MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 12338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010513	T	6	6	484601	484606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_010513	TAA	2	6	484697	484702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010513	GCT	2	6	484850	484855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_010513	GC	3	6	484940	484945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_010513	T	6	6	484981	484986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010513	AGC	2	6	484994	484999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_010513	AAT	2	6	485008	485013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_010513	AAG	2	6	485162	485167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_010513	TAC	2	6	485174	485179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_010513	AAAT	2	8	485207	485214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_010513	TGGT	2	8	485257	485264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_010513	GTA	2	6	485314	485319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_010513	CA	3	6	485358	485363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_010513	CAT	2	6	485438	485443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_010513	CG	3	6	485447	485452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_010513	TGA	2	6	485668	485673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_010513	GCA	2	6	485697	485702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_010513	TCTG	2	8	485723	485730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_010513	GT	4	8	485735	485742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_010513	CAG	2	6	485762	485767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_010513	GAT	2	6	485786	485791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_010513	TGC	2	6	485876	485881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_010513	TGC	2	6	486388	486393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_010513	TGA	2	6	486409	486414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_010513	GGT	2	6	486501	486506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_010513	TTG	2	6	486516	486521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_010513	AGG	2	6	486526	486531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_010513	AGT	2	6	486537	486542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_010513	GGT	2	6	486550	486555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_010513	AG	3	6	487243	487248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_010513	CGT	2	6	487272	487277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_010513	AGC	2	6	487286	487291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_010513	AGG	2	6	487322	487327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_010513	GGT	2	6	487393	487398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_010513	TGC	2	6	487419	487424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_010513	TGT	2	6	487425	487430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_010513	TGT	2	6	487785	487790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_010513	GCT	2	6	489002	489007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_010513	ATC	2	6	489785	489790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_010513	T	6	6	489793	489798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_010513	ATAG	2	8	489800	489807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_010513	AGT	2	6	489814	489819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_010513	TGT	2	6	489868	489873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_010513	GTG	2	6	489884	489889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_010513	T	8	8	489903	489910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_010513	GAAT	2	8	489916	489923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_010513	CAT	2	6	489940	489945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_010513	ATG	2	6	489952	489957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_010513	TAA	2	6	489963	489968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_010513	TG	3	6	490034	490039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_010513	GT	3	6	490048	490053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_010513	TGTT	2	8	490311	490318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_010513	TGAT	2	8	490396	490403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_010513	TGT	2	6	490441	490446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010513	AACTGC	2	12	490464	490475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_010513	TGC	2	6	490495	490500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_010513	TGA	2	6	490501	490506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_010513	TGA	2	6	490556	490561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_010513	ATG	2	6	490839	490844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_010513	AT	3	6	490866	490871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_010513	T	6	6	490961	490966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_010513	GCT	2	6	490975	490980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_010513	GAG	2	6	490993	490998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_010513	GGT	2	6	491031	491036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_010513	TGG	2	6	491046	491051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_010513	TGTT	2	8	491080	491087	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_010513	GGTA	2	8	491426	491433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010513	GTT	2	6	494268	494273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_010513	GGTGT	2	10	494380	494389	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_010513	TC	3	6	494426	494431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2571	NC_010513	GGTTG	2	10	494896	494905	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_010513	GT	3	6	495649	495654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_010513	TG	3	6	495659	495664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_010513	TGG	4	12	496977	496988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_010513	CGATG	2	10	497029	497038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2576	NC_010513	TCA	2	6	497068	497073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_010513	GGC	2	6	497083	497088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_010513	GAT	2	6	497092	497097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_010513	CTG	2	6	497106	497111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_010513	GATT	2	8	497123	497130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_010513	GCT	2	6	503655	503660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_010513	GTA	2	6	503670	503675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_010513	GTG	2	6	503676	503681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_010513	TGT	2	6	503805	503810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_010513	TTG	2	6	503861	503866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_010513	TTC	2	6	503879	503884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_010513	TGT	2	6	504022	504027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_010513	CTG	2	6	504064	504069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_010513	TTG	2	6	504117	504122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_010513	GCT	2	6	504127	504132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_010513	GGT	2	6	504156	504161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_010513	GAC	2	6	504166	504171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_010513	TAGA	2	8	504183	504190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_010513	TAGA	2	8	504199	504206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_010513	GAT	2	6	504266	504271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_010513	GAT	2	6	504317	504322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_010513	AAG	2	6	504355	504360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_010513	GAA	2	6	504370	504375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_010513	ATC	2	6	505566	505571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_010513	A	6	6	511513	511518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_010513	TC	4	8	511533	511540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_010513	TCA	2	6	511613	511618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_010513	AGAT	2	8	517154	517161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_010513	GAT	2	6	517168	517173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_010513	GCCAA	2	10	517180	517189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2606	NC_010513	GCA	2	6	517195	517200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_010513	CA	3	6	517268	517273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_010513	AGC	2	6	517305	517310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_010513	TGA	2	6	517415	517420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_010513	AG	3	6	517430	517435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_010513	GCC	2	6	517554	517559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_010513	GT	3	6	517572	517577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_010513	TGA	2	6	517616	517621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_010513	TGCG	2	8	517625	517632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_010513	TGT	2	6	517760	517765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_010513	TTTA	2	8	517787	517794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_010513	GTT	2	6	517877	517882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_010513	GAT	2	6	517899	517904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_010513	CGATC	2	10	517921	517930	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2620	NC_010513	CGA	2	6	517958	517963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_010513	ATG	2	6	517979	517984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_010513	AATG	2	8	518042	518049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_010513	GATG	2	8	518054	518061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_010513	TG	3	6	518080	518085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_010513	GTAT	2	8	518095	518102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_010513	GTG	2	6	519144	519149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_010513	ATT	2	6	520018	520023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_010513	TGC	2	6	520066	520071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_010513	CAGGA	2	10	520104	520113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2630	NC_010513	AGTCA	2	10	520197	520206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2631	NC_010513	CAT	2	6	520214	520219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_010513	TTG	2	6	520444	520449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2634	NC_010513	TTGG	2	8	521224	521231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2909	NC_010513	TGC	2	6	568937	568942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2912	NC_010513	T	6	6	569031	569036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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