MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009717	CGTG	2	8	188	195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009717	AAGC	2	8	2782	2789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009717	CAAT	2	8	8684	8691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009717	ATCG	2	8	8729	8736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009717	TTCT	2	8	12749	12756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009717	CCTT	2	8	13405	13412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009717	AGGA	2	8	13462	13469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009717	AGGT	2	8	17481	17488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009717	CGGC	2	8	17527	17534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009717	GCGA	2	8	17606	17613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009717	TTGC	2	8	17639	17646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009717	TGAC	2	8	22841	22848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009717	ATCC	2	8	23008	23015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009717	TCGG	2	8	23803	23810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009717	CGAG	2	8	24330	24337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009717	TCGC	2	8	28071	28078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009717	GAGT	2	8	30051	30058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009717	GACC	2	8	34561	34568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009717	AGGC	2	8	38306	38313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009717	TCCA	2	8	38893	38900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009717	ATTT	2	8	45190	45197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009717	CCTG	2	8	48705	48712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009717	GGGC	2	8	48713	48720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009717	GCCC	2	8	48743	48750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_009717	GCCG	2	8	49494	49501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009717	ACCG	2	8	52323	52330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009717	CTGA	2	8	53994	54001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009717	GCCA	2	8	54942	54949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009717	GGGC	2	8	55436	55443	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009717	AGCG	2	8	62338	62345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009717	AGGA	2	8	67166	67173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009717	GCCG	2	8	67865	67872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009717	TGCT	2	8	67950	67957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009717	TGGT	2	8	72512	72519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009717	GCGG	2	8	72646	72653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009717	CGGC	2	8	72677	72684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009717	CATC	2	8	72735	72742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009717	GGGA	2	8	73390	73397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009717	GAGG	2	8	73752	73759	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009717	CGGG	2	8	79721	79728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009717	CGTC	2	8	80648	80655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009717	GTCA	2	8	82285	82292	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009717	GAGG	2	8	82332	82339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009717	GCCC	2	8	86336	86343	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_009717	CGGG	2	8	99379	99386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009717	GGCC	2	8	99469	99476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009717	GCGT	2	8	99528	99535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009717	GTGG	2	8	99589	99596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009717	GATG	2	8	101597	101604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009717	GTGG	2	8	101840	101847	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009717	CCCG	2	8	102665	102672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_009717	CGGG	2	8	102769	102776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009717	CCGA	2	8	102919	102926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009717	GGCT	2	8	103033	103040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009717	GCCA	2	8	103070	103077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009717	CCCG	2	8	104175	104182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009717	AGGG	2	8	104201	104208	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009717	CGTC	2	8	109739	109746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009717	CCGG	2	8	114554	114561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009717	CGAT	2	8	114820	114827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009717	CTAT	2	8	117740	117747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009717	GACG	2	8	124664	124671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009717	AGGG	2	8	130787	130794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009717	CGGC	2	8	131527	131534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009717	CAGC	2	8	139540	139547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009717	GCCC	2	8	141375	141382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_009717	TCAC	2	8	141625	141632	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009717	CCGA	2	8	141963	141970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009717	GGGC	2	8	141977	141984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009717	CTGG	2	8	142379	142386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009717	CACC	2	8	143697	143704	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009717	GTTC	2	8	143799	143806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009717	CATC	2	8	144333	144340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009717	TCCG	2	8	144350	144357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009717	ATGC	2	8	146090	146097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009717	ATCT	2	8	146945	146952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009717	CCCG	2	8	147068	147075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_009717	CGAT	2	8	147082	147089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009717	GCGG	2	8	153263	153270	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009717	TCCG	2	8	153697	153704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009717	CGCC	2	8	153794	153801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_009717	GCTC	2	8	156046	156053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009717	ATTG	2	8	156211	156218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009717	AATT	2	8	156225	156232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009717	GCCG	2	8	163089	163096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009717	