MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 17148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007705	ATGC	2	8	1195069	1195076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_007705	GTGGC	2	10	1195126	1195135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4503	NC_007705	TGCT	2	8	1195142	1195149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_007705	TTC	2	6	1195183	1195188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_007705	AC	3	6	1195250	1195255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_007705	GCT	2	6	1195273	1195278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_007705	CCG	2	6	1195300	1195305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_007705	TG	3	6	1196341	1196346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_007705	A	6	6	1196356	1196361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_007705	T	6	6	1196376	1196381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_007705	GAC	2	6	1196517	1196522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_007705	TCA	2	6	1196536	1196541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_007705	TGC	2	6	1196591	1196596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_007705	CCA	2	6	1196597	1196602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_007705	CCAC	2	8	1196629	1196636	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4516	NC_007705	TGC	2	6	1196640	1196645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_007705	AGG	2	6	1198544	1198549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_007705	GTT	3	9	1198563	1198571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_007705	GGA	2	6	1198589	1198594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_007705	GTG	2	6	1198644	1198649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_007705	ATC	2	6	1199828	1199833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_007705	AAC	2	6	1199900	1199905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_007705	GAT	2	6	1199917	1199922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_007705	CGC	2	6	1199936	1199941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_007705	CGG	2	6	1200208	1200213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_007705	CAT	2	6	1200262	1200267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_007705	T	7	7	1200327	1200333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_007705	AGG	2	6	1200366	1200371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_007705	ACA	2	6	1200426	1200431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_007705	T	6	6	1201776	1201781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_007705	GGCA	2	8	1202684	1202691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4532	NC_007705	TGA	2	6	1202721	1202726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_007705	GAA	2	6	1202822	1202827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_007705	AGC	2	6	1202913	1202918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_007705	AAGC	2	8	1203030	1203037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_007705	GCG	2	6	1203045	1203050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_007705	T	6	6	1203073	1203078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_007705	G	11	11	1204139	1204149	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_007705	ATC	2	6	1204240	1204245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_007705	CTG	2	6	1204258	1204263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_007705	GCC	2	6	1206495	1206500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_007705	ATC	2	6	1208684	1208689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_007705	GCAG	2	8	1208697	1208704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_007705	TTGC	2	8	1209072	1209079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_007705	TGA	2	6	1209081	1209086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_007705	GCA	2	6	1209114	1209119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_007705	CTG	2	6	1209152	1209157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_007705	CG	3	6	1209173	1209178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_007705	GCC	2	6	1209235	1209240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_007705	GC	3	6	1210184	1210189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_007705	CTGC	2	8	1211492	1211499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_007705	GTG	2	6	1211547	1211552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_007705	TG	3	6	1211551	1211556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_007705	TGGG	2	8	1211596	1211603	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_007705	GCC	2	6	1211614	1211619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_007705	C	11	11	1211629	1211639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4557	NC_007705	GCG	2	6	1211663	1211668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_007705	GCAC	2	8	1211682	1211689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_007705	CGGCA	2	10	1212384	1212393	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4560	NC_007705	AGGT	2	8	1212428	1212435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_007705	CCG	2	6	1212507	1212512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_007705	CGC	2	6	1212547	1212552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_007705	G	6	6	1212614	1212619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_007705	CGC	2	6	1213235	1213240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_007705	ATC	2	6	1213266	1213271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_007705	CTG	2	6	1213290	1213295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_007705	GTG	2	6	1213296	1213301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_007705	GGC	2	6	1213384	1213389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_007705	GCCG	2	8	1213837	1213844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_007705	TCT	2	6	1215912	1215917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_007705	CTG	2	6	1216455	1216460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_007705	CAAT	2	8	1217699	1217706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_007705	GCA	2	6	1217745	1217750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_007705	CG	3	6	1217755	1217760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_007705	CAG	2	6	1217813	1217818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_007705	GCG	2	6	1217831	1217836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_007705	CGC	2	6	1217837	1217842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_007705	TGC	2	6	1217851	1217856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_007705	GC	3	6	1218333	1218338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4580	NC_007705	GGC	2	6	1218341	1218346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_007705	GGCCG	2	10	1218358	1218367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4582	NC_007705	ATGC	2	8	1218399	1218406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_007705	GGC	2	6	1221224	1221229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_007705	GCA	2	6	1221244	1221249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_007705	GTG	2	6	1221274	1221279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_007705	CGA	2	6	1221315	1221320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_007705	GCT	2	6	1221331	1221336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_007705	CCCA	2	8	1221346	1221353	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4589	NC_007705	CTT	2	6	1221386	1221391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_007705	CTG	2	6	1221416	1221421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_007705	CG	3	6	1221434	1221439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_007705	CGC	2	6	1221522	1221527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_007705	GC	3	6	1222868	1222873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_007705	G	6	6	1222895	1222900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_007705	CG	3	6	1222953	1222958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_007705	CGGG	2	8	1222973	1222980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_007705	CGA	2	6	1223011	1223016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_007705	GCGCT	2	10	1223058	1223067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4599	NC_007705	AG	3	6	1223078	1223083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_007705	GA	3	6	1223145	1223150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_007705	CTG	2	6	1226425	1226430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_007705	ATC	2	6	1226506	1226511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_007705	GTAT	2	8	1226513	1226520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_007705	CGC	2	6	1226565	1226570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_007705	GGC	2	6	1226584	1226589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_007705	GCC	2	6	1226596	1226601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_007705	GCG	2	6	1226641	1226646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_007705	GCT	2	6	1226772	1226777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4610	NC_007705	T	7	7	1228421	1228427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_007705	TGT	2	6	1228435	1228440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_007705	TGC	2	6	1228485	1228490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_007705	CGGC	2	8	1228502	1228509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_007705	GCG	2	6	1228556	1228561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_007705	ATC	2	6	1228627	1228632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_007705	CAC	2	6	1228635	1228640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_007705	CGGG	2	8	1228674	1228681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_007705	GAT	2	6	1228710	1228715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_007705	GCC	2	6	1228775	1228780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4623	NC_007705	CCA	2	6	1232410	1232415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4625	NC_007705	CCA	2	6	1232471	1232476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_007705	GTT	2	6	1232489	1232494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_007705	CG	3	6	1232645	1232650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_007705	CCA	2	6	1232653	1232658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_007705	GCC	2	6	1232773	1232778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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