MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 11668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010577	ATT	2	6	2493017	2493022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_010577	CAT	2	6	2493057	2493062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_010577	T	7	7	2493075	2493081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_010577	A	6	6	2493103	2493108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_010577	AAT	2	6	2493174	2493179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_010577	ATCAC	2	10	2493320	2493329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11507	NC_010577	GGC	2	6	2493353	2493358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_010577	GAAA	2	8	2493407	2493414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_010577	CTT	2	6	2493459	2493464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_010577	GTT	2	6	2493516	2493521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_010577	GTT	2	6	2494479	2494484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_010577	TGA	2	6	2495469	2495474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_010577	A	6	6	2495482	2495487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_010577	ACGTTA	2	12	2498659	2498670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11515	NC_010577	GAAA	2	8	2498713	2498720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_010577	CTT	2	6	2498765	2498770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_010577	GTT	2	6	2498822	2498827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_010577	GTT	2	6	2499782	2499787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_010577	GAT	2	6	2503818	2503823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010577	GGATG	2	10	2503855	2503864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_010577	TCA	2	6	2503876	2503881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_010577	GCT	2	6	2503893	2503898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_010577	TGCTC	2	10	2503918	2503927	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11524	NC_010577	TGA	2	6	2503935	2503940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010577	GAT	2	6	2503984	2503989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_010577	ATA	2	6	2503999	2504004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_010577	TGC	2	6	2504025	2504030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_010577	TGCTG	2	10	2504089	2504098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11529	NC_010577	TGAT	2	8	2504169	2504176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_010577	CAC	3	9	2504276	2504284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11531	NC_010577	TAA	2	6	2505069	2505074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_010577	GAC	2	6	2505104	2505109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_010577	GC	3	6	2505188	2505193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_010577	GC	3	6	2505254	2505259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11535	NC_010577	ATG	2	6	2505308	2505313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_010577	GTT	2	6	2505330	2505335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_010577	GGC	2	6	2505474	2505479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_010577	TGG	2	6	2505488	2505493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010577	TAT	3	9	2505638	2505646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_010577	T	6	6	2505670	2505675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_010577	A	7	7	2505752	2505758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_010577	TTTA	2	8	2505787	2505794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_010577	TCA	2	6	2505860	2505865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_010577	CT	3	6	2505898	2505903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_010577	TTC	2	6	2505964	2505969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_010577	ATG	2	6	2506031	2506036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_010577	TGA	2	6	2506042	2506047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_010577	GCG	2	6	2506098	2506103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_010577	CT	3	6	2507673	2507678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_010577	ATCT	3	12	2508407	2508418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_010577	GCC	2	6	2508982	2508987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11552	NC_010577	TGG	2	6	2509080	2509085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_010577	GCG	2	6	2509106	2509111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_010577	TTTA	2	8	2509115	2509122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_010577	GAT	2	6	2509148	2509153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_010577	TGG	2	6	2509154	2509159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_010577	TAAA	2	8	2509233	2509240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_010577	GGT	2	6	2510822	2510827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_010577	GTT	2	6	2510828	2510833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_010577	GTT	2	6	2510842	2510847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_010577	GCG	2	6	2510853	2510858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_010577	TTTA	2	8	2510925	2510932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_010577	ATG	2	6	2510956	2510961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_010577	TAA	2	6	2510970	2510975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_010577	GCC	2	6	2511004	2511009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_010577	TAAA	2	8	2511037	2511044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_010577	CAA	2	6	2511051	2511056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_010577	AATGA	2	10	2511059	2511068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_010577	CAT	2	6	2511075	2511080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11571	NC_010577	GCT	2	6	2512868	2512873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_010577	CGG	2	6	2512900	2512905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_010577	GGT	2	6	2512913	2512918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_010577	GCC	2	6	2512934	2512939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11575	NC_010577	TGG	2	6	2513032	2513037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_010577	GCG	2	6	2513058	2513063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_010577	TTTA	2	8	2513067	2513074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_010577	T	8	8	2513104	2513111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_010577	TAA	2	6	2513113	2513118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_010577	C	6	6	2513148	2513153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11581	NC_010577	TAAA	2	8	2513179	2513186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_010577	ATGA	2	8	2513207	2513214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_010577	CAT	2	6	2513217	2513222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_010577	AC	3	6	2513234	2513239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_010577	ATT	2	6	2513679	2513684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_010577	CTTG	2	8	2513704	2513711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11589	NC_010577	TTA	2	6	2513896	2513901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_010577	CTA	2	6	2513990	2513995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_010577	TCA	2	6	2513998	2514003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_010577	TAAC	2	8	2514034	2514041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11593	NC_010577	TTTA	2	8	2514050	2514057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_010577	T	7	7	2514087	2514093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_010577	TAA	2	6	2514095	2514100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_010577	TAAA	2	8	2514162	2514169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_010577	CAA	2	6	2514176	2514181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_010577	AATGA	2	10	2514184	2514193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_010577	CAT	2	6	2514200	2514205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_010577	AC	3	6	2514217	2514222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_010577	CTTTTT	2	12	2514626	2514637	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11602	NC_010577	CTC	2	6	2514641	2514646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_010577	AAG	2	6	2514650	2514655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_010577	CTTG	2	8	2514682	2514689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_010577	GAA	2	6	2514703	2514708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_010577	TTA	2	6	2514874	2514879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_010577	TCA	2	6	2514976	2514981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_010577	TGC	3	9	2514991	2514999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_010577	TAAC	2	8	2515012	2515019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11610	NC_010577	TTTA	2	8	2515028	2515035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_010577	GAT	2	6	2515061	2515066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_010577	TAA	2	6	2515073	2515078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_010577	AC	3	6	2515095	2515100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_010577	CTG	2	6	2515108	2515113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_010577	GCA	2	6	2515133	2515138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_010577	TAAA	2	8	2515146	2515153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_010577	GCA	2	6	2515159	2515164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_010577	CA	3	6	2515179	2515184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_010577	GCT	2	6	2516975	2516980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_010577	CGG	2	6	2517007	2517012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_010577	GGT	2	6	2517020	2517025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_010577	GCC	2	6	2517041	2517046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_010577	GGC	2	6	2517152	2517157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_010577	GCG	2	6	2517165	2517170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_010577	TTTA	2	8	2517174	2517181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_010577	T	7	7	2517211	2517217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_010577	TAA	2	6	2517219	2517224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_010577	GCC	2	6	2517253	2517258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11629	NC_010577	TAAA	2	8	2517286	2517293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_010577	AATGA	2	10	2517308	2517317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11631	NC_010577	CAT	2	6	2517324	2517329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11633	NC_010577	GAA	2	6	2528261	2528266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11634	NC_010577	GGA	2	6	2528281	2528286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11637	NC_010577	G	6	6	2528343	2528348	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11648	NC_010577	G	6	6	2528619	2528624	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11651	NC_010577	CGG	2	6	2528729	2528734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11652	NC_010577	TGC	3	9	2528848	2528856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11655	NC_010577	GTTGG	2	10	2528883	2528892	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11656	NC_010577	GT	3	6	2528900	2528905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11657	NC_010577	GTTT	2	8	2528981	2528988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11662	NC_010577	GA	3	6	2533121	2533126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11663	NC_010577	ATA	2	6	2533146	2533151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11667	NC_010577	GCT	2	6	2535663	2535668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11668	NC_010577	CAT	2	6	2535673	2535678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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