MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 15871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017267	GCC	2	6	1498840	1498845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_017267	CAG	2	6	1498888	1498893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017267	CAA	2	6	1498951	1498956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017267	CAT	2	6	1499948	1499953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017267	ACG	3	9	1499977	1499985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017267	GCC	2	6	1500402	1500407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_017267	TGG	2	6	1500413	1500418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017267	CGGC	2	8	1500492	1500499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_017267	CAG	2	6	1501215	1501220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017267	AGC	2	6	1501223	1501228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_017267	GCG	2	6	1501256	1501261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017267	AAC	2	6	1501262	1501267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_017267	AGC	2	6	1501276	1501281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_017267	GC	3	6	1501301	1501306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_017267	CGCC	2	8	1501356	1501363	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5516	NC_017267	TGAA	2	8	1501412	1501419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017267	GCACT	2	10	1501424	1501433	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5518	NC_017267	TGCC	2	8	1501467	1501474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_017267	GGC	2	6	1501497	1501502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_017267	GGAC	2	8	1501528	1501535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_017267	TGC	2	6	1501546	1501551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_017267	TGG	2	6	1501554	1501559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017267	CAG	2	6	1501716	1501721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017267	CACT	2	8	1501724	1501731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_017267	CCAC	2	8	1504074	1504081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5526	NC_017267	CGT	2	6	1504177	1504182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_017267	GCC	2	6	1504222	1504227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_017267	CAT	2	6	1504234	1504239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017267	ACG	2	6	1505144	1505149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_017267	GC	3	6	1505156	1505161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_017267	GCA	2	6	1505227	1505232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_017267	CGC	2	6	1505250	1505255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_017267	GCCGG	2	10	1505276	1505285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5534	NC_017267	GCG	2	6	1505615	1505620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017267	CG	3	6	1505629	1505634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_017267	GC	3	6	1505642	1505647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_017267	CGC	3	9	1505645	1505653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_017267	CCG	2	6	1508635	1508640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_017267	GGC	2	6	1508641	1508646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_017267	CGT	2	6	1510136	1510141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_017267	CAC	2	6	1510176	1510181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_017267	CCG	2	6	1510184	1510189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_017267	CGG	2	6	1510196	1510201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_017267	T	6	6	1510232	1510237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017267	CTC	2	6	1510247	1510252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_017267	TGG	2	6	1510290	1510295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017267	TGC	3	9	1510303	1510311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_017267	TTC	2	6	1510395	1510400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017267	AGC	2	6	1510429	1510434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_017267	CGACA	2	10	1510438	1510447	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5551	NC_017267	CCTG	2	8	1510455	1510462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_017267	GCAA	2	8	1510478	1510485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_017267	CGT	2	6	1511079	1511084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017267	CCG	2	6	1511127	1511132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_017267	CGG	2	6	1511139	1511144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017267	T	6	6	1511175	1511180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017267	CTC	2	6	1511190	1511195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_017267	TGG	2	6	1511233	1511238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017267	TGG	2	6	1511242	1511247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017267	TGC	3	9	1511255	1511263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_017267	TTC	2	6	1511347	1511352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_017267	AGC	2	6	1511381	1511386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017267	CGACA	2	10	1511390	1511399	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5564	NC_017267	CCTG	2	8	1511407	1511414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_017267	GCAA	2	8	1511430	1511437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_017267	TGC	3	9	1511482	1511490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_017267	TGC	2	6	1511500	1511505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017267	GGA	2	6	1511628	1511633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017267	CGG	4	12	1511648	1511659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_017267	TTG	2	6	1511707	1511712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017267	GAC	2	6	1511726	1511731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_017267	A	6	6	1511776	1511781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017267	ATC	2	6	1511859	1511864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5575	NC_017267	CCG	2	6	1511919	1511924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_017267	CCA	2	6	1511931	1511936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_017267	GC	3	6	1511962	1511967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_017267	GCA	2	6	1512027	1512032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_017267	GCA	2	6	1516091	1516096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_017267	CCT	2	6	1516112	1516117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_017267	ACG	2	6	1517000	1517005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_017267	AC	3	6	1517006	1517011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_017267	CGG	2	6	1517044	1517049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_017267	AC	3	6	1517051	1517056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_017267	CG	3	6	1517110	1517115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_017267	GTG	2	6	1517208	1517213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017267	ATT	2	6	1517218	1517223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017267	GGT	2	6	1517310	1517315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_017267	CTG	2	6	1517321	1517326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_017267	CGC	2	6	1517346	1517351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_017267	TTC	2	6	1517368	1517373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_017267	AAC	2	6	1517413	1517418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_017267	ACG	2	6	1517484	1517489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017267	CAC	2	6	1517506	1517511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_017267	TAA	2	6	1517521	1517526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017267	AAG	2	6	1517557	1517562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017267	GA	3	6	1517589	1517594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_017267	TAAA	2	8	1517620	1517627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017267	GAT	2	6	1517635	1517640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017267	GGC	2	6	1517719	1517724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_017267	CCTG	2	8	1517725	1517732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_017267	T	6	6	1517767	1517772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017267	ATC	2	6	1517786	1517791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017267	AAC	2	6	1517794	1517799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_017267	CTA	2	6	1517880	1517885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5607	NC_017267	TGA	2	6	1517955	1517960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017267	CTC	2	6	1517989	1517994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_017267	CAT	2	6	1518017	1518022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_017267	CAAC	2	8	1518514	1518521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_017267	CAC	2	6	1518523	1518528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_017267	CAAC	2	8	1519301	1519308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_017267	CAC	2	6	1519310	1519315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_017267	ATG	2	6	1519341	1519346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017267	TGCC	2	8	1519394	1519401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_017267	GGC	2	6	1519406	1519411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017267	GCC	2	6	1519451	1519456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_017267	CTG	2	6	1519462	1519467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_017267	GGT	3	9	1519557	1519565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017267	TGC	2	6	1519578	1519583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017267	ACA	2	6	1519635	1519640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_017267	CGG	2	6	1519655	1519660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017267	GTC	2	6	1519692	1519697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_017267	CAAC	2	8	1520091	1520098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_017267	CAC	2	6	1520100	1520105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_017267	CGTCGC	2	12	1523184	1523195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_017267	GTG	2	6	1523198	1523203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_017267	GCT	2	6	1523227	1523232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_017267	CAG	2	6	1523263	1523268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5635	NC_017267	GTC	2	6	1524261	1524266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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