MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 17148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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503	NC_007705	CTG	2	6	138537	138542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007705	CATG	2	8	138594	138601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_007705	ATCGC	2	10	138624	138633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_007705	TCAT	2	8	138649	138656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_007705	GAC	2	6	139390	139395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007705	GAG	2	6	140555	140560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007705	CTC	2	6	142421	142426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_007705	GCC	2	6	142446	142451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_007705	CTT	2	6	142508	142513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_007705	GCAC	2	8	142560	142567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_007705	GGC	2	6	142623	142628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_007705	TGC	2	6	142629	142634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_007705	CGG	2	6	142672	142677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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517	NC_007705	TGC	2	6	143668	143673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_007705	TAA	2	6	143698	143703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007705	CCT	2	6	144124	144129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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522	NC_007705	A	6	6	144277	144282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_007705	GAG	2	6	144317	144322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007705	AC	3	6	144390	144395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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532	NC_007705	GCTG	2	8	148582	148589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_007705	TGG	2	6	148591	148596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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535	NC_007705	AAG	2	6	148631	148636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_007705	GC	3	6	149348	149353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_007705	GTGG	2	8	149371	149378	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007705	TGAC	2	8	150388	150395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_007705	ACA	2	6	150401	150406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_007705	TGC	2	6	150418	150423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_007705	CACG	2	8	150568	150575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_007705	CGAT	2	8	150582	150589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_007705	TCG	2	6	150590	150595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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553	NC_007705	GCT	2	6	150745	150750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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632	NC_007705	ATGG	2	8	173713	173720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_007705	TTG	2	6	175315	175320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_007705	GCT	2	6	175376	175381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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912	NC_007705	TG	3	6	262427	262432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
913	NC_007705	TG	5	10	262445	262454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
914	NC_007705	CAGC	2	8	262468	262475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
915	NC_007705	GAAG	2	8	262676	262683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
916	NC_007705	AGCGCC	2	12	262695	262706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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918	NC_007705	AAGGC	2	10	262798	262807	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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921	NC_007705	CGG	2	6	263197	263202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
922	NC_007705	CAT	2	6	263214	263219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
923	NC_007705	CG	3	6	263223	263228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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931	NC_007705	TCG	2	6	265535	265540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
932	NC_007705	GC	3	6	265559	265564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
933	NC_007705	CGT	2	6	265620	265625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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935	NC_007705	CTCA	2	8	265660	265667	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
936	NC_007705	CGC	2	6	266168	266173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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939	NC_007705	GGC	2	6	266243	266248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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945	NC_007705	GCA	2	6	266450	266455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
946	NC_007705	GCA	2	6	266466	266471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
947	NC_007705	AAC	2	6	266480	266485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_007705	TTGC	2	8	266497	266504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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950	NC_007705	GGC	2	6	266556	266561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
951	NC_007705	GC	3	6	266576	266581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
952	NC_007705	CTGCTT	2	12	266618	266629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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963	NC_007705	GCAG	2	8	269081	269088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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966	NC_007705	CAGC	2	8	269229	269236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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975	NC_007705	CCA	2	6	269484	269489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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