MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 12338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010513	CAG	2	6	2347805	2347810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_010513	AC	3	6	2349116	2349121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_010513	GAA	2	6	2349165	2349170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_010513	ATA	2	6	2349219	2349224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_010513	CAA	2	6	2349227	2349232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_010513	CAG	2	6	2349240	2349245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_010513	CT	3	6	2349265	2349270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_010513	GATA	2	8	2349467	2349474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_010513	ACA	2	6	2349506	2349511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_010513	ACC	2	6	2349594	2349599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11511	NC_010513	CCA	2	6	2349642	2349647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11512	NC_010513	AC	3	6	2349722	2349727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_010513	GAC	2	6	2349728	2349733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_010513	CAA	2	6	2349900	2349905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_010513	ATT	2	6	2349981	2349986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_010513	TTCT	2	8	2349987	2349994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11517	NC_010513	ACA	2	6	2350003	2350008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_010513	A	6	6	2350119	2350124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_010513	ATA	2	6	2350127	2350132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_010513	CAC	2	6	2352374	2352379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_010513	ATAA	2	8	2352380	2352387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_010513	AGA	2	6	2352457	2352462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_010513	ATAAA	2	10	2352508	2352517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_010513	A	7	7	2352546	2352552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_010513	TA	3	6	2352633	2352638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_010513	AAT	2	6	2352659	2352664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_010513	CCAT	2	8	2352679	2352686	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_010513	AAT	2	6	2352721	2352726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_010513	ATA	2	6	2352751	2352756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_010513	ATT	2	6	2352778	2352783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_010513	TCA	2	6	2352794	2352799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_010513	TGA	2	6	2352803	2352808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_010513	CA	3	6	2352839	2352844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_010513	CAG	2	6	2352851	2352856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_010513	TA	3	6	2352864	2352869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_010513	TCT	2	6	2352870	2352875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_010513	AT	3	6	2352898	2352903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_010513	TAA	2	6	2352970	2352975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_010513	CAT	2	6	2353009	2353014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_010513	ATA	2	6	2353019	2353024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_010513	GCTT	2	8	2353039	2353046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11542	NC_010513	GAT	2	6	2353102	2353107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_010513	CTA	2	6	2353133	2353138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_010513	TCA	2	6	2353168	2353173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_010513	ATCT	2	8	2353174	2353181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_010513	TAAT	2	8	2353184	2353191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_010513	CAC	2	6	2353197	2353202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11548	NC_010513	AAC	2	6	2353223	2353228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_010513	TTCA	2	8	2353233	2353240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_010513	GATA	2	8	2353302	2353309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_010513	CAA	2	6	2353362	2353367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_010513	ATG	2	6	2354777	2354782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_010513	CAAAAT	2	12	2354787	2354798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11554	NC_010513	ATT	2	6	2354904	2354909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_010513	GCCA	2	8	2354951	2354958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11556	NC_010513	TGC	2	6	2357062	2357067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_010513	ATG	2	6	2357069	2357074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_010513	CATG	2	8	2357139	2357146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_010513	CAAAA	2	10	2357156	2357165	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11560	NC_010513	TGC	2	6	2357268	2357273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_010513	CTACG	2	10	2357277	2357286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11562	NC_010513	TTCA	2	8	2357326	2357333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_010513	CAAG	2	8	2357353	2357360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11564	NC_010513	TTA	2	6	2357379	2357384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_010513	AC	4	8	2357417	2357424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_010513	GCA	2	6	2357448	2357453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_010513	AAGC	2	8	2357509	2357516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_010513	AAT	2	6	2357529	2357534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_010513	AATC	2	8	2357769	2357776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11570	NC_010513	GCA	2	6	2359430	2359435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_010513	A	6	6	2359488	2359493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_010513	TCA	2	6	2359510	2359515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_010513	GA	3	6	2359522	2359527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_010513	ACA	2	6	2359528	2359533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_010513	CAAT	2	8	2359680	2359687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11576	NC_010513	TCA	2	6	2359715	2359720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_010513	CA	3	6	2359719	2359724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_010513	CAT	2	6	2359738	2359743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_010513	ATT	2	6	2359812	2359817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_010513	ACA	2	6	2359818	2359823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_010513	CAC	2	6	2359840	2359845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11582	NC_010513	CTGCCG	2	12	2359848	2359859	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11583	NC_010513	CTG	2	6	2359948	2359953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_010513	A	6	6	2360018	2360023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_010513	AGA	2	6	2360028	2360033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_010513	CAT	2	6	2362018	2362023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_010513	CAGCG	2	10	2362037	2362046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11588	NC_010513	AAGG	2	8	2363559	2363566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_010513	AT	3	6	2363570	2363575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_010513	GAC	2	6	2365335	2365340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11592	NC_010513	CCA	2	6	2365387	2365392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_010513	A	9	9	2365502	2365510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_010513	T	6	6	2365520	2365525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_010513	TCCAA	2	10	2365527	2365536	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11596	NC_010513	GCA	2	6	2365551	2365556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_010513	TTC	2	6	2365623	2365628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_010513	AAC	2	6	2365662	2365667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_010513	AC	3	6	2365689	2365694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_010513	A	7	7	2367954	2367960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_010513	ATA	2	6	2367966	2367971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_010513	A	6	6	2367991	2367996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_010513	A	7	7	2368001	2368007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_010513	CTA	2	6	2368036	2368041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_010513	ATA	2	6	2368088	2368093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_010513	A	7	7	2368111	2368117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_010513	AAT	2	6	2368159	2368164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_010513	T	7	7	2368203	2368209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_010513	AAT	2	6	2368219	2368224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_010513	ATC	2	6	2368230	2368235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_010513	AGC	2	6	2368259	2368264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_010513	ATC	3	9	2368266	2368274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_010513	AAT	2	6	2368324	2368329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_010513	ACC	2	6	2368346	2368351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_010513	CAG	2	6	2368352	2368357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_010513	CAG	2	6	2368418	2368423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_010513	ATT	2	6	2368449	2368454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_010513	ACAT	2	8	2368455	2368462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11619	NC_010513	A	6	6	2368464	2368469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_010513	TAT	3	9	2368518	2368526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_010513	CA	3	6	2368617	2368622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_010513	TAC	2	6	2368642	2368647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_010513	ATC	2	6	2368686	2368691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_010513	GCC	2	6	2368694	2368699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_010513	ATC	2	6	2368785	2368790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_010513	CCAAA	2	10	2368887	2368896	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11627	NC_010513	AC	3	6	2369010	2369015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11628	NC_010513	AAG	2	6	2369086	2369091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_010513	AC	3	6	2369104	2369109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11760	NC_010513	AC	3	6	2401636	2401641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11761	NC_010513	CGC	2	6	2401675	2401680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11780	NC_010513	TCC	2	6	2403914	2403919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11997	NC_010513	GAG	3	9	2454756	2454764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_010513	TCT	2	6	2454776	2454781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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