MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 chromosome

Total Repeats: 15806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016010	AGC	2	6	997349	997354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_016010	CGC	2	6	997378	997383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_016010	GCG	2	6	997401	997406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016010	GCC	2	6	997412	997417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_016010	CCGCG	2	10	997440	997449	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3506	NC_016010	GGC	2	6	997495	997500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_016010	GCTG	2	8	997504	997511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_016010	GCAT	2	8	998502	998509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_016010	CGTGC	2	10	998515	998524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3510	NC_016010	CGC	2	6	998566	998571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_016010	GTC	2	6	998607	998612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_016010	CGTG	2	8	998632	998639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_016010	TGC	2	6	998736	998741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_016010	GAC	2	6	998771	998776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_016010	GCC	3	9	998803	998811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_016010	AGC	2	6	998822	998827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_016010	CGCC	2	8	998830	998837	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3518	NC_016010	CTGT	2	8	998852	998859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_016010	GC	3	6	1000609	1000614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_016010	GCG	2	6	1000675	1000680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_016010	GGC	2	6	1000682	1000687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_016010	GTC	2	6	1000760	1000765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_016010	GGC	2	6	1000798	1000803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_016010	GCA	2	6	1000847	1000852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_016010	GTT	2	6	1000897	1000902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016010	CG	3	6	1000911	1000916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_016010	GC	3	6	1000922	1000927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_016010	TGC	2	6	1000929	1000934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_016010	TGGC	2	8	1000962	1000969	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_016010	CCT	2	6	1001013	1001018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_016010	CGA	2	6	1001929	1001934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_016010	GCTC	2	8	1005069	1005076	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_016010	TTG	2	6	1005118	1005123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016010	GCT	2	6	1005126	1005131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_016010	ATCA	2	8	1005169	1005176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_016010	GCG	2	6	1005708	1005713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_016010	CAG	2	6	1005768	1005773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_016010	GTC	2	6	1006480	1006485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_016010	GTGC	2	8	1006558	1006565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_016010	T	6	6	1006607	1006612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_016010	GTG	2	6	1006647	1006652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016010	GC	3	6	1006702	1006707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_016010	CG	3	6	1006718	1006723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_016010	CGTT	2	8	1006753	1006760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_016010	CAT	2	6	1006765	1006770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_016010	GC	4	8	1007479	1007486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_016010	CG	3	6	1007563	1007568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_016010	TCT	2	6	1007570	1007575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_016010	GGC	2	6	1007600	1007605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_016010	TC	3	6	1008768	1008773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_016010	GC	3	6	1008803	1008808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_016010	AGC	2	6	1009291	1009296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016010	CGG	2	6	1009316	1009321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_016010	ATGG	2	8	1009335	1009342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016010	GCC	2	6	1009365	1009370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_016010	GGA	2	6	1009424	1009429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016010	CGC	2	6	1009479	1009484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_016010	CAAG	2	8	1009496	1009503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_016010	GCG	2	6	1009592	1009597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_016010	ACAA	2	8	1009625	1009632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_016010	CA	3	6	1009650	1009655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_016010	CG	3	6	1009672	1009677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_016010	GCA	2	6	1010723	1010728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_016010	CGCTG	2	10	1012444	1012453	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3565	NC_016010	GAAG	2	8	1012468	1012475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_016010	GGC	3	9	1012515	1012523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_016010	ATAG	2	8	1013250	1013257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016010	CG	3	6	1014252	1014257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_016010	CG	3	6	1014273	1014278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_016010	GC	3	6	1014308	1014313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_016010	GCA	2	6	1014394	1014399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_016010	GC	3	6	1015476	1015481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_016010	GC	3	6	1015484	1015489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_016010	CG	3	6	1015517	1015522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_016010	GC	3	6	1015526	1015531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_016010	CGC	2	6	1018530	1018535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_016010	GCC	2	6	1018558	1018563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_016010	CACC	2	8	1018585	1018592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3579	NC_016010	GTG	2	6	1018683	1018688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016010	GGA	2	6	1018710	1018715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_016010	GGC	2	6	1018859	1018864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_016010	T	6	6	1019007	1019012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016010	CG	4	8	1021468	1021475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_016010	CGT	2	6	1021485	1021490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_016010	CCG	2	6	1021499	1021504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_016010	CGC	2	6	1021531	1021536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_016010	GTGC	2	8	1022678	1022685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_016010	GCA	2	6	1022698	1022703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_016010	CGT	2	6	1022721	1022726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_016010	TGCG	2	8	1022877	1022884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_016010	AC	4	8	1022887	1022894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_016010	CG	5	10	1022904	1022913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_016010	TGC	2	6	1022956	1022961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_016010	GCG	2	6	1023014	1023019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_016010	GCT	2	6	1023038	1023043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_016010	ACG	2	6	1026888	1026893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_016010	GC	4	8	1027378	1027385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_016010	ACGC	2	8	1027397	1027404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_016010	CGT	2	6	1027437	1027442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_016010	CGG	3	9	1027462	1027470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_016010	CGT	2	6	1027474	1027479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_016010	GC	3	6	1027502	1027507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_016010	CGCC	2	8	1028129	