MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010717	GGCG	2	8	679091	679098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_010717	GCA	3	9	679233	679241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010717	GC	3	6	679352	679357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_010717	AGC	2	6	679359	679364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_010717	TGC	2	6	679374	679379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_010717	GTT	2	6	679437	679442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_010717	CTGC	2	8	679463	679470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_010717	CCT	2	6	680065	680070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_010717	GAC	2	6	680082	680087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_010717	GGTCCT	2	12	680098	680109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010717	GAT	2	6	680250	680255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010717	AC	3	6	680266	680271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_010717	GGC	2	6	680280	680285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010717	GT	3	6	680386	680391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010717	GCG	3	9	682714	682722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010717	CGA	2	6	682835	682840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_010717	T	6	6	682873	682878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010717	CAA	2	6	682933	682938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_010717	A	6	6	682941	682946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010717	CCG	2	6	682980	682985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_010717	GTG	2	6	683018	683023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_010717	GGCCG	2	10	683038	683047	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3023	NC_010717	CGG	2	6	683062	683067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_010717	GCCG	2	8	683090	683097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_010717	CTT	2	6	683159	683164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_010717	GCG	2	6	683209	683214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_010717	GCC	2	6	683220	683225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_010717	GC	3	6	683231	683236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_010717	GC	3	6	683252	683257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_010717	CAG	2	6	683261	683266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_010717	GCA	2	6	683271	683276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_010717	GC	4	8	684776	684783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_010717	TGG	2	6	684789	684794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_010717	CG	4	8	684838	684845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_010717	CGG	2	6	684866	684871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_010717	GA	3	6	684897	684902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_010717	CTG	2	6	684904	684909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_010717	CAG	2	6	684936	684941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_010717	ATTG	2	8	684945	684952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010717	CGGCG	2	10	685900	685909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3041	NC_010717	AGCGC	2	10	685924	685933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_010717	CAG	2	6	685949	685954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_010717	CTT	2	6	686008	686013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_010717	GCCGT	4	20	686068	686087	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_010717	GTG	2	6	686117	686122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_010717	GTG	2	6	686164	686169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010717	GC	3	6	686176	686181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_010717	GCA	2	6	686253	686258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010717	GCA	2	6	686293	686298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_010717	GCA	2	6	686402	686407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_010717	C	7	7	686434	686440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3052	NC_010717	CG	4	8	687809	687816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_010717	GCG	2	6	689782	689787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_010717	AGC	2	6	689794	689799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_010717	GAT	2	6	689852	689857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010717	CGAA	2	8	689873	689880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_010717	TCG	2	6	689911	689916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_010717	GC	3	6	689917	689922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_010717	CAG	2	6	689940	689945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010717	TCG	2	6	690181	690186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_010717	CTCG	2	8	690191	690198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_010717	GCA	2	6	690245	690250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_010717	CAA	2	6	691072	691077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_010717	CGA	2	6	691091	691096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_010717	TGC	2	6	691186	691191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_010717	GCC	2	6	691885	691890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_010717	GC	3	6	692682	692687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_010717	GCG	2	6	692755	692760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010717	CTG	2	6	692763	692768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_010717	CA	3	6	692814	692819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_010717	CGAC	2	8	692826	692833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_010717	CTT	2	6	695969	695974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_010717	G	6	6	695987	695992	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_010717	GCA	2	6	699706	699711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3083	NC_010717	ACGCC	2	10	699743	699752	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3090	NC_010717	CTG	2	6	701781	701786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_010717	CTG	2	6	701797	701802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3098	NC_010717	CAC	2	6	702104	702109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3101	NC_010717	CAG	2	6	706200	706205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_010717	GAT	2	6	707583	707588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3104	NC_010717	GCGT	2	8	707686	707693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_010717	CAC	2	6	709770	709775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_010717	GCC	2	6	711906	711911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_010717	CGC	3	9	713122	713130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_010717	ATG	2	6	713140	713145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_010717	CG	3	6	713161	713166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_010717	GTG	2	6	713227	713232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010717	CGT	2	6	713264	713269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_010717	GAC	2	6	713856	713861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_010717	GGCG	2	8	713875	713882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_010717	GC	3	6	713932	713937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_010717	GAC	2	6	713953	713958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_010717	CAGG	2	8	714003	714010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_010717	CGGC	2	8	714977	714984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_010717	CG	3	6	714992	714997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3124	NC_010717	GCG	2	6	717582	717587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_010717	TCACG	2	10	717688	717697	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3128	NC_010717	CGGT	2	8	718245	718252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_010717	GCG	3	9	718269	718277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_010717	T	6	6	718325	718330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010717	GC	3	6	718352	718357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_010717	GC	3	6	718376	718381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3134	NC_010717	CCA	2	6	718547	718552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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