MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 17148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007705	GC	3	6	276507	276512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_007705	CAA	2	6	276513	276518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_007705	TGC	2	6	276614	276619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007705	CG	3	6	276650	276655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_007705	GC	3	6	276669	276674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_007705	GCA	2	6	276699	276704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_007705	GCC	2	6	276750	276755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_007705	GCG	2	6	277858	277863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_007705	T	6	6	277900	277905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_007705	CGC	2	6	277955	277960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_007705	GCA	2	6	277974	277979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_007705	CG	3	6	277995	278000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_007705	CAAGCG	2	12	278001	278012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1015	NC_007705	GTC	2	6	278076	278081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_007705	CG	3	6	278143	278148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_007705	ACGA	2	8	278158	278165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_007705	ACGCA	2	10	278320	278329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1019	NC_007705	GT	3	6	278375	278380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_007705	GTGCG	2	10	278408	278417	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_007705	CGTG	2	8	278425	278432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_007705	TGCG	2	8	278502	278509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_007705	TGT	2	6	278537	278542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007705	CGT	2	6	278575	278580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_007705	CGCA	2	8	278597	278604	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_007705	AAC	2	6	279678	279683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_007705	AGC	2	6	279692	279697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_007705	GC	3	6	279717	279722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_007705	CAAG	2	8	279853	279860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_007705	CAC	2	6	279864	279869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_007705	CGG	2	6	280043	280048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007705	ACG	2	6	280059	280064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_007705	AC	3	6	280082	280087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_007705	CAA	2	6	280149	280154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007705	CG	3	6	280262	280267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_007705	GAG	2	6	280304	280309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_007705	CGC	2	6	281463	281468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_007705	GC	4	8	281498	281505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_007705	GTGA	2	8	281509	281516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007705	GGC	2	6	281611	281616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_007705	GTG	2	6	282048	282053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1043	NC_007705	TCT	2	6	282613	282618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_007705	GAG	2	6	282621	282626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_007705	C	6	6	282662	282667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1046	NC_007705	TCT	2	6	282674	282679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_007705	GAG	2	6	282682	282687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_007705	GCC	2	6	283568	283573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_007705	GCG	2	6	283584	283589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_007705	AGC	2	6	283628	283633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_007705	GGCG	2	8	283639	283646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_007705	GTT	2	6	283700	283705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_007705	AGC	2	6	283725	283730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_007705	AAC	2	6	283747	283752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_007705	CAC	2	6	283754	283759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_007705	GAG	2	6	283787	283792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007705	TGC	2	6	284768	284773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007705	GGC	2	6	284776	284781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_007705	AAG	2	6	284848	284853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_007705	GTT	2	6	284877	284882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007705	TCC	2	6	284903	284908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1066	NC_007705	CGG	2	6	284952	284957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007705	CGC	2	6	287195	287200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_007705	GCA	2	6	287211	287216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1070	NC_007705	TCC	2	6	287258	287263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_007705	GCA	2	6	287321	287326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1073	NC_007705	CG	3	6	287395	287400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_007705	GCT	2	6	287461	287466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_007705	CGAT	2	8	292923	292930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_007705	GCCA	2	8	292972	292979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_007705	GC	4	8	292999	293006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1101	NC_007705	CG	3	6	293847	293852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_007705	CCA	2	6	293898	293903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1108	NC_007705	CAG	2	6	294149	294154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007705	GCGT	2	8	294205	294212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_007705	GGT	3	9	294214	294222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_007705	TGT	2	6	294230	294235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_007705	GGA	2	6	294340	294345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_007705	CGC	2	6	294508	294513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_007705	GAA	2	6	294604	294609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_007705	TGC	2	6	294680	294685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_007705	GTC	2	6	294692	294697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_007705	TCGTG	2	10	294701	294710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_007705	TGG	2	6	294770	294775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1123	NC_007705	TCA	2	6	294831	294836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1125	NC_007705	TAC	2	6	294864	294869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_007705	AC	3	6	295027	295032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_007705	TTG	2	6	295054	295059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007705	CCT	2	6	295168	295173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_007705	GTC	2	6	295314	295319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_007705	CCA	2	6	295339	295344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_007705	GGT	2	6	295378	295383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_007705	CAC	2	6	295436	295441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1135	NC_007705	ATCT	2	8	295536	295543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1151	NC_007705	AAC	2	6	296628	296633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1157	NC_007705	ACCGT	2	10	297248	297257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1168	NC_007705	GGT	2	6	298044	298049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_007705	GT	3	6	298490	298495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1186	NC_007705	GCG	2	6	299600	299605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_007705	AAG	2	6	323989	323994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_007705	CTG	2	6	324033	324038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_007705	GC	3	6	324116	324121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_007705	CCG	2	6	324147	324152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_007705	GCG	2	6	324164	324169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_007705	ATGC	5	20	324194	324213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1261	NC_007705	CGA	2	6	324345	324350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_007705	AGCA	2	8	324363	324370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_007705	GGC	2	6	324376	324381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_007705	CAG	2	6	324464	324469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_007705	GCA	2	6	324472	324477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_007705	ACGC	2	8	324595	324602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1267	NC_007705	CAC	2	6	326000	326005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_007705	GCGTG	2	10	326032	326041	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1269	NC_007705	GGC	2	6	326109	326114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_007705	GAC	2	6	361858	361863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_007705	CGG	2	6	361992	361997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1484	NC_007705	CAG	2	6	381181	381186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_007705	GCA	3	9	381292	381300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1488	NC_007705	GC	3	6	381322	381327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1489	NC_007705	GC	4	8	381334	381341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1490	NC_007705	CAC	2	6	381363	381368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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