MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010717	GACA	2	8	95764	95771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_010717	GCA	2	6	95783	95788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010717	AGA	2	6	95792	95797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010717	GAT	2	6	95803	95808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010717	GC	3	6	98694	98699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_010717	CGC	2	6	98708	98713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_010717	GGC	2	6	98726	98731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_010717	TCT	2	6	98797	98802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010717	GAT	2	6	98936	98941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010717	TGCG	2	8	98983	98990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_010717	ATGC	2	8	99031	99038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_010717	GC	3	6	99037	99042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_010717	A	6	6	99079	99084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010717	TCG	2	6	99132	99137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010717	CTC	2	6	99157	99162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_010717	GTC	2	6	99174	99179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_010717	CGG	2	6	99196	99201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010717	TTCGC	2	10	99204	99213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
519	NC_010717	CCA	2	6	99226	99231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_010717	ATG	2	6	99260	99265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010717	CTA	2	6	99276	99281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010717	GCA	2	6	99297	99302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010717	GGGC	2	8	100845	100852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
524	NC_010717	CGG	2	6	103111	103116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010717	C	6	6	109378	109383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
526	NC_010717	GA	3	6	109384	109389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010717	AATG	2	8	109399	109406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010717	GGTC	2	8	109609	109616	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_010717	GGCC	2	8	109621	109628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_010717	TGC	2	6	109633	109638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010717	CCAAG	2	10	112514	112523	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
532	NC_010717	GCT	2	6	112546	112551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_010717	GAA	2	6	112686	112691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010717	GCC	2	6	112786	112791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_010717	GA	3	6	112831	112836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_010717	CA	3	6	112908	112913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_010717	CCA	2	6	112930	112935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_010717	GTG	2	6	113119	113124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010717	GCT	2	6	113140	113145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_010717	ACT	2	6	113177	113182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010717	GC	3	6	113252	113257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_010717	GCT	2	6	113277	113282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010717	GCC	2	6	113521	113526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_010717	ATCC	2	8	113670	113677	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_010717	GCATG	2	10	113734	113743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
546	NC_010717	GGT	2	6	113805	113810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_010717	CGA	2	6	113819	113824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010717	CGT	2	6	113828	113833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010717	AC	3	6	113972	113977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_010717	GCC	2	6	114016	114021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_010717	AGA	2	6	114059	114064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010717	AAGG	2	8	114077	114084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010717	CTTG	2	8	114162	114169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_010717	CG	3	6	114202	114207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_010717	GTG	2	6	114214	114219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010717	ATGG	2	8	115695	115702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010717	GC	3	6	115772	115777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_010717	CTG	2	6	115791	115796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_010717	CGGATT	2	12	120494	120505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
560	NC_010717	TAT	2	6	120560	120565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_010717	GGC	2	6	120575	120580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010717	CGACC	2	10	120598	120607	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
563	NC_010717	TGG	2	6	120661	120666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010717	GC	3	6	120675	120680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_010717	CGG	2	6	120697	120702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010717	TGG	2	6	120706	120711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010717	CGG	2	6	120922	120927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_010717	CGG	2	6	120967	120972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010717	GATC	2	8	121014	121021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_010717	TGA	2	6	121074	121079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010717	T	6	6	121087	121092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010717	TCG	2	6	121115	121120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010717	ACGG	2	8	121136	121143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_010717	TGCT	2	8	121199	121206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_010717	GAG	2	6	121258	121263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010717	CCG	2	6	121278	121283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_010717	GTC	2	6	121317	121322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010717	GCG	3	9	121622	121630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010717	GCC	2	6	121662	121667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_010717	CA	3	6	121717	121722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_010717	GCG	2	6	121763	121768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010717	CGCC	2	8	121807	121814	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
583	NC_010717	CTG	2	6	121833	121838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010717	GCCGT	2	10	121857	121866	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
585	NC_010717	AGTGC	2	10	121880	121889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
586	NC_010717	GAT	2	6	121928	121933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010717	GCG	2	6	121979	121984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010717	GCG	2	6	121990	121995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_010717	GATTG	2	10	122020	122029	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010717	GGCCT	2	10	122047	122056	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
591	NC_010717	GCC	2	6	122118	122123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_010717	CCG	2	6	122219	122224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_010717	CAG	2	6	122322	122327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010717	TGA	2	6	122371	122376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010717	CG	3	6	122404	122409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_010717	GC	4	8	122426	122433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_010717	TGCC	2	8	122813	122820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_010717	GCCT	2	8	122823	122830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010717	AC	3	6	122889	122894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_010717	GCG	2	6	124357	124362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010717	T	7	7	124401	124407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010717	CGG	2	6	124465	124470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010717	AAC	2	6	124490	124495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010717	GC	3	6	124529	124534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_010717	GCC	2	6	124591	124596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_010717	AGCGC	2	10	124605	124614	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
607	NC_010717	TGC	2	6	124620	124625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_010717	CCTG	2	8	124686	124693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
609	NC_010717	GCG	2	6	125196	125201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010717	CAA	2	6	125209	125214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010717	GCC	2	6	125229	125234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_010717	CGGG	2	8	125266	125273	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
613	NC_010717	GC	3	6	125299	125304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_010717	GCG	2	6	125330	125335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010717	GCC	2	6	125360	125365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_010717	GGC	2	6	125380	125385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_010717	CAC	2	6	125393	125398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_010717	GTC	3	9	125751	125759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010717	GGC	2	6	125765	125770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010717	GAG	2	6	125786	125791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010717	TTG	2	6	125803	125808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010717	CGCAT	2	10	125811	125820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
623	NC_010717	CGAG	2	8	125825	125832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_010717	CGT	2	6	125834	125839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_010717	CGA	2	6	125919	125924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010717	CTG	2	6	125946	125951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010717	GCA	2	6	125983	125988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010717	CTG	2	6	126014	126019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_010717	GTT	2	6	126091	126096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010717	GCG	2	6	126117	126122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010717	CG	3	6	127474	127479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_010717	TTAA	2	8	127844	127851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010717	AAT	2	6	127855	127860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010717	TG	3	6	127925	127930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010717	AGC	2	6	127938	127943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_010717	GTTG	2	8	127981	127988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010717	AAC	2	6	128040	128045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010717	ATC	2	6	128085	128090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_010717	ATAC	2	8	163981	163988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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906	NC_010717	GTG	2	6	196790	196795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
907	NC_010717	GCG	2	6	196826	196831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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