	6	96059	96064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017271	CTG	2	6	96845	96850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017271	GCA	2	6	96866	96871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017271	GC	3	6	96901	96906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017271	GC	3	6	96909	96914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017271	GCA	2	6	96977	96982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017271	ATAA	2	8	97017	97024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017271	GC	3	6	97030	97035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017271	GC	3	6	97065	97070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017271	GC	3	6	97073	97078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_017271	AGGC	2	8	97130	97137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017271	GCA	2	6	97141	97146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017271	GCA	2	6	97175	97180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017271	GC	3	6	97193	97198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017271	GC	3	6	97228	97233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_017271	GC	3	6	97236	97241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017271	CG	3	6	97269	97274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_017271	GTC	2	6	97467	97472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017271	CGT	2	6	97522	97527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017271	GCG	2	6	99124	99129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017271	GAT	2	6	99620	99625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017271	GC	3	6	99636	99641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017271	CGC	2	6	99655	99660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017271	CGC	2	6	99681	99686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017271	GAC	2	6	99729	99734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017271	GAC	2	6	99741	99746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017271	AGC	3	9	100589	100597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017271	CAC	2	6	100601	100606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_017271	ACGC	2	8	100643	100650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017271	GCT	2	6	100690	100695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017271	CAT	2	6	100708	100713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017271	CAC	2	6	100714	100719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_017271	CGC	2	6	101411	101416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017271	GAA	2	6	101429	101434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017271	CG	3	6	103308	103313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_017271	TGC	2	6	103320	103325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017271	ATC	2	6	103370	103375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017271	GGC	2	6	103376	103381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017271	GGAT	2	8	106855	106862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017271	GCG	2	6	106863	106868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017271	GC	3	6	106879	106884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017271	CATG	2	8	106902	106909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017271	CGC	3	9	106946	106954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017271	TCG	2	6	108896	108901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017271	GTG	2	6	108919	108924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017271	GTG	2	6	108928	108933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017271	CG	3	6	109035	109040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_017271	TGG	2	6	109061	109066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017271	CT	3	6	109119	109124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_017271	CG	3	6	109174	109179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_017271	GC	5	10	109925	109934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_017271	CG	3	6	113016	113021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017271	CG	3	6	113042	113047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_017271	CTGC	2	8	113165	113172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_017271	TGCG	2	8	113199	113206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_017271	CTG	2	6	113311	113316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017271	AG	3	6	113327	113332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017271	GCCC	2	8	113378	113385	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
567	NC_017271	CGC	2	6	113440	113445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017271	GGGC	2	8	113464	113471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
569	NC_017271	GTG	2	6	113499	113504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017271	GTT	2	6	113524	113529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017271	GCAAG	2	10	113557	113566	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
572	NC_017271	CAA	2	6	113587	113592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017271	TCG	2	6	113624	113629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017271	GGC	2	6	113645	113650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017271	GCG	2	6	113701	113706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017271	ACG	2	6	113751	113756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_017271	GCGAGC	2	12	115568	115579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017271	GTA	2	6	115587	115592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017271	CTG	2	6	115623	115628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017271	CAT	2	6	116234	116239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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585	NC_017271	GC	3	6	117539	117544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_017271	GC	3	6	117553	117558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017271	A	6	6	117568	117573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017271	GCG	2	6	117616	117621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017271	GGA	2	6	118843	118848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017271	GC	3	6	121145	121150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017271	GC	3	6	121165	121170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_017271	CG	3	6	121172	121177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_017271	CG	4	8	121207	121214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_017271	GT	3	6	121243	121248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017271	GCC	2	6	121254	121259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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597	NC_017271	TGCA	2	8	121701	121708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_017271	CG	4	8	121731	121738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017271	CCG	2	6	121991	121996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017271	CGCA	2	8	122543	122550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
601	NC_017271	ATG	2	6	122651	122656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017271	CG	3	6	122674	122679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_017271	C	6	6	122723	122728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
604	NC_017271	TGC	2	6	124312	124317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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606	NC_017271	GAGC	2	8	124415	124422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_017271	GA	4	8	124427	124434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017271	TTG	2	6	124867	124872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017271	GC	3	6	124887	124892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_017271	A	8	8	124941	124948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017271	GCGCTC	2	12	125003	125014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
612	NC_017271	GC	3	6	125051	125056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_017271	GC	3	6	125059	125064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_017271	CGC	2	6	125078	125083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017271	CGCA	2	8	125108	125115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
616	NC_017271	CG	3	6	125122	125127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_017271	CAG	2	6	125304	125309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017271	CGG	2	6	125335	125340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017271	CTG	2	6	125406	125411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017271	GCCG	2	8	126838	126845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017271	CGC	2	6	126850	126855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_017271	GTG	2	6	126884	126889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017271	GCAT	2	8	129806	129813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_017271	GCA	2	6	129872	129877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017271	GC	3	6	129892	129897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017271	CG	4	8	129899	129906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017271	CG	3	6	129933	129938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017271	GC	3	6	129942	129947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_017271	TCGGC	2	10	130007	130016	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
630	NC_017271	ATTC	2	8	130048	130055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017271	GC	3	6	130076	130081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_017271	CG	4	8	130083	130090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017271	CG	3	6	130117	130122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017271	GC	3	6	130126	130131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017271	ACG	2	6	130136	130141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017271	TCGGC	2	10	130191	130200	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
637	NC_017271	GC	7	14	130259	130272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_017271	CG	3	6	130300	130305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_017271	GC	3	6	130309	130314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_017271	GCT	2	6	130332	130337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017271	TCGGC	2	10	130374	130383	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
642	NC_017271	GC	3	6	130444	130449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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774	NC_017271	CTGAG	2	10	163774	163783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
775	NC_017271	CT	3	6	163791	163796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
776	NC_017271	CTG	2	6	163809	163814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_017271	A	6	6	167712	167717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
779	NC_017271	AT	3	6	167762	167767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
780	NC_017271	CACC	2	8	167774	167781	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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922	NC_017271	GC	3	6	204483	204488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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