MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010717	CTG	2	6	342804	342809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010717	TGC	2	6	342870	342875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010717	GTAT	2	8	342910	342917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010717	GTCG	2	8	342956	342963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010717	CAACG	2	10	343012	343021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1506	NC_010717	GCC	2	6	343047	343052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_010717	TG	3	6	343369	343374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010717	CTG	2	6	343383	343388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_010717	CCG	2	6	343762	343767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010717	GC	3	6	343783	343788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_010717	CTGG	2	8	343796	343803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_010717	CGAGG	2	10	343890	343899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_010717	TCACC	2	10	343919	343928	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1514	NC_010717	TTC	2	6	343963	343968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_010717	TTG	2	6	343985	343990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010717	GAA	2	6	344003	344008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010717	GC	3	6	344012	344017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_010717	AGA	2	6	344048	344053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010717	GC	3	6	344065	344070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_010717	ACTC	2	8	344100	344107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_010717	GCAT	2	8	344112	344119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_010717	GCT	2	6	344143	344148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010717	GCC	2	6	344158	344163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_010717	GTG	2	6	344206	344211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010717	CCG	2	6	344525	344530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_010717	CGA	2	6	344533	344538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_010717	CGA	2	6	344591	344596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_010717	CGT	2	6	344606	344611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010717	GGCG	2	8	344657	344664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_010717	CG	3	6	344812	344817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_010717	GCGT	2	8	344836	344843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_010717	CAGC	2	8	344973	344980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_010717	CCA	3	9	345020	345028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_010717	CGT	2	6	345029	345034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010717	ACA	2	6	345119	345124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_010717	GCA	3	9	345182	345190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_010717	CGC	2	6	345277	345282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1539	NC_010717	CAG	2	6	345446	345451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_010717	GC	5	10	346431	346440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_010717	GTGC	2	8	346542	346549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_010717	GGCGT	2	10	346646	346655	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1543	NC_010717	GC	3	6	347113	347118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_010717	GAC	2	6	347152	347157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010717	TA	3	6	347658	347663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010717	TCC	2	6	347703	347708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_010717	CGC	2	6	347830	347835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_010717	GGCG	2	8	347965	347972	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_010717	GC	3	6	348022	348027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_010717	GCT	2	6	348047	348052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010717	CAC	2	6	348086	348091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_010717	GC	3	6	348135	348140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_010717	CACGC	2	10	348197	348206	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1554	NC_010717	GC	3	6	348233	348238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_010717	AATCCG	2	12	350106	350117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010717	AGT	2	6	351562	351567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_010717	GTG	2	6	351737	351742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010717	GCGT	2	8	351779	351786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_010717	GGA	2	6	351855	351860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010717	CTG	2	6	351867	351872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_010717	A	6	6	351885	351890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010717	GCA	2	6	351932	351937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010717	TGCA	2	8	353200	353207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_010717	GCC	2	6	355466	355471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1569	NC_010717	GC	3	6	357931	357936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_010717	GC	3	6	357940	357945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_010717	GC	3	6	357979	357984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_010717	CG	3	6	357993	357998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_010717	AC	3	6	358011	358016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1578	NC_010717	GCT	2	6	358602	358607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_010717	GGCG	2	8	359006	359013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_010717	AT	3	6	359086	359091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_010717	GC	3	6	360193	360198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_010717	CGCC	2	8	360248	360255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1604	NC_010717	TTG	2	6	360276	360281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010717	GTGC	2	8	360292	360299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_010717	TGA	2	6	360415	360420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_010717	CG	3	6	366182	366187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1622	NC_010717	GAATC	2	10	366451	366460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1631	NC_010717	TCG	2	6	371867	371872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_010717	TCCGA	2	10	371887	371896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1633	NC_010717	AGG	2	6	371916	371921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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