MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 12338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010513	GCA	2	6	65819	65824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010513	GTA	2	6	65830	65835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010513	CGA	2	6	66027	66032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_010513	GAT	2	6	66052	66057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010513	GCA	2	6	66101	66106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010513	GAA	2	6	66160	66165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010513	GAA	2	6	66197	66202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010513	GTT	2	6	66223	66228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_010513	CAG	2	6	66269	66274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010513	GGT	2	6	66334	66339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010513	TGT	2	6	66350	66355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010513	AGG	2	6	66459	66464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_010513	GGC	2	6	66480	66485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_010513	ACACTG	2	12	66497	66508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010513	CGC	2	6	66628	66633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_010513	GAA	2	6	66724	66729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_010513	TGC	2	6	66800	66805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010513	GTC	2	6	66812	66817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_010513	TCGTG	2	10	66821	66830	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
520	NC_010513	TGG	2	6	66890	66895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010513	GGA	2	6	66926	66931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_010513	TCA	2	6	66951	66956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010513	AC	3	6	66977	66982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_010513	TAC	2	6	66984	66989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010513	TGC	2	6	67117	67122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_010513	AC	3	6	67147	67152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_010513	TTG	2	6	67174	67179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010513	GAG	2	6	67205	67210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010513	CCT	2	6	67288	67293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_010513	GTC	2	6	67447	67452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010513	CCA	2	6	67472	67477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_010513	GGT	2	6	67505	67510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_010513	GGT	2	6	67540	67545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010513	TCC	2	6	67551	67556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_010513	CCA	2	6	67562	67567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_010513	ATT	2	6	67579	67584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_010513	T	6	6	67603	67608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_010513	TGA	2	6	67651	67656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_010513	TAA	2	6	67682	67687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010513	TGG	2	6	67782	67787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_010513	CAA	2	6	67850	67855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_010513	AGG	2	6	67928	67933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_010513	AGT	2	6	67996	68001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010513	G	6	6	68152	68157	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
545	NC_010513	TCC	2	6	68162	68167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010513	GACC	2	8	68184	68191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_010513	AC	3	6	68684	68689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_010513	CGTC	2	8	68702	68709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_010513	AAC	2	6	68721	68726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010513	AGG	2	6	68795	68800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010513	AGC	2	6	68811	68816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010513	AAAG	2	8	68825	68832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010513	ATA	2	6	69011	69016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010513	GTTG	2	8	69192	69199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010513	AGG	2	6	69210	69215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010513	ACCGT	2	10	69338	69347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
557	NC_010513	AGGT	2	8	69358	69365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_010513	GA	3	6	69389	69394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010513	TGG	2	6	69455	69460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010513	CGG	2	6	69642	69647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010513	GCG	2	6	69724	69729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_010513	TGAAAT	2	12	69751	69762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_010513	ACC	2	6	69913	69918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_010513	TGG	2	6	69973	69978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010513	TCC	2	6	69999	70004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_010513	GGA	2	6	70016	70021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010513	TG	3	6	70060	70065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_010513	GGT	2	6	70136	70141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010513	CGG	2	6	70223	70228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010513	TCA	2	6	70251	70256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010513	CGT	2	6	70331	70336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_010513	GCT	2	6	70385	70390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010513	GC	3	6	70506	70511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_010513	GTG	2	6	70566	70571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010513	GT	3	6	70582	70587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010513	GCA	2	6	70592	70597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010513	TCA	2	6	70709	70714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010513	ACC	2	6	70801	70806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_010513	ATCCC	2	10	70809	70818	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
580	NC_010513	GTTT	2	8	70930	70937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010513	CT	3	6	70987	70992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_010513	CCA	2	6	71850	71855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_010513	GAT	2	6	71862	71867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_010513	ATC	2	6	71889	71894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_010513	A	6	6	72756	72761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_010513	AAC	2	6	72779	72784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_010513	AAC	2	6	72789	72794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010513	GACA	2	8	72830	72837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_010513	GAG	2	6	72838	72843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010513	GGC	2	6	74350	74355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010513	ATA	2	6	74411	74416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010513	TTA	2	6	74435	74440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010513	T	7	7	74482	74488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_010513	ATG	2	6	74963	74968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_010513	AATT	2	8	74989	74996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010513	CGCTG	2	10	75032	75041	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
