MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 11668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010577	ATT	2	6	572853	572858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_010577	CAT	2	6	572889	572894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010577	GGT	2	6	573006	573011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010577	TCAT	2	8	573017	573024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_010577	TGT	2	6	573129	573134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010577	GAC	2	6	573150	573155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_010577	GTA	2	6	573174	573179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_010577	CTA	2	6	573225	573230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010577	TGT	2	6	573248	573253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010577	GT	3	6	573301	573306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_010577	TTGC	2	8	573379	573386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_010577	TG	4	8	573407	573414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_010577	GAC	2	6	573415	573420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010577	TTTC	2	8	573429	573436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_010577	AGC	2	6	573454	573459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_010577	AGTTT	2	10	573474	573483	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010577	CTT	2	6	573487	573492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_010577	GTT	2	6	573493	573498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_010577	TTA	2	6	574561	574566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_010577	TTGG	2	8	574657	574664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_010577	GCG	2	6	574669	574674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_010577	TGAG	2	8	574685	574692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_010577	AGTC	2	8	574698	574705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_010577	GGT	2	6	574724	574729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_010577	GAT	2	6	574742	574747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_010577	GCTGGT	2	12	574768	574779	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3027	NC_010577	ATTTGT	2	12	574824	574835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_010577	GAT	2	6	575076	575081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_010577	CGC	2	6	575092	575097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_010577	GT	3	6	575112	575117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_010577	TTG	2	6	575189	575194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_010577	TGTC	2	8	575212	575219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_010577	TCC	2	6	575354	575359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_010577	GTT	2	6	575373	575378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_010577	C	6	6	575423	575428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3036	NC_010577	CGG	2	6	575453	575458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_010577	GTTGG	2	10	575491	575500	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_010577	GGC	2	6	575502	575507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_010577	GT	3	6	575619	575624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_010577	CTG	2	6	575667	575672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_010577	ATG	2	6	575735	575740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010577	TGA	2	6	579361	579366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_010577	AAG	2	6	580160	580165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_010577	ATC	2	6	580251	580256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_010577	TGCAA	2	10	580270	580279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3046	NC_010577	GAT	2	6	580289	580294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010577	TG	4	8	580307	580314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010577	TCT	2	6	580410	580415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010577	GCGTT	2	10	580429	580438	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_010577	CAGC	2	8	580465	580472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_010577	CAC	2	6	580493	580498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_010577	GAGT	2	8	580521	580528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010577	ATG	2	6	580535	580540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010577	GCAGG	2	10	580542	580551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3055	NC_010577	CGT	2	6	581957	581962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_010577	GT	3	6	581961	581966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_010577	TGTGT	2	10	581997	582006	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_010577	GT	3	6	582032	582037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_010577	CTG	2	6	582083	582088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_010577	GTAGCA	15	90	582133	582222	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3061	NC_010577	TGTT	2	8	582232	582239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_010577	TTGCG	2	10	582246	582255	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_010577	T	6	6	582342	582347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_010577	ATG	2	6	582394	582399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_010577	GTG	2	6	582414	582419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_010577	TTGGTG	2	12	582434	582445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010577	ACGTT	2	10	582460	582469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_010577	TGC	2	6	582510	582515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010577	TGG	2	6	582540	582545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010577	GCAG	2	8	582671	582678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_010577	GATA	2	8	582691	582698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010577	TG	3	6	582732	582737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_010577	GAG	2	6	583315	583320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_010577	AGG	2	6	583331	583336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_010577	TGA	2	6	583360	583365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3077	NC_010577	TATTT	2	10	583390	583399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_010577	GGTT	2	8	583405	583412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_010577	CTGTG	2	10	583430	583439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3080	NC_010577	GAT	2	6	583489	583494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_010577	GAT	2	6	583538	583543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_010577	T	7	7	583571	583577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_010577	CCA	2	6	583614	583619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_010577	ATA	2	6	583684	583689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_010577	GTC	2	6	583802	583807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_010577	TC	3	6	583818	583823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_010577	TGG	2	6	583856	583861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_010577	T	6	6	584312	584317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_010577	T	6	6	584319	584324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_010577	GTG	2	6	584365	584370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_010577	TGG	2	6	584388	584393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_010577	GTTG	2	8	584406	584413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_010577	GTT	2	6	585967	585972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_010577	TTGA	2	8	586042	586049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_010577	CGTG	2	8	586105	586112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_010577	GCG	2	6	586130	586135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_010577	AC	3	6	586176	586181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_010577	AGTT	2	8	586197	586204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_010577	TTC	2	6	586268	586273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_010577	TGG	2	6	588087	588092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_010577	ACA	2	6	588138	588143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_010577	A	6	6	588692	588697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_010577	CTT	2	6	588757	588762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_010577	TTTG	2	8	588804	588811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_010577	CTT	2	6	588866	588871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_010577	ACG	2	6	588886	588891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_010577	TCA	2	6	590757	590762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_010577	TTC	2	6	591267	591272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_010577	TG	3	6	591275	591280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_010577	TTC	2	6	591321	591326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_010577	GAA	2	6	591383	591388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_010577	GAA	2	6	591399	591404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_010577	AT	3	6	592787	592792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_010577	T	6	6	592805	592810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_010577	ATTAT	2	10	592822	592831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_010577	GAAT	2	8	592848	592855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_010577	TAA	2	6	592894	592899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_010577	TTTA	2	8	592911	592918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_010577	AATTA	2	10	592955	592964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_010577	GCA	2	6	593253	593258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_010577	AGGA	2	8	593275	593282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_010577	AGGG	2	8	593296	593303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_010577	G	6	6	593301	593306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_010577	AAAC	2	8	593321	593328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_010577	TG	3	6	593332	593337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_010577	TCT	2	6	593339	593344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_010577	T	6	6	593727	593732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_010577	TTA	2	6	593745	593750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_010577	GAT	2	6	593754	593759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_010577	AT	3	6	593794	593799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_010577	CAAA	2	8	593800	593807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_010577	CTT	2	6	593842	593847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_010577	TCT	2	6	593879	593884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_010577	TAA	2	6	593885	593890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_010577	TAA	2	6	594148	594153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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