MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 15871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017267	CTT	2	6	212136	212141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017267	CCT	2	6	212157	212162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_017267	CGG	2	6	212180	212185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017267	TC	3	6	212260	212265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017267	GCCT	2	8	212301	212308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_017267	CG	3	6	212364	212369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_017267	TCGC	2	8	213654	213661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_017267	GCT	2	6	213688	213693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017267	AGC	2	6	216241	216246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017267	GGCG	2	8	216273	216280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017267	CGG	2	6	217763	217768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017267	ATG	2	6	217847	217852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017267	GCTA	2	8	217857	217864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_017267	GCG	2	6	217897	217902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017267	ACC	2	6	218001	218006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_017267	GGC	2	6	218049	218054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017267	TG	3	6	218138	218143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017267	AGGA	2	8	218153	218160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017267	GGC	2	6	218316	218321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017267	GCA	2	6	218347	218352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017267	GGA	2	6	218480	218485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017267	CG	3	6	218497	218502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_017267	CCA	2	6	218548	218553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_017267	CGA	2	6	218557	218562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017267	GAT	2	6	218582	218587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017267	GCA	2	6	218631	218636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017267	GAA	2	6	218690	218695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017267	GAAA	2	8	218726	218733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017267	CAG	2	6	218799	218804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017267	GCGT	2	8	218855	218862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017267	GGT	3	9	218864	218872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017267	TGT	2	6	218880	218885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017267	GGA	2	6	218990	218995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017267	GGC	2	6	219010	219015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017267	ACACTG	2	12	219027	219038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017267	CGC	2	6	219158	219163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017267	GAA	2	6	219254	219259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017267	TGC	2	6	219330	219335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017267	GTC	2	6	219342	219347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017267	TCGTG	2	10	219351	219360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_017267	TGG	2	6	219420	219425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017267	CCG	2	6	219440	219445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017267	GGA	2	6	219456	219461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017267	TCA	2	6	219481	219486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017267	AC	3	6	219507	219512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_017267	TAC	2	6	219514	219519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017267	TGG	2	6	219522	219527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017267	TGC	2	6	219647	219652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017267	AC	3	6	219677	219682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017267	TTG	2	6	219704	219709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017267	CCT	2	6	219818	219823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017267	GTC	2	6	219964	219969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017267	CCA	2	6	219989	219994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017267	GGT	2	6	220028	220033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017267	CAC	2	6	220086	220091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_017267	AGCG	2	8	220170	220177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_017267	ATCT	2	8	220186	220193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_017267	AAT	2	6	220235	220240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017267	TGG	2	6	220259	220264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017267	CA	3	6	220275	220280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_017267	CAA	2	6	220407	220412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017267	GCT	2	6	220480	220485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017267	GGA	2	6	220523	220528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017267	AGT	2	6	220553	220558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017267	AGC	2	6	220574	220579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017267	G	6	6	220709	220714	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017267	TCC	2	6	220719	220724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_017267	GACC	2	8	220741	220748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_017267	TAC	2	6	221147	221152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017267	GTAC	2	8	221223	221230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_017267	AC	3	6	221241	221246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_017267	CGTC	2	8	221259	221266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017267	AAC	2	6	221278	221283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017267	AGG	2	6	221352	221357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017267	AGC	2	6	221368	221373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017267	AAAG	2	8	221382	221389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017267	CTG	2	6	221532	221537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017267	GTTG	2	8	221755	221762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017267	ACCGT	2	10	221898	221907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_017267	GA	3	6	221949	221954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017267	TGG	2	6	222015	222020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017267	CGG	2	6	222200	222205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017267	GCG	2	6	222282	222287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017267	TGAAAT	2	12	222309	222320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017267	ACC	2	6	222471	222476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_017267	TGG	2	6	222531	222536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017267	TCC	2	6	222557	222562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_017267	GGA	2	6	222574	222579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017267	TG	3	6	222618	222623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017267	GGT	2	6	222694	222699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017267	CGG	2	6	222781	222786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017267	