597	NC_010513	TGC	2	6	75086	75091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010513	GAGC	2	8	75126	75133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010513	GT	3	6	75345	75350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010513	ATG	3	9	75462	75470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_010513	GT	3	6	75520	75525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010513	CAG	2	6	75560	75565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010513	ATT	2	6	75568	75573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_010513	AAC	2	6	75588	75593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_010513	TGC	2	6	75649	75654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_010513	CAG	2	6	75677	75682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010513	TGA	2	6	75697	75702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010513	AC	3	6	75787	75792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_010513	CAG	2	6	75794	75799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010513	ACA	2	6	75894	75899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010513	ACT	2	6	75914	75919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010513	TTG	2	6	75923	75928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_010513	TTTC	2	8	76012	76019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_010513	T	6	6	76046	76051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_010513	ATC	2	6	76053	76058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010513	GGA	2	6	77211	77216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_010513	GGTT	2	8	77247	77254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010513	CAT	2	6	77288	77293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010513	TTC	2	6	77360	77365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_010513	TA	3	6	77378	77383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_010513	GATA	2	8	77519	77526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010513	AT	3	6	77599	77604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_010513	TAAA	2	8	77630	77637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_010513	TAA	2	6	77655	77660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010513	TTGA	2	8	77662	77669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010513	TTG	2	6	77699	77704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010513	T	6	6	81475	81480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010513	ATT	2	6	81481	81486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010513	ATGA	2	8	82298	82305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010513	GCAGG	2	10	82314	82323	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
631	NC_010513	CGT	2	6	82357	82362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010513	ATG	3	9	83049	83057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010513	TATT	2	8	83102	83109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_010513	TAA	3	9	83129	83137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_010513	TGAT	2	8	83174	83181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_010513	TAAT	2	8	83275	83282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010513	TAAA	2	8	83328	83335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_010513	TGA	2	6	83350	83355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_010513	TTG	2	6	83386	83391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_010513	A	7	7	83419	83425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_010513	AGT	2	6	83427	83432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_010513	TGC	2	6	83444	83449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_010513	GTTTG	2	10	83457	83466	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
644	NC_010513	TGT	2	6	83558	83563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_010513	GAT	2	6	83650	83655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_010513	AAG	2	6	83867	83872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_010513	TGGT	2	8	83876	83883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
651	NC_010513	G	6	6	83892	83897	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
652	NC_010513	TTTG	2	8	83905	83912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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656	NC_010513	CTT	2	6	83993	83998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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665	NC_010513	TGCT	2	8	84272	84279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
666	NC_010513	GAT	2	6	84295	84300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_010513	TCT	2	6	85087	85092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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688	NC_010513	TTGT	2	8	94253	94260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
689	NC_010513	T	6	6	94265	94270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_010513	CTA	2	6	114605	114610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_010513	TGA	2	6	116162	116167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_010513	GCT	2	6	116181	116186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_010513	GTT	2	6	116202	116207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_010513	TGCTG	2	10	116307	116316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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780	NC_010513	TAA	2	6	116385	116390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
781	NC_010513	GCCT	2	8	117102	117109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
782	NC_010513	TGA	2	6	117123	117128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
783	NC_010513	CGTA	2	8	117146	117153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
784	NC_010513	CAT	2	6	117177	117182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_010513	TAA	2	6	117197	117202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
786	NC_010513	GTG	2	6	118299	118304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
787	NC_010513	CGA	2	6	118329	118334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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789	NC_010513	GA	3	6	118369	118374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
790	NC_010513	CGTGT	2	10	118395	118404	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
791	NC_010513	GCT	2	6	118413	118418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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793	NC_010513	TC	3	6	118469	118474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
794	NC_010513	GTG	2	6	118481	118486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
795	NC_010513	TTCG	2	8	118576	118583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
796	NC_010513	TTG	2	6	118586	118591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
797	NC_010513	TGC	2	6	118622	118627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
798	NC_010513	GTT	2	6	118628	118633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
799	NC_010513	TTGA	2	8	121422	121429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
800	NC_010513	GGA	2	6	121431	121436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
801	NC_010513	TGT	2	6	121485	121490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
802	NC_010513	ATT	2	6	121532	121537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
803	NC_010513	CGT	2	6	121772	121777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
804	NC_010513	GGT	2	6	121821	121826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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809	NC_010513	AACA	2	8	122475	122482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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813	NC_010513	TTGT	2	8	122560	122567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
814	NC_010513	TCA	2	6	122608	122613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
815	NC_010513	TG	3	6	122639	122644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
816	NC_010513	AGT	2	6	122665	122670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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820	NC_010513	TCT	2	6	124897	124902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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822	NC_010513	ACTGC	2	10	126387	126396	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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827	NC_010513	GTT	2	6	129882	129887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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909	NC_010513	GTT	2	6	158393	158398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
910	NC_010513	ATC	2	6	158409	158414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
911	NC_010513	CAT	2	6	158470	158475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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914	NC_010513	GT	3	6	158591	158596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
915	NC_010513	TCAT	2	8	158650	158657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
916	NC_010513	GAA	2	6	158658	158663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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