MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 plasmid pXCEL01

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013531	ACC	2	6	5	10	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013531	TGG	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013531	TGG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013531	GTG	3	9	1154	1162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013531	TGG	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013531	GGT	2	6	1816	1821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013531	GCC	2	6	1825	1830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013531	GTG	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013531	GTC	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013531	AGC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013531	GGC	2	6	1889	1894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013531	GCT	2	6	1912	1917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013531	GCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013531	GTG	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013531	TCC	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013531	GGT	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013531	GCC	2	6	3033	3038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013531	ACG	2	6	3054	3059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013531	CGG	2	6	3128	3133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013531	GTG	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013531	CGG	2	6	3166	3171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013531	GGT	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013531	GCC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013531	GGT	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013531	GCC	2	6	4238	4243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013531	GCC	2	6	4265	4270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013531	GTC	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013531	GCC	2	6	5362	5367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013531	GTG	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013531	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013531	TGG	3	9	6144	6152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013531	CCA	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013531	TCC	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013531	GGT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013531	CGT	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013531	GGT	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013531	GGT	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013531	GCC	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013531	GCA	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013531	AGC	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013531	CGG	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013531	GCC	2	6	7994	7999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_013531	TCG	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013531	GCG	2	6	11831	11836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013531	CAC	2	6	11847	11852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013531	GGT	2	6	12503	12508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013531	GGT	2	6	13071	13076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013531	GTC	2	6	13133	13138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013531	CGG	2	6	13297	13302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013531	CAC	2	6	13420	13425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013531	GCG	2	6	14799	14804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013531	CGG	3	9	14815	14823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013531	TCC	2	6	16534	16539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013531	TGG	2	6	16540	16545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013531	GTG	2	6	16548	16553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013531	CCA	2	6	16561	16566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013531	ACC	2	6	23745	23750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013531	CGG	2	6	23763	23768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013531	TCC	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013531	GCC	2	6	23838	23843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013531	GCC	2	6	24155	24160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013531	GTC	2	6	24167	24172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013531	CGC	2	6	24211	24216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013531	GCC	2	6	24255	24260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013531	CCG	2	6	24298	24303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013531	GAG	2	6	24457	24462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013531	CGA	2	6	25260	25265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013531	GAT	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013531	CCA	2	6	25307	25312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013531	CCA	2	6	25318	25323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013531	TCC	2	6	25336	25341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013531	GAA	2	6	25348	25353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013531	GTC	3	9	25374	25382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013531	CCG	3	9	25388	25396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013531	TCG	3	9	25397	25405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013531	CAG	2	6	25427	25432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013531	GCT	2	6	25442	25447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013531	CGC	2	6	25478	25483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013531	CGC	2	6	25530	25535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013531	TGC	2	6	27148	27153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013531	CCA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013531	GCC	2	6	27190	27195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013531	CCA	2	6	27217	27222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013531	CAC	2	6	27229	27234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013531	CCA	2	6	27240	27245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013531	AAC	2	6	27270	27275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013531	TGG	2	6	27276	27281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013531	GCA	2	6	27294	27299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013531	CAG	2	6	27434	27439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013531	GCA	2	6	27463	27468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013531	GCA	2	6	27490	27495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013531	ACC	2	6	27523	27528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013531	TGG	2	6	27538	27543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013531	GCG	2	6	27551	27556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013531	CAC	2	6	27589	27594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013531	CAC	2	6	29278	29283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013531	CAC	2	6	34195	34200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013531	CCG	2	6	34220	34225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013531	AAC	2	6	41371	41376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013531	ACG	2	6	41438	41443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013531	AAC	2	6	41561	41566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013531	GAG	2	6	41576	41581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013531	CAC	2	6	42272	42277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013531	ACC	2	6	42278	42283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013531	CGC	2	6	42588	42593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013531	GAC	2	6	42599	42604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013531	CGT	2	6	42680	42685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013531	GTT	2	6	42747	42752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013531	GCG	2	6	43589	43594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013531	AGG	2	6	43625	43630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013531	TTG	2	6	43664	43669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013531	CGA	2	6	43676	43681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013531	TGG	2	6	43689	43694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013531	GTG	2	6	43695	43700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013531	CCG	2	6	43713	43718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013531	CGC	2	6	43780	43785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013531	GCT	2	6	43835	43840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013531	GCG	2	6	43879	43884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013531	CGA	2	6	43925	43930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013531	GAC	2	6	43947	43952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013531	CGC	2	6	43981	43986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013531	TGG	2	6	43995	44000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013531	GGC	2	6	44008	44013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013531	CTG	2	6	44043	44048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013531	TGC	2	6	44083	44088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013531	GGT	2	6	44257	44262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013531	GGT	2	6	44280	44285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013531	TGC	2	6	45277	45282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013531	GTC	2	6	45285	45290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013531	GGC	2	6	45406	45411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013531	TGG	2	6	45461	45466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013531	GAG	2	6	45553	45558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013531	TGC	2	6	54954	54959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013531	CGA	2	6	55644	55649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013531	CCG	2	6	55670	55675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013531	TGG	2	6	55702	55707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013531	GCC	2	6	56819	56824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013531	CTG	2	6	56857	56862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013531	TGA	2	6	56906	56911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013531	CCG	2	6	58145	58150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013531	CCG	2	6	58185	58190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013531	CTC	2	6	58238	58243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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259	NC_013531	GGC	2	6	88517	88522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.