TCA	2	6	222809	222814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017267	CGT	2	6	222889	222894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017267	GCT	2	6	222943	222948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017267	GC	3	6	223064	223069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_017267	GT	3	6	223140	223145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017267	AACG	2	8	223225	223232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_017267	ATC	2	6	223240	223245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017267	TG	4	8	223320	223327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017267	ACC	2	6	223397	223402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_017267	ATCCC	2	10	223405	223414	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1102	NC_017267	TCT	2	6	223528	223533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017267	TGC	2	6	223568	223573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017267	TCG	2	6	223575	223580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017267	C	6	6	223600	223605	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1106	NC_017267	TGA	2	6	223640	223645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017267	CTG	2	6	223662	223667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017267	GCC	2	6	223675	223680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_017267	CCG	2	6	223690	223695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017267	T	7	7	223700	223706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017267	GC	3	6	223752	223757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017267	GCA	2	6	223760	223765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017267	TCG	2	6	223795	223800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_017267	GCCG	2	8	223805	223812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017267	ATC	2	6	223939	223944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017267	TG	3	6	223961	223966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017267	CGT	2	6	224045	224050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017267	CGG	2	6	224084	224089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017267	TGG	2	6	224132	224137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017267	GCA	2	6	224141	224146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017267	GCG	3	9	224184	224192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017267	GCT	3	9	224201	224209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017267	CG	3	6	224239	224244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_017267	ACG	2	6	224336	224341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017267	GC	3	6	224347	224352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_017267	T	8	8	224359	224366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017267	CTT	2	6	224416	224421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017267	GCC	2	6	224479	224484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_017267	TGC	2	6	224490	224495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017267	GTA	2	6	224503	224508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017267	GAT	2	6	224578	224583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017267	CTT	2	6	224602	224607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_017267	G	6	6	224667	224672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017267	T	6	6	224699	224704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_017267	GCT	2	6	251674	251679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_017267	CCA	2	6	251683	251688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1271	NC_017267	GCA	2	6	251705	251710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_017267	CGG	2	6	251713	251718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_017267	GAT	2	6	252646	252651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_017267	GCAG	2	8	253291	253298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1275	NC_017267	GC	3	6	253322	253327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1277	NC_017267	TCGT	2	8	253407	253414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1278	NC_017267	CAGC	2	8	253439	253446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1287	NC_017267	CGT	2	6	255968	255973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_017267	CCG	2	6	256019	256024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1292	NC_017267	ACC	2	6	256124	256129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1304	NC_017267	GCG	2	6	257375	257380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1329	NC_017267	CTG	2	6	266477	266482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1335	NC_017267	TTGCG	2	10	275514	275523	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1385	NC_017267	CGC	2	6	290921	290926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1388	NC_017267	GC	3	6	290996	291001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1389	NC_017267	CTG	2	6	291038	291043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1390	NC_017267	TGAC	2	8	291091	291098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1391	NC_017267	CCG	2	6	291100	291105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1392	NC_017267	GGC	2	6	291106	291111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1393	NC_017267	CCA	2	6	291132	291137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1394	NC_017267	CCA	2	6	291493	291498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1396	NC_017267	CCGG	2	8	292999	293006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1397	NC_017267	AAC	2	6	293053	293058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1398	NC_017267	CGC	2	6	293131	293136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1399	NC_017267	TGT	2	6	293150	293155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_017267	TACG	2	8	293157	293164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1401	NC_017267	TCC	3	9	293229	293237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1402	NC_017267	CG	3	6	295790	295795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1403	NC_017267	GC	3	6	295849	295854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1404	NC_017267	CCGCG	2	10	295867	295876	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1405	NC_017267	GCTGGG	3	18	295885	295902	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1407	NC_017267	GC	3	6	295967	295972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1444	NC_017267	CGG	2	6	302816	302821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_017267	CTG	2	6	303133	303138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1461	NC_017267	GC	3	6	310803	310808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1462	NC_017267	GCG	2	6	310883	310888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1463	NC_017267	GC	3	6	311467	311472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1464	NC_017267	GC	3	6	311925	311930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1465	NC_017267	CCCG	2	8	311963	311970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1480	NC_017267	TTG	2	6	315337	315342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1482	NC_017267	CA	4	8	317105	317112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1483	NC_017267	GCT	2	6	320000	320005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1489	NC_017267	TCC	2	6	320886	320891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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