MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	TTGCT	2	10	9354	9363	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013892	AATTC	2	10	11252	11261	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013892	AAAAT	2	10	33627	33636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013892	TTAAA	2	10	37118	37127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013892	AGTTA	2	10	50469	50478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013892	CCGAG	2	10	53506	53515	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013892	CCACC	2	10	54896	54905	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_013892	GGAAA	2	10	59325	59334	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013892	CCCGC	2	10	66465	66474	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_013892	TGAGA	2	10	77801	77810	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013892	GTATA	2	10	83543	83552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013892	CCAAA	2	10	83830	83839	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013892	ATTTT	2	10	84024	84033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013892	TCATT	2	10	95476	95485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013892	AAAAT	2	10	97219	97228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013892	AATCA	2	10	99391	99400	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013892	TGTTT	2	10	108226	108235	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013892	ACTTT	2	10	109692	109701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013892	TAAAT	2	10	109766	109775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013892	GGATA	2	10	129885	129894	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013892	TTGCA	2	10	132227	132236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013892	TAAAT	2	10	132898	132907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013892	ATTTG	2	10	138746	138755	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013892	TATCT	2	10	140058	140067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013892	ATTAG	2	10	144350	144359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013892	ATTAT	2	10	147664	147673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013892	AATAT	2	10	149157	149166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013892	TCTAT	2	10	155547	155556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013892	ATGAA	2	10	161286	161295	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013892	TAATA	2	10	193524	193533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013892	TAAAA	2	10	193607	193616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013892	GATAG	2	10	196384	196393	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013892	GCGTT	2	10	201347	201356	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013892	TTAAT	2	10	210549	210558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013892	GTTGC	2	10	221120	221129	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013892	GCGTT	2	10	222119	222128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013892	GATTT	2	10	229912	229921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013892	GATGT	2	10	242820	242829	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013892	GATAT	2	10	255081	255090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013892	ATTTT	2	10	268000	268009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013892	TTTAA	2	10	268201	268210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013892	GGATA	2	10	269865	269874	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013892	GATTA	2	10	300192	300201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013892	GGAAA	2	10	307184	307193	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013892	ATGTC	2	10	320024	320033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013892	TTTTA	2	10	324965	324974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013892	GTTAT	2	10	326300	326309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013892	ACGAA	2	10	335606	335615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013892	TTACG	2	10	345086	345095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013892	ATTAA	2	10	354660	354669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013892	GAAGA	2	10	357899	357908	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013892	TTTCC	2	10	358004	358013	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013892	AATAA	2	10	358169	358178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013892	AAAAT	2	10	359776	359785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013892	AATCG	2	10	362524	362533	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013892	ATAAA	2	10	390950	390959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013892	TTTAA	2	10	403692	403701	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013892	GTAAA	2	10	403791	403800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013892	AACTA	2	10	410333	410342	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013892	ATGGA	2	10	411344	411353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013892	ATTTT	2	10	412446	412455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013892	ATTTT	2	10	433811	433820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013892	ATTTT	2	10	433841	433850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013892	GAACA	2	10	434286	434295	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013892	GAAAT	2	10	434655	434664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013892	TGTTA	2	10	450890	450899	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013892	GATTA	2	10	464257	464266	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013892	TTGTG	2	10	469226	469235	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013892	AATAA	2	10	478298	478307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013892	GCTTT	2	10	485741	485750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013892	ATTTA	2	10	492868	492877	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013892	CGCTC	2	10	494492	494501	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_013892	CACGG	2	10	524895	524904	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013892	CCGAG	2	10	528867	528876	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013892	AAATG	2	10	540406	540415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013892	GTTTT	2	10	540790	540799	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013892	GTTTT	2	10	541194	541203	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013892	TGAAA	2	10	554879	554888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013892	GATAA	2	10	567569	567578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013892	AAGAA	2	10	570890	570899	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013892	ATTGT	2	10	571762	571771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013892	TTATT	2	10	585491	585500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013892	TTTTA	2	10	586041	586050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013892	ATGAC	2	10	586833	586842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013892	GTAAA	2	10	587070	587079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013892	TAAAA	2	10	587106	587115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013892	TGTTT	2	10	587484	587493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013892	ATGGC	2	10	594112	594121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013892	AATTA	2	10	594266	594275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013892	TTTAT	2	10	599184	599193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013892	GATTT	2	10	628811	628820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013892	ACCCA	2	10	632118	632127	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_013892	TAAAT	2	10	636052	636061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013892	TATAA	2	10	639359	639368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013892	TTAAA	2	10	639386	639395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013892	CACGG	2	10	643791	643800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013892	CCGAG	2	10	647603	647612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013892	ATAAA	2	10	652832	652841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013892	AAATT	2	10	657325	657334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013892	GATTA	2	10	658612	658621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013892	TAACT	2	10	664535	664544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013892	CCCCT	2	10	686698	686707	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