CGGC	2	8	168004	168011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009717	CGAG	2	8	168391	168398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009717	GCAG	2	8	168511	168518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009717	AAAT	2	8	168540	168547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009717	GAGG	2	8	169289	169296	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009717	GGCT	2	8	174427	174434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009717	CATG	2	8	174976	174983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009717	GTGG	2	8	176901	176908	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009717	CCGG	2	8	177219	177226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009717	GCCG	2	8	177339	177346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009717	GCGA	2	8	177349	177356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009717	TGAC	2	8	177398	177405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009717	ATGC	2	8	177482	177489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009717	CACC	3	12	177825	177836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009717	GGCG	2	8	186911	186918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009717	TGGA	2	8	186996	187003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009717	GGCA	2	8	187030	187037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009717	CGTG	2	8	187110	187117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009717	GACG	2	8	187559	187566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009717	GCGG	2	8	187829	187836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009717	CCCG	2	8	189003	189010	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009717	GGCC	2	8	196600	196607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009717	GCCC	2	8	196638	196645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009717	AGGA	2	8	196684	196691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009717	TCGC	2	8	201408	201415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009717	GGCC	2	8	203265	203272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009717	GGCC	2	8	203298	203305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009717	GCCC	2	8	208763	208770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009717	CGGT	2	8	209000	209007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009717	GGGA	2	8	209325	209332	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009717	GCTG	2	8	209779	209786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009717	TCGA	2	8	210410	210417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009717	CACC	2	8	210857	210864	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_009717	GCCT	2	8	214563	214570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009717	GCCT	2	8	215988	215995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009717	GGCG	2	8	217251	217258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009717	GGGC	2	8	218013	218020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009717	GATC	2	8	220269	220276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009717	CGGC	2	8	220621	220628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009717	CCGT	2	8	220640	220647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009717	GGAG	2	8	220718	220725	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009717	GCCG	2	8	227062	227069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009717	GCCG	2	8	227273	227280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009717	GCCG	2	8	228410	228417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009717	TTGT	2	8	228469	228476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009717	CCTG	2	8	228746	228753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009717	CCTT	2	8	228949	228956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009717	CTGC	2	8	231761	231768	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009717	GCCG	2	8	234605	234612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009717	GAGG	2	8	242537	242544	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009717	GGAC	2	8	244639	244646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009717	GCGT	2	8	244801	244808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009717	GCTA	2	8	247411	247418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009717	CCAG	2	8	247455	247462	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009717	GAGG	2	8	250113	250120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009717	CGGG	2	8	252722	252729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009717	CCTT	2	8	259053	259060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009717	CGGC	2	8	259282	259289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009717	GCAG	2	8	259313	259320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009717	GCCG	2	8	259417	259424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009717	CTAA	2	8	264883	264890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009717	CCGG	2	8	265314	265321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009717	GCAG	2	8	265415	265422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009717	GTCA	2	8	267832	267839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009717	GAGG	2	8	267879	267886	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009717	AGCG	2	8	267996	268003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009717	TGCG	2	8	280037	280044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009717	CCCA	2	8	280310	280317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_009717	TCCC	2	8	280386	280393	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
155	NC_009717	GAAG	2	8	280488	280495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009717	CATC	2	8	281220	281227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_009717	GCCC	2	8	281678	281685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
158	NC_009717	CGGC	2	8	282905	282912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_009717	CAGG	2	8	285137	285144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_009717	CGTG	2	8	285193	285200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_009717	GTTT	2	8	285281	285288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009717	CACT	2	8	285305	285312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009717	CGTC	2	8	299051	299058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_009717	ATTC	2	8	299333	299340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_009717	CACC	2	8	305052	305059	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
170	NC_009717	CGGT	2	8	311619	311626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_009717	TGGT	2	8	311720	311727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009717	ATGG	2	8	311850	311857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009717	AGGA	2	8	313705	313712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.