1028136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3604	NC_016010	GT	3	6	1029268	1029273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016010	TTTG	2	8	1029289	1029296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_016010	CGG	2	6	1029516	1029521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_016010	GCAGGC	2	12	1031379	1031390	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_016010	GGCC	2	8	1031489	1031496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_016010	CGC	2	6	1031501	1031506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_016010	CGA	2	6	1032957	1032962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_016010	CCG	2	6	1033088	1033093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_016010	GCC	2	6	1033100	1033105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_016010	GCTG	2	8	1033109	1033116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_016010	AGCC	2	8	1033175	1033182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_016010	TGCA	2	8	1033203	1033210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_016010	GCGCA	2	10	1033226	1033235	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3617	NC_016010	GGGA	2	8	1033276	1033283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_016010	GTG	2	6	1034989	1034994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016010	CGGCG	2	10	1034996	1035005	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3620	NC_016010	TGCCG	2	10	1035010	1035019	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3621	NC_016010	GTG	2	6	1035050	1035055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016010	GC	3	6	1035166	1035171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_016010	GGCGCA	2	12	1036319	1036330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_016010	CCGCT	2	10	1036520	1036529	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3625	NC_016010	TTGAC	2	10	1036582	1036591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3626	NC_016010	TTCCC	2	10	1036641	1036650	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3627	NC_016010	GCC	2	6	1037887	1037892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_016010	CGC	2	6	1037897	1037902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_016010	GC	3	6	1037928	1037933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_016010	GCCG	2	8	1037970	1037977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_016010	GAT	2	6	1037990	1037995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_016010	ACC	2	6	1038036	1038041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3633	NC_016010	GCC	2	6	1039051	1039056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3764	NC_016010	CGA	2	6	1091145	1091150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3766	NC_016010	GCT	2	6	1091793	1091798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3772	NC_016010	TGC	2	6	1091926	1091931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3793	NC_016010	CGGG	3	12	1101626	1101637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3794	NC_016010	CGGC	2	8	1101664	1101671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3795	NC_016010	GCC	2	6	1102243	1102248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3796	NC_016010	CG	3	6	1102272	1102277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3880	NC_016010	A	6	6	1123762	1123767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3881	NC_016010	GCC	2	6	1123789	1123794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3882	NC_016010	CTG	2	6	1125919	1125924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3890	NC_016010	CG	3	6	1129172	1129177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3891	NC_016010	GCGT	2	8	1129198	1129205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3892	NC_016010	GCGCAA	2	12	1129207	1129218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3893	NC_016010	CT	3	6	1129236	1129241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3894	NC_016010	GTC	2	6	1130556	1130561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3895	NC_016010	CGC	2	6	1130584	1130589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3896	NC_016010	CGC	2	6	1130602	1130607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3897	NC_016010	TGG	2	6	1130665	1130670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3898	NC_016010	GCCG	2	8	1131697	1131704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3899	NC_016010	GCC	2	6	1131717	1131722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3900	NC_016010	ACTGC	2	10	1131746	1131755	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3901	NC_016010	CGG	2	6	1131756	1131761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3902	NC_016010	CTGC	2	8	1131781	1131788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3903	NC_016010	GC	3	6	1131792	1131797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3904	NC_016010	GCT	2	6	1131803	1131808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3905	NC_016010	GGAGG	2	10	1131834	1131843	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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3907	NC_016010	GC	5	10	1131875	1131884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3908	NC_016010	GGC	2	6	1134160	1134165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3909	NC_016010	CGG	2	6	1134200	1134205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3911	NC_016010	GC	3	6	1134250	1134255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3912	NC_016010	GC	3	6	1134313	1134318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3913	NC_016010	TGCG	2	8	1135230	1135237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3914	NC_016010	CA	3	6	1135254	1135259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3915	NC_016010	CGC	2	6	1135260	1135265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3916	NC_016010	CGT	2	6	1135297	1135302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3917	NC_016010	CATG	2	8	1135336	1135343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3918	NC_016010	CCGACG	2	12	1135370	1135381	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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3920	NC_016010	GCT	2	6	1135573	1135578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3923	NC_016010	GCCCG	2	10	1136997	1137006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3926	NC_016010	TGCGG	2	10	1137531	1137540	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3928	NC_016010	TGC	2	6	1137564	1137569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3930	NC_016010	TGC	2	6	1137646	1137651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3931	NC_016010	GC	3	6	1137650	1137655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3932	NC_016010	CAG	2	6	1137664	1137669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3934	NC_016010	GCGGG	2	10	1138479	1138488	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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3937	NC_016010	GA	3	6	1138680	1138685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3938	NC_016010	G	6	6	1138691	1138696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3939	NC_016010	TGC	2	6	1138735	1138740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3942	NC_016010	GCC	2	6	1138940	1138945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3945	NC_016010	GCGG	2	8	1142464	1142471	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3946	NC_016010	ATCG	2	8	1144648	1144655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3952	NC_016010	TCG	2	6	1146914	1146919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3955	NC_016010	GGC	2	6	1146979	1146984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3958	NC_016010	TCG	2	6	1148733	1148738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3989	NC_016010	GCC	2	6	1154365	1154370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3990	NC_016010	CGG	2	6	1154394	1154399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3992	NC_016010	CGGG	2	8	1156524	1156531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3993	NC_016010	TCC	2	6	1156539	1156544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3994	NC_016010	GCC	2	6	1157905	1157910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3995	NC_016010	GGCCTC	2	12	1157917	1157928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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3997	NC_016010	TTC	2	6	1160659	1160664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_016010	CACC	2	8	1161076	1161083	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3999	NC_016010	TCCGC	2	10	1161178	1161187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4000	NC_016010	AGCGG	2	10	1161281	1161290	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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