MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010688	GCGCCC	2	12	21410	21421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010688	CACCAG	5	30	24487	24516	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010688	CGCGAC	2	12	32892	32903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010688	AGACGC	2	12	34609	34620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010688	GCATGT	2	12	47870	47881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010688	GACAGT	2	12	77970	77981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010688	CTGGCA	2	12	78130	78141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010688	GCGAGC	2	12	116659	116670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010688	GCGCTC	2	12	126093	126104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010688	GTTGAT	2	12	162070	162081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010688	CGCCAG	2	12	200102	200113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010688	CAGGCG	2	12	252714	252725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010688	GCAAGC	2	12	267576	267587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010688	GCATCC	2	12	278898	278909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010688	CCCAAT	2	12	278961	278972	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010688	AGGGTG	2	12	297602	297613	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010688	GTTTGT	2	12	312287	312298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010688	ACACAG	2	12	321148	321159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010688	CGTGCA	2	12	330524	330535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010688	GTGACT	2	12	346217	346228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010688	TTTGTC	2	12	396549	396560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010688	CGATCG	2	12	432505	432516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010688	GGGGGC	2	12	444366	444377	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010688	GCCGCG	2	12	444577	444588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010688	GCTCCG	2	12	470061	470072	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010688	GCAAGC	2	12	508609	508620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010688	GAGTCA	2	12	558582	558593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010688	GCCCGC	2	12	560536	560547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010688	CCTGCG	2	12	570876	570887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010688	CCGCTG	2	12	596863	596874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010688	CAGCGT	2	12	604673	604684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010688	AGCCGG	2	12	623180	623191	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010688	GCAGGG	2	12	628784	628795	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010688	AGCCAG	2	12	630216	630227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010688	GCGGTG	2	12	630938	630949	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010688	GCAGAG	3	18	671290	671307	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010688	GGCTGC	2	12	671747	671758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010688	GAATTT	2	12	692431	692442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010688	TGCTTG	2	12	699903	699914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010688	TCGCTG	2	12	722973	722984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010688	CGAAGC	2	12	723053	723064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010688	CGAATA	2	12	723128	723139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010688	GCGCGA	2	12	724025	724036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010688	GGCAGC	2	12	726746	726757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010688	ATCGCC	2	12	747089	747100	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010688	CAGATC	2	12	747366	747377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010688	TACCGA	2	12	775128	775139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010688	ACTGGC	3	18	775150	775167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010688	CCGGAA	2	12	778822	778833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010688	GCTTCC	2	12	787030	787041	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010688	TCCTGC	3	18	787093	787110	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010688	GCTGAT	2	12	805472	805483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010688	TGCCAT	2	12	818258	818269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010688	CATGCC	2	12	836530	836541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010688	TTCCCA	2	12	840572	840583	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010688	AAGGTG	2	12	841755	841766	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010688	CTGCCG	2	12	857892	857903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010688	TGACGC	2	12	863853	863864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010688	GCACCG	3	18	867508	867525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010688	GTGGCC	2	12	930173	930184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010688	GCGCAC	2	12	932412	932423	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010688	TCCCGA	2	12	953674	953685	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010688	AAGGGG	2	12	954979	954990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010688	AGTGCA	2	12	993614	993625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010688	TGCACT	2	12	993658	993669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010688	TGCGCA	2	12	1011718	1011729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010688	GGCCCG	2	12	1021006	1021017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010688	CCGCCT	2	12	1031899	1031910	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010688	ATGGGC	4	24	1034861	1034884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010688	TTCGTC	2	12	1046036	1046047	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010688	AGCGGT	2	12	1109505	1109516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010688	GGCACC	2	12	1113343	1113354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010688	GCACCT	2	12	1141999	1142010	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010688	GTGCAT	2	12	1142131	1142142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010688	GAAAGT	2	12	1183331	1183342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010688	TGCCAG	2	12	1190274	1190285	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010688	AGCGTG	2	12	1194443	1194454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010688	ATGGTT	2	12	1217004	1217015	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010688	TTCGAA	2	12	1226961	1226972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010688	TCGCTT	2	12	1238328	1238339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010688	GCTCTT	2	12	1272328	1272339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010688	CAGTTG	2	12	1318674	1318685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010688	TTGCTC	2	12	1348513	1348524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010688	CGTGGG	2	12	1371629	1371640	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010688	GCGGGT	2	12	1380640	1380651	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010688	CTGACC	2	12	1432519	1432530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010688	TAATTT	2	12	1443457	1443468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010688	CTGCCG	2	12	1483293	1483304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010688	CAGCAA	2	12	1490810	1490821	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010688	CGGGAA	2	12	1533031	1533042	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010688	CGCCAC	2	12	1541764	1541775	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010688	CGGCCG	2	12	1562551	1562562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010688	GTGCAG	2	12	1571853	1571864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010688	