MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 15871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017267	G	6	6	99099	99104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017267	GTTG	2	8	99160	99167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017267	GC	3	6	99220	99225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_017267	CGTC	2	8	99293	99300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_017267	GC	4	8	99362	99369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017267	GC	4	8	99380	99387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_017267	CTG	2	6	99478	99483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017267	CGA	2	6	99484	99489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017267	A	6	6	99507	99512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017267	TA	3	6	100181	100186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017267	GCA	2	6	102597	102602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017267	GGC	2	6	102622	102627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017267	GTG	2	6	102688	102693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017267	CGG	2	6	106308	106313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017267	GGC	2	6	106319	106324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017267	GCC	2	6	106337	106342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017267	GGA	2	6	106396	106401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017267	TCG	2	6	106422	106427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017267	GGTC	2	8	106432	106439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017267	GCT	2	6	106452	106457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017267	TCGC	2	8	106500	106507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
522	NC_017267	GC	3	6	110205	110210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017267	GTT	2	6	110218	110223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017267	TGC	2	6	110224	110229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017267	GGC	2	6	110236	110241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017267	AAC	2	6	110243	110248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017267	GCC	2	6	110263	110268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_017267	GC	3	6	110312	110317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017267	CGT	2	6	110366	110371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017267	AC	3	6	111509	111514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017267	GTGA	2	8	117199	117206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017267	T	6	6	117238	117243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017267	GC	3	6	117279	117284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017267	AGC	2	6	117445	117450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017267	AAG	2	6	117522	117527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017267	ACG	2	6	117540	117545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017267	ACA	2	6	117563	117568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017267	GTA	2	6	117601	117606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017267	CG	3	6	118368	118373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
540	NC_017267	CGC	2	6	118412	118417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_017267	CGA	2	6	118496	118501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017267	CGACG	2	10	118571	118580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
543	NC_017267	CGCC	2	8	118685	118692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
544	NC_017267	GCG	2	6	119142	119147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017267	GCG	2	6	119212	119217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017267	TCG	2	6	119224	119229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017267	CGC	2	6	119247	119252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017267	GGT	2	6	119318	119323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017267	CAG	2	6	119355	119360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017267	AGC	2	6	121040	121045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017267	GC	3	6	121075	121080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_017267	GCG	2	6	121127	121132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017267	GCG	2	6	121198	121203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017267	CGG	4	12	121840	121851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017267	CGG	2	6	121880	121885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017267	GTT	2	6	123749	123754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017267	TGC	2	6	123878	123883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017267	GCG	2	6	123953	123958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017267	GC	3	6	123962	123967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_017267	GC	3	6	123973	123978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017267	GAG	2	6	124006	124011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017267	CGC	2	6	124074	124079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017267	CTG	2	6	124831	124836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017267	GC	3	6	124921	124926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017267	GCG	2	6	124948	124953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017267	CAG	2	6	125011	125016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017267	CTT	2	6	125023	125028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017267	GC	3	6	125029	125034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017267	GGT	2	6	125086	125091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017267	ACC	2	6	125249	125254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017267	GAA	2	6	125263	125268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017267	AGC	2	6	125341	125346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017267	TGG	3	9	125390	125398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017267	CGAA	2	8	125499	125506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_017267	CGG	2	6	125531	125536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017267	G	6	6	125652	125657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017267	ACT	2	6	125670	125675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017267	ATC	2	6	125683	125688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017267	G	7	7	125706	125712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017267	GCG	2	6	125718	125723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017267	GGC	2	6	125727	125732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017267	CTT	2	6	125776	125781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017267	TGGT	2	8	125790	125797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017267	CTGC	2	8	125838	125845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017267	GGCG	2	8	125947	125954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017267	CATC	2	8	125976	125983	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017267	AGT	2	6	126074	126079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017267	TGG	2	6	126175	126180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017267	AAT	2	6	126199	126204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017267	GATC	2	8	126303	126310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_017267	GCA	2	6	126314	126319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017267	GTA	2	6	126335	126340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017267	TGC	3	9	126359	126367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017267	GAA	2	6	126422	126427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017267	AGA	2	6	126432	126437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017267	ATT	2	6	126479	126484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017267	A	6	6	129158	129163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017267	GC	3	6	129206	129211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_017267	A	6	6	129237	129242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017267	GCA	2	6	129253	129258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017267	GCG	2	6	129279	129284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017267	GTGCA	2	10	129296	129305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
603	NC_017267	CGT	2	6	129387	129392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017267	CGT	2	6	129411	129416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017267	CTTGG	2	10	129425	129434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
606	NC_017267	TCACAT	2	12	129508	129519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017267	GCA	2	6	129523	129528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017267	CG	3	6	129532	129537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017267	CGT	2	6	129568	129573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017267	GC	4	8	129593	129600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_017267	TGCA	2	8	129616	129623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017267	CCTTGC	2	12	129670	129681	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
613	NC_017267	TTTG	2	8	129721	129728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017267	GCT	2	6	129739	129744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017267	AGC	2	6	129788	129793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017267	CAA	2	6	130824	130829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017267	GC	3	6	130837	130842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_017267	CTG	2	6	130881	130886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017267	GC	3	6	130971	130976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017267	GCG	2	6	130998	131003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017267	CAG	2	6	131061	131066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017267	CTT	2	6	131073	131078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017267	GC	3	6	131079	131084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_017267	GGT	2	6	131136	131141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017267	ACC	2	6	131299	131304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_017267	GAA	2	6	131313	131318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017267	AGC	2	6	131392	131397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017267	TGG	3	9	131441	131449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017267	CGAA	2	8	131550	131557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_017267	CGG	2	6	131582	131587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017267	CAA	2	6	131945	131950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017267	TCA	2	6	131973	131978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017267	GCG	2	6	131991	131996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017267	TCC	2	6	132012	132017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_017267	ACG	2	6	133727	133732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_017267	GCG	2	6	138333	138338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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