MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A chromosome

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010717	GTC	3	9	993224	993232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_010717	AAGC	2	8	993276	993283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_010717	GCG	2	6	993291	993296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_010717	T	6	6	993319	993324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_010717	GCA	2	6	993379	993384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_010717	C	7	7	995468	995474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4507	NC_010717	GAC	2	6	997214	997219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_010717	CTG	2	6	997243	997248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_010717	ACC	2	6	997264	997269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_010717	CG	3	6	998130	998135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_010717	ATG	2	6	999007	999012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_010717	CG	3	6	999016	999021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_010717	TGGC	2	8	999026	999033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_010717	CGT	2	6	999754	999759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_010717	GCG	2	6	1000555	1000560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_010717	AACG	2	8	1000680	1000687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_010717	GCA	2	6	1000690	1000695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_010717	GC	3	6	1001357	1001362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_010717	GCT	2	6	1001369	1001374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_010717	CGCAG	2	10	1001388	1001397	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4521	NC_010717	GCC	2	6	1001413	1001418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_010717	GCG	2	6	1001431	1001436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_010717	GAA	2	6	1001502	1001507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_010717	GTG	2	6	1001610	1001615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_010717	GCGT	2	8	1001652	1001659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_010717	GGA	2	6	1001728	1001733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4529	NC_010717	GCA	2	6	1001805	1001810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4532	NC_010717	GAA	2	6	1002211	1002216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_010717	GCGA	2	8	1002219	1002226	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_010717	CTG	2	6	1002272	1002277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_010717	CGTG	2	8	1002997	1003004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4539	NC_010717	TGG	2	6	1004690	1004695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4542	NC_010717	GTT	2	6	1005675	1005680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4549	NC_010717	T	6	6	1007592	1007597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4554	NC_010717	T	7	7	1007730	1007736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_010717	TGC	2	6	1007748	1007753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_010717	TAA	2	6	1007789	1007794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_010717	TGT	3	9	1007806	1007814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4559	NC_010717	GAA	2	6	1007929	1007934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4561	NC_010717	ATTC	2	8	1008025	1008032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_010717	GAA	2	6	1008271	1008276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_010717	GCAT	2	8	1008355	1008362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_010717	GT	3	6	1009357	1009362	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_010717	GGT	2	6	1011575	1011580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4569	NC_010717	GC	3	6	1011794	1011799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_010717	CTG	2	6	1012863	1012868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4575	NC_010717	CCAG	2	8	1013049	1013056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4585	NC_010717	GC	3	6	1013815	1013820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4588	NC_010717	CGGC	2	8	1013887	1013894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4593	NC_010717	GTA	2	6	1015441	1015446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4595	NC_010717	GCG	2	6	1015519	1015524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_010717	TCG	2	6	1015723	1015728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4600	NC_010717	GCT	2	6	1017016	1017021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_010717	GGGT	2	8	1017028	1017035	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_010717	GTT	3	9	1017335	1017343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_010717	CATCG	2	10	1017356	1017365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4604	NC_010717	CGAG	2	8	1018069	1018076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4605	NC_010717	GATG	2	8	1018128	1018135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_010717	GCAGG	2	10	1018152	1018161	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4607	NC_010717	CGA	2	6	1018208	1018213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_010717	AGG	2	6	1018224	1018229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_010717	A	6	6	1018254	1018259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_010717	T	6	6	1018276	1018281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_010717	GCCG	2	8	1019984	1019991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_010717	GCG	2	6	1020003	1020008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_010717	TGGCC	2	10	1020041	1020050	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4614	NC_010717	CGG	2	6	1020053	1020058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_010717	ACG	2	6	1020161	1020166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4617	NC_010717	CGA	2	6	1021217	1021222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_010717	CGC	2	6	1021265	1021270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_010717	TGC	2	6	1021279	1021284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_010717	CCGTG	2	10	1021301	1021310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4621	NC_010717	GTC	2	6	1021317	1021322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_010717	CCA	2	6	1021332	1021337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_010717	GC	4	8	1021351	1021358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_010717	CGA	2	6	1021364	1021369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_010717	CCA	2	6	1021388	1021393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_010717	CAGG	2	8	1023789	1023796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4627	NC_010717	CTG	2	6	1023826	1023831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_010717	GC	3	6	1023869	1023874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_010717	A	7	7	1027825	1027831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_010717	ACG	2	6	1028555	1028560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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