CTGATG	2	12	1596137	1596148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010688	TGCAGG	3	18	1596903	1596920	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010688	CGGCGC	2	12	1641557	1641568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010688	GTTGGC	2	12	1648530	1648541	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010688	TCTCCT	2	12	1660979	1660990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010688	CCGCAA	2	12	1712570	1712581	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010688	TGCCAC	2	12	1728526	1728537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010688	GCCGTT	2	12	1751726	1751737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010688	GCGGTT	2	12	1793669	1793680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010688	CACGTC	2	12	1800557	1800568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010688	CGTGGC	2	12	1837112	1837123	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010688	GCATCC	2	12	1843682	1843693	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010688	CCGGAA	2	12	1895261	1895272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010688	GTTGAT	2	12	1951113	1951124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010688	GGCAAG	2	12	1969149	1969160	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010688	CCGCAC	4	24	2000390	2000413	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010688	GGCGAT	2	12	2009074	2009085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010688	GCCGGT	2	12	2023141	2023152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010688	CGTGCG	2	12	2040916	2040927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010688	TTCGCG	2	12	2043886	2043897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010688	GCCTGG	2	12	2071301	2071312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010688	CCGGGC	2	12	2130732	2130743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010688	ATGCGC	2	12	2130805	2130816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010688	GCAAAA	2	12	2153130	2153141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010688	TGTCGC	2	12	2181121	2181132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010688	GCGATG	2	12	2283646	2283657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010688	GGGATT	2	12	2287376	2287387	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010688	AGCCGA	2	12	2330485	2330496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010688	TACCTG	2	12	2382136	2382147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010688	CGGCCA	2	12	2410015	2410026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010688	GTGGCG	2	12	2428974	2428985	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010688	TGGCTG	2	12	2450337	2450348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010688	GCCGGG	2	12	2453431	2453442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010688	GTGGGC	2	12	2501393	2501404	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010688	AGGGAC	2	12	2572008	2572019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010688	GCTGGA	2	12	2630286	2630297	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010688	ATGTGC	2	12	2660839	2660850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010688	AACACG	2	12	2676643	2676654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010688	CGCTTG	2	12	2692905	2692916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010688	GCCGAT	2	12	2721965	2721976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010688	CGCAAC	2	12	2725511	2725522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010688	CGCAGG	2	12	2726359	2726370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010688	CAATGG	2	12	2747860	2747871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010688	ATCGCA	2	12	2753293	2753304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010688	CAGCGG	2	12	2775049	2775060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010688	GATTGA	2	12	2826384	2826395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010688	CATTGC	2	12	2885893	2885904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010688	CCTGCA	2	12	2918923	2918934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010688	AATGGA	2	12	2922117	2922128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010688	GAAACC	2	12	2940804	2940815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010688	CGCAGA	2	12	2977947	2977958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010688	CGCTCG	2	12	3021938	3021949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010688	CGGACG	2	12	3065033	3065044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010688	TGCGCC	2	12	3113461	3113472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010688	GCTGTT	2	12	3130284	3130295	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_010688	ACAAAA	2	12	3147513	3147524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_010688	GCATGC	2	12	3154245	3154256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010688	TTGTTC	2	12	3165276	3165287	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_010688	ACGCCG	2	12	3184866	3184877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_010688	GCCCGC	2	12	3195378	3195389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_010688	CCTGGA	2	12	3202180	3202191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010688	CGCTGG	2	12	3212271	3212282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010688	TCGCAT	2	12	3257676	3257687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010688	TTCGCT	2	12	3259358	3259369	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_010688	AAGCTC	2	12	3323880	3323891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_010688	CAGCAC	2	12	3405988	3405999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
164	NC_010688	CGGAAC	2	12	3436035	3436046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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226	NC_010688	ACCCCT	2	12	4774609	4774620	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
227	NC_010688	ACCCCT	2	12	4774830	4774841	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
228	NC_010688	TGGCTG	3	18	4780216	4780233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
229	NC_010688	TTGCTG	3	18	4780234	4780251	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_010688	TTGCCG	2	12	4780264	4780275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_010688	CTCCGT	2	12	4830384	4830395	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
232	NC_010688	GCCCTT	2	12	4832754	4832765	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
233	NC_010688	GGGCGC	2	12	4838184	4838195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
234	NC_010688	AGCTAC	2	12	4842976	4842987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_010688	ATGTGC	2	12	4850509	4850520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
236	NC_010688	TAACCT	2	12	4895338	4895349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
237	NC_010688	CTGCCG	2	12	4942148	4942159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
238	NC_010688	ATTTCA	2	12	4949556	4949567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
239	NC_010688	TCAGTG	2	12	4952839	4952850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_010688	TGGCGG	2	12	4967553	4967564	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_010688	GCTACT	2	12	4972367	4972378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_010688	TTGCCA	3	18	4972398	4972415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_010688	TTGCCG	6	36	4972416	4972451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_010688	CTTGCG	2	12	4995986	4995997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_010688	GCTTGC	2	12	4996254	4996265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_010688	GCGAGC	2	12	5033371	5033382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_010688	CTGCGG	2	12	5033878	5033889	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_010688	CGCGTG	2	12	5050434	5050445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.