MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	ACAA	2	8	11	18	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007507	TACA	2	8	19	26	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007507	ATAA	2	8	57	64	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007507	GAAC	2	8	142	149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007507	GAGG	2	8	2912	2919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007507	ATGC	2	8	4660	4667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007507	TTCG	2	8	6424	6431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007507	CGCA	2	8	9956	9963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007507	TCGA	2	8	10871	10878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007507	AAAC	2	8	11131	11138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007507	GCTT	2	8	15268	15275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007507	ACCG	2	8	15317	15324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007507	ATTG	2	8	15437	15444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007507	TGGC	2	8	21798	21805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007507	GTGC	2	8	21983	21990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007507	TGGC	2	8	22034	22041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007507	GGGC	2	8	28935	28942	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007507	ATCT	2	8	29284	29291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007507	GGAT	2	8	31062	31069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007507	TTGC	2	8	31401	31408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007507	CGGA	2	8	31785	31792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007507	CAAA	2	8	32485	32492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007507	GTTG	2	8	42959	42966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007507	CCTC	2	8	43055	43062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_007507	AAGG	2	8	51863	51870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007507	AACG	2	8	52350	52357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007507	GGAA	2	8	52474	52481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007507	GGGC	2	8	56161	56168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007507	AGCT	2	8	56305	56312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007507	GCGG	2	8	56508	56515	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007507	ACAG	2	8	56621	56628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007507	GGGT	2	8	58308	58315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007507	GGCC	2	8	62192	62199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007507	GGTA	2	8	62309	62316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007507	GAAC	2	8	62442	62449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007507	TTGG	2	8	64190	64197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007507	GGCC	2	8	64321	64328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007507	CGGT	2	8	64447	64454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007507	CCAT	2	8	64775	64782	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007507	GAAC	2	8	64786	64793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007507	GGAC	2	8	64882	64889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007507	AACG	2	8	67285	67292	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007507	AGCA	2	8	67329	67336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007507	TGAT	2	8	67434	67441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007507	AAGC	2	8	67553	67560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007507	TTGG	2	8	67712	67719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007507	TGAA	2	8	69680	69687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007507	CTTG	2	8	75738	75745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007507	ACGG	2	8	78725	78732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007507	CGGC	2	8	78733	78740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007507	CCCG	2	8	78869	78876	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_007507	GCCG	2	8	80377	80384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007507	CCCG	2	8	80389	80396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_007507	GCCC	2	8	85786	85793	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_007507	TTGG	2	8	94786	94793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007507	CAGC	2	8	96308	96315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007507	GGAC	2	8	99646	99653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007507	TCCT	2	8	109676	109683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007507	CCGG	2	8	109775	109782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007507	CGGA	2	8	112247	112254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007507	GCCT	2	8	115715	115722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007507	TGCC	2	8	115741	115748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007507	CTGC	2	8	116391	116398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007507	TGCG	2	8	128821	128828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007507	CGAG	2	8	129373	129380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007507	CATC	2	8	129498	129505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007507	AAAT	2	8	131849	131856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007507	GATC	2	8	135305	135312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007507	ACAG	2	8	135364	135371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007507	CTTA	2	8	135467	135474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007507	CGAG	2	8	135536	135543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007507	AGCG	2	8	137750	137757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007507	GCTC	2	8	138315	138322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007507	GCCT	2	8	138323	138330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007507	CGGG	2	8	146033	146040	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007507	CAGC	2	8	146056	146063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007507	AGCC	2	8	155452	155459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007507	CGAA	2	8	182398	182405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.