MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010717	GCA	2	6	807259	807264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010717	TCAA	2	8	807328	807335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_010717	CCCT	2	8	807355	807362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3504	NC_010717	A	6	6	807370	807375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_010717	GGTG	2	8	807403	807410	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010717	GTA	2	6	807413	807418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010717	G	6	6	807419	807424	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_010717	TGGA	2	8	807426	807433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_010717	AGA	2	6	807446	807451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_010717	AGA	2	6	807457	807462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_010717	AAC	2	6	807510	807515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_010717	TTC	2	6	807550	807555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_010717	CTTA	2	8	807588	807595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_010717	A	6	6	807602	807607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_010717	TGC	2	6	807676	807681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_010717	CACGG	2	10	807706	807715	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3517	NC_010717	CGC	2	6	807800	807805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_010717	TCG	2	6	808838	808843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_010717	CCGC	2	8	808844	808851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3520	NC_010717	CAGC	2	8	808896	808903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_010717	CGGG	2	8	808905	808912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_010717	CCT	2	6	808937	808942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_010717	CG	3	6	809297	809302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_010717	GCTG	2	8	809346	809353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_010717	GGT	2	6	809529	809534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010717	GC	3	6	810848	810853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_010717	AAGG	2	8	810875	810882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010717	CGT	2	6	810937	810942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_010717	ATGAC	2	10	810976	810985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3530	NC_010717	GCT	2	6	811033	811038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_010717	GC	3	6	811071	811076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_010717	CGC	2	6	812080	812085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_010717	CCGG	2	8	812099	812106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_010717	GC	3	6	812125	812130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_010717	GCT	2	6	812158	812163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_010717	AGC	2	6	812180	812185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_010717	GCC	2	6	812231	812236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_010717	GGA	2	6	812243	812248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_010717	CGC	2	6	812280	812285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_010717	ACCA	2	8	812334	812341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_010717	CGA	2	6	812345	812350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_010717	GCCT	2	8	812364	812371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_010717	ACC	2	6	812400	812405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_010717	CAA	2	6	812407	812412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_010717	GTT	2	6	812432	812437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010717	CGCCTG	2	12	812448	812459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_010717	CAG	2	6	812471	812476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_010717	GAC	2	6	812506	812511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_010717	CGC	2	6	812534	812539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_010717	TGG	2	6	812540	812545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_010717	TGG	2	6	812549	812554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_010717	CGT	2	6	812563	812568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010717	CCGCC	2	10	812569	812578	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3554	NC_010717	GGAA	2	8	812589	812596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_010717	GTC	2	6	812598	812603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_010717	GGGCA	2	10	814085	814094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_010717	CG	3	6	814099	814104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_010717	GAG	2	6	814998	815003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_010717	G	6	6	816134	816139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_010717	CA	3	6	816263	816268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_010717	TGA	2	6	816330	816335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_010717	GCA	2	6	816998	817003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_010717	A	7	7	817011	817017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_010717	GCAC	2	8	817128	817135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_010717	T	6	6	817204	817209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_010717	TGG	2	6	817212	817217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_010717	GGC	2	6	818873	818878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_010717	CGG	2	6	818894	818899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_010717	ACG	3	9	818913	818921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_010717	GCGG	2	8	818927	818934	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_010717	GCA	2	6	818945	818950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_010717	GCTG	2	8	818958	818965	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_010717	CAG	2	6	818972	818977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_010717	G	6	6	818999	819004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010717	TGCCG	2	10	819046	819055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3576	NC_010717	AAC	2	6	819094	819099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_010717	AGC	2	6	819108	819113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_010717	GC	3	6	819133	819138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_010717	CCG	2	6	819180	819185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_010717	GCG	2	6	819434	819439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_010717	CGA	2	6	819441	819446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_010717	GC	3	6	819456	819461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_010717	ATG	2	6	819472	819477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010717	GCT	2	6	819482	819487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_010717	GC	3	6	819558	819563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_010717	CAG	2	6	819693	819698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3589	NC_010717	GGC	2	6	819836	819841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_010717	ATT	2	6	819931	819936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_010717	GTG	2	6	820035	820040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_010717	AACG	2	8	820062	820069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_010717	GTG	2	6	820071	820076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_010717	CGGTT	2	10	820092	820101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3596	NC_010717	CG	3	6	820102	820107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_010717	CGG	2	6	820114	820119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_010717	GC	3	6	820207	820212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_010717	CGA	2	6	820288	820293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_010717	TGG	2	6	820301	820306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_010717	CCGG	2	8	820345	820352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_010717	CGC	2	6	820353	820358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_010717	GCG	2	6	820379	820384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_010717	GCG	2	6	820429	820434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_010717	ACG	3	9	820474	820482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_010717	CAG	2	6	820511	820516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3608	NC_010717	CGC	2	6	820636	820641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_010717	GAT	2	6	820650	820655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_010717	CGT	2	6	820711	820716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_010717	CGA	2	6	820748	820753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_010717	CG	3	6	820831	820836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_010717	CGT	2	6	820839	820844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_010717	CTGGTG	2	12	820845	820856	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3615	NC_010717	TG	3	6	820859	820864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_010717	CAA	2	6	820874	820879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_010717	ACT	2	6	820885	820890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_010717	CGC	2	6	820935	820940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_010717	GC	3	6	820992	820997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_010717	CCCG	2	8	821026	821033	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3621	NC_010717	CCGCTG	2	12	821055	821066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_010717	CGA	3	9	821117	821125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_010717	TGC	2	6	821158	821163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_010717	TGCA	2	8	821235	821242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_010717	GAC	2	6	821244	821249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_010717	CGACG	2	10	821255	821264	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3627	NC_010717	CG	3	6	821299	821304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_010717	TCTG	2	8	821305	821312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_010717	CGG	2	6	821327	821332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_010717	ATG	2	6	821415	821420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_010717	GC	3	6	821421	821426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3632	NC_010717	CG	3	6	821432	821437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_010717	GCCA	2	8	821520	821527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_010717	GCC	2	6	821550	821555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3636	NC_010717	GC	4	8	821570	821577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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