103	NC_013892	CTTGC	2	10	687239	687248	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013892	TAAAA	2	10	706091	706100	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013892	CGGAG	2	10	706111	706120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013892	ATTTT	2	10	706752	706761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013892	TATTT	2	10	707152	707161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013892	TATTT	2	10	707280	707289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013892	GTTAA	2	10	709057	709066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013892	TCAAA	2	10	733579	733588	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013892	TAACT	2	10	740504	740513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013892	CTAAT	2	10	741309	741318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013892	AAGTA	2	10	741369	741378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013892	GTATT	2	10	750436	750445	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013892	TAACT	2	10	785766	785775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013892	ACCTT	2	10	815727	815736	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013892	ATATT	2	10	846604	846613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013892	CATCC	2	10	847911	847920	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_013892	TAAAT	2	10	848550	848559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013892	AAATC	2	10	869696	869705	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013892	TTAAA	2	10	869735	869744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013892	GATTA	2	10	874759	874768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013892	GATTA	2	10	875392	875401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013892	ACGTT	2	10	884324	884333	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013892	GATTA	2	10	892150	892159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013892	TAAAT	2	10	893360	893369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013892	TCTAT	2	10	901456	901465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013892	CGTAG	2	10	910887	910896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013892	TACAG	2	10	918315	918324	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013892	CATTT	2	10	919284	919293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013892	CTTTT	2	10	919712	919721	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013892	TTTAC	2	10	920066	920075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013892	AATGA	2	10	964067	964076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013892	AGTTG	2	10	965544	965553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013892	TATCT	2	10	967958	967967	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013892	ATCAG	2	10	970449	970458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013892	AAAAG	2	10	972192	972201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013892	TTAAC	2	10	990484	990493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013892	CTAAA	2	10	995074	995083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013892	CCATA	2	10	1015768	1015777	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_013892	ATTTT	2	10	1032461	1032470	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013892	TTTAT	2	10	1035875	1035884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013892	AATTA	2	10	1045185	1045194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013892	AGTTA	2	10	1045222	1045231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013892	AATTA	2	10	1055251	1055260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013892	TAATT	2	10	1060620	1060629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013892	CAAAA	2	10	1074207	1074216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_013892	GATTA	2	10	2050332	2050341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_013892	TTTTA	6	30	2105789	2105818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_013892	TATGT	2	10	2264960	2264969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_013892	TAACA	2	10	2845355	2845364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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426	NC_013892	TTTAT	2	10	2873230	2873239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_013892	AACAA	2	10	2873264	2873273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
428	NC_013892	AAATA	2	10	2874468	2874477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_013892	TACTC	2	10	2874494	2874503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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431	NC_013892	TAAAA	2	10	2892706	2892715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_013892	GTGAT	2	10	2893511	2893520	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_013892	TGTTT	2	10	2961537	2961546	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_013892	TTGAA	2	10	2983832	2983841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_013892	AATCA	2	10	3003557	3003566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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453	NC_013892	AGTTT	2	10	3023637	3023646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
454	NC_013892	AACCT	2	10	3023797	3023806	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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459	NC_013892	AAATA	2	10	3046629	3046638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_013892	GATAT	2	10	3048804	3048813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
461	NC_013892	ATGAT	2	10	3050176	3050185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
462	NC_013892	CAATC	2	10	3054965	3054974	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
463	NC_013892	ATTTA	2	10	3059969	3059978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_013892	TTTGA	2	10	3062051	3062060	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_013892	GCATG	2	10	3064549	3064558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
467	NC_013892	TTCAT	2	10	3093221	3093230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
468	NC_013892	AATTT	2	10	3096837	3096846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_013892	AGACT	2	10	3103395	3103404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
470	NC_013892	GGGTT	2	10	3104141	3104150	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013892	GATTA	2	10	3106956	3106965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_013892	AGCAC	2	10	3114793	3114802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
473	NC_013892	AGCAC	2	10	3115264	3115273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
474	NC_013892	CAATT	2	10	3115322	3115331	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
475	NC_013892	GCTAT	2	10	3133548	3133557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
476	NC_013892	ATTTA	2	10	3150102	3150111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_013892	CTCGG	2	10	3181804	3181813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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480	NC_013892	TACCG	2	10	3196963	3196972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
481	NC_013892	AACAA	2	10	3199106	3199115	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
482	NC_013892	GATTA	2	10	3202990	3202999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
483	NC_013892	ATTTA	2	10	3205161	3205170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_013892	TAACG	2	10	3205323	3205332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
485	NC_013892	GTTTA	2	10	3209382	3209391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
486	NC_013892	AGGAG	2	10	3222122	3222131	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
487	NC_013892	CATAA	2	10	3229249	3229258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
488	NC_013892	GATTA	2	10	3276918	3276927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013892	CTAAT	2	10	3281286	3281295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
490	NC_013892	GTTTT	2	10	3303803	3303812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013892	TTGGT	2	10	3316535	3316544	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013892	CTAAT	2	10	3318215	3318224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
493	NC_013892	GATTA	2	10	3319379	3319388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_013892	ATGCT	2	10	3346036	3346045	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_013892	ACAAT	2	10	3357115	3357124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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