MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 17148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007705	ATG	2	6	520436	520441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_007705	GCTA	2	8	520446	520453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_007705	GCG	2	6	520486	520491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_007705	GGC	2	6	520581	520586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_007705	GGC	2	6	520639	520644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_007705	AGGA	2	8	520744	520751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_007705	GGC	2	6	520907	520912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_007705	GCA	2	6	520938	520943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_007705	GGA	2	6	521071	521076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_007705	CG	3	6	521088	521093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_007705	CCA	2	6	521139	521144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_007705	CGA	2	6	521148	521153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_007705	GAT	2	6	521173	521178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_007705	GCA	2	6	521222	521227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_007705	GAA	2	6	521281	521286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_007705	GAAA	2	8	521317	521324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_007705	CAG	2	6	521390	521395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_007705	GCGT	2	8	521446	521453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_007705	GGT	3	9	521455	521463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_007705	TGT	2	6	521471	521476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_007705	GGA	2	6	521581	521586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2023	NC_007705	ACACTG	2	12	521618	521629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2025	NC_007705	GAA	2	6	521845	521850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2034	NC_007705	TAC	2	6	522105	522110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_007705	TGC	2	6	522238	522243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_007705	AC	3	6	522268	522273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_007705	TTG	2	6	522295	522300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_007705	CCT	2	6	522409	522414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2039	NC_007705	GTC	2	6	522555	522560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2041	NC_007705	GGT	2	6	522619	522624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_007705	CAC	2	6	522677	522682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2043	NC_007705	AGCG	2	8	522761	522768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2044	NC_007705	ATCT	2	8	522777	522784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2048	NC_007705	CAA	2	6	522998	523003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_007705	GCT	2	6	523071	523076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_007705	GGA	2	6	523114	523119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_007705	AGT	2	6	523144	523149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2054	NC_007705	TCC	2	6	523310	523315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_007705	GACC	2	8	523332	523339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_007705	TAC	2	6	523738	523743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2058	NC_007705	AC	3	6	523832	523837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2059	NC_007705	CGTC	2	8	523850	523857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2061	NC_007705	AGG	2	6	523943	523948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_007705	AGC	2	6	523959	523964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2064	NC_007705	CTG	2	6	524123	524128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_007705	GTTG	2	8	524346	524353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_007705	ACCGT	2	10	524489	524498	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2067	NC_007705	GA	3	6	524540	524545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2073	NC_007705	TGG	2	6	525122	525127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2095	NC_007705	GTTG	2	8	526265	526272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2100	NC_007705	TG	3	6	526537	526542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_007705	GT	3	6	526613	526618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2117	NC_007705	AG	3	6	527470	527475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2121	NC_007705	CCTGG	2	10	527591	527600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2135	NC_007705	GCG	2	6	534693	534698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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