MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 1649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	AAAT	2	8	1399	1406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010577	TTTA	2	8	2889	2896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010577	AGAA	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010577	TTTC	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010577	TTTA	2	8	10255	10262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010577	CAAT	2	8	10391	10398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010577	AATC	2	8	12987	12994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010577	ATAC	2	8	13129	13136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010577	AAAG	2	8	13301	13308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010577	GCAG	2	8	18027	18034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010577	TCCT	2	8	18137	18144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010577	CTGC	2	8	18299	18306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010577	CAAT	2	8	18676	18683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010577	GTGG	2	8	19603	19610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010577	TCAG	2	8	19895	19902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010577	GTCA	2	8	20486	20493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010577	CAAC	2	8	20652	20659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010577	AGTT	2	8	21456	21463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010577	AATA	3	12	31802	31813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010577	TCGA	2	8	32025	32032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010577	GGGC	2	8	32594	32601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010577	TGTT	2	8	32611	32618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010577	TGCG	2	8	34272	34279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010577	GTTT	2	8	35624	35631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010577	CGTG	2	8	35637	35644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010577	GTGA	2	8	35883	35890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010577	GATT	2	8	38903	38910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010577	ATCA	2	8	38962	38969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010577	GTGA	2	8	39654	39661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010577	AGGC	2	8	39683	39690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010577	TGCA	2	8	43636	43643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010577	GATA	2	8	43730	43737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010577	CTTT	2	8	43747	43754	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010577	ACAT	2	8	43824	43831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010577	GAAT	2	8	46403	46410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010577	ATTC	2	8	48736	48743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010577	AATT	2	8	49121	49128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010577	ATGC	2	8	49215	49222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010577	GTGA	2	8	49259	49266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010577	AAGC	2	8	49273	49280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010577	GATA	2	8	49574	49581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010577	TCCC	2	8	49595	49602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_010577	TTTC	2	8	49705	49712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010577	GATA	2	8	51731	51738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010577	TGGT	2	8	51809	51816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010577	AAAT	2	8	52202	52209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010577	TCAA	2	8	52224	52231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010577	ACTC	2	8	52585	52592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010577	GATT	2	8	52631	52638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010577	GCTT	2	8	52845	52852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010577	AGTG	2	8	52976	52983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010577	GATT	2	8	54507	54514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010577	GATT	2	8	55743	55750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010577	AGTC	2	8	56232	56239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010577	AAAT	2	8	56496	56503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010577	ATCA	2	8	58771	58778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010577	TCTT	2	8	58884	58891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010577	GTCA	2	8	60245	60252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010577	TTGC	2	8	62046	62053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010577	GTCT	2	8	62320	62327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010577	AATC	2	8	62393	62400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010577	GATT	2	8	62538	62545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010577	ATTA	2	8	62635	62642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010577	TTAT	2	8	62777	62784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010577	ATAA	2	8	62790	62797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010577	AAGG	2	8	63752	63759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010577	CTAT	2	8	63868	63875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010577	CCGT	2	8	63906	63913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010577	GAAT	2	8	64224	64231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010577	ATTT	2	8	64313	64320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010577	AAGT	2	8	64853	64860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010577	CGAT	2	8	64918	64925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010577	TAAG	2	8	65497	65504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010577	GACC	2	8	68310	68317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010577	CGTC	2	8	68828	68835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010577	AAAG	2	8	68951	68958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010577	GTTG	2	8	69318	69325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010577	AGGT	2	8	69485	69492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010577	GTTT	2	8	71051	71058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010577	CTGG	2	8	74494	74501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010577	GGTT	2	8	77370	77377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010577	ATTA	2	8	77462	77469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010577	GATA	2	8	77642	77649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010577	TAAA	2	8	77753	77760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010577	TTGA	2	8	77785	77792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010577	TAGT	2	8	78358	78365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010577	CATA	2	8	78808	78815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010577	ATGA	2	8	82412	82419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010577	ACGT	2	8	82453	82460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010577	TATT	2	8	83216	83223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010577	GTAT	2	8	83236	83243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010577	TGAT	2	8	83289	83296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010577	TAAT	2	8	83390	83397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010577	AAAG	2	8	83750	83757	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010577	TTTG	2	8	84008	84015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010577	AAGT	2	8	84081	84088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010577	TTGC	2	8	84114	84121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010577	CTAA	2	8	84169	84176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010577	GCAG	2	8	84183	84190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010577	GCAG	2	8	84267	84274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010577	TGCT	2	8	84374	84381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010577	ACTT	2	8	84437	84444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010577	GTTT	2	8	88254	88261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010577	TTGT	2	8	94354	94361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010577	CCCT	2	8	96439	96446	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_010577	GTAA	2	8	96909	96916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010577	CGTG	2	8	97128	97135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010577	ACCT	2	8	107891	107898	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010577	TCAG	2	8	109904	109911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010577	CAAA	2	8	111495	111502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010577	ATGC	2	8	114743	114750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010577	ACTG	2	8	114969	114976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010577	ATGA	2	8	116393	116400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010577	GCCT	2	8	117555	117562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010577	GACG	2	8	118798	118805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010577	TTCG	2	8	119029	119036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010577	TTGA	2	8	121874	121881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010577	TCTA	2	8	122537	122544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010577	CAAC	2	8	122756	122763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010577	GAGT	2	8	122837	122844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010577	AACA	2	8	122930	122937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010577	TTGT	2	8	123015	123022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010577	ACCC	2	8	126613	126620	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_010577	CTTG	2	8	127461	127468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010577	GATG	2	8	133783	133790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010577	TGGT	2	8	141239	141246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010577	TGTT	2	8	142661	142668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010577	TGGC	2	8	142922	142929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010577	GGTT	2	8	142950	142957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010577	TGGT	2	8	146773	146780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010577	GATA	2	8	149340	149347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010577	AGCA	2	8	156265	156272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010577	ATGG	2	8	156273	156280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010577	TGGT	2	8	156356	156363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010577	GTGC	2	8	159480	159487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010577	CGTT	2	8	163111	163118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010577	TCAT	2	8	163464	163471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010577	CAGT	2	8	163763	163770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010577	TGAA	2	8	163870	163877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010577	TGTT	2	8	166341	166348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010577	GGAT	2	8	166365	166372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010577	ATTT	2	8	170478	170485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010577	TGAT	2	8	170555	170562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010577	TAAG	2	8	170674	170681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010577	GACC	2	8	173488	173495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010577	CGTC	2	8	174006	174013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010577	AAAG	2	8	174129	174136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010577	GTTG	2	8	174496	174503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010577	AGGT	2	8	174663	174670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010577	GTTT	2	8	176229	176236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010577	GATT	2	8	180502	180509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_010577	CTGC	2	8	182061	182068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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