MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 14773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006834	GAT	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006834	CCA	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_006834	CAC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006834	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006834	CGC	2	6	2975	2980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006834	CTG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006834	CGG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006834	CAG	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006834	CTT	2	6	3494	3499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006834	TTG	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006834	ATC	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006834	GTT	3	9	3772	3780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006834	CCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_006834	GAC	2	6	7730	7735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006834	CGG	2	6	8683	8688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006834	TCG	2	6	9713	9718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006834	CGG	2	6	9820	9825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006834	ATC	2	6	11145	11150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006834	TCA	2	6	11916	11921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006834	TGT	2	6	13673	13678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006834	GCT	2	6	13760	13765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006834	GCA	2	6	13797	13802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006834	GCC	2	6	16487	16492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_006834	TGC	2	6	16526	16531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006834	GCA	2	6	16664	16669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_006834	TGA	3	9	16690	16698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006834	GAT	2	6	16700	16705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006834	CAG	2	6	16715	16720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_006834	CAC	2	6	16827	16832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_006834	AGC	2	6	16845	16850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006834	TCG	2	6	16889	16894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006834	CGA	2	6	17003	17008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006834	GTC	2	6	17009	17014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006834	GCT	2	6	17089	17094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006834	AGG	2	6	18148	18153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006834	GCC	2	6	18157	18162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_006834	GCT	2	6	19638	19643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006834	ACT	2	6	19651	19656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006834	AGC	2	6	19664	19669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006834	ACC	2	6	21971	21976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006834	GCC	2	6	22005	22010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_006834	CGA	2	6	22044	22049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006834	GCA	2	6	22085	22090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006834	CGC	2	6	22296	22301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006834	CGG	2	6	22373	22378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006834	GCC	2	6	22432	22437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_006834	AAC	2	6	23058	23063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006834	GTT	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006834	GCG	3	9	25373	25381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006834	TGG	2	6	26098	26103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006834	TGC	2	6	26386	26391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006834	GGC	2	6	26416	26421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006834	GGC	2	6	26506	26511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006834	CAA	2	6	26552	26557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006834	CGA	2	6	26590	26595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006834	CCA	2	6	26620	26625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006834	CGC	2	6	26670	26675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_006834	CAG	2	6	26711	26716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006834	CGG	2	6	26899	26904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006834	ACC	2	6	26920	26925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006834	GTC	2	6	26978	26983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006834	GTC	2	6	26985	26990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006834	GCG	2	6	27000	27005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006834	GCG	2	6	27433	27438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006834	GCG	2	6	27460	27465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006834	GCC	2	6	27512	27517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_006834	TGC	2	6	28806	28811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006834	CAG	2	6	28824	28829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006834	CTG	2	6	29033	29038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006834	GTG	2	6	29062	29067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006834	CCG	2	6	29086	29091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006834	CGT	2	6	29114	29119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006834	GTG	2	6	29146	29151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006834	CGC	2	6	29188	29193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_006834	AAC	2	6	29229	29234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006834	GCT	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006834	GGA	2	6	30449	30454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006834	GGC	2	6	30508	30513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006834	ATG	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006834	GGC	2	6	31028	31033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006834	GCA	2	6	31053	31058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006834	AGT	3	9	31084	31092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006834	AAC	2	6	31182	31187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006834	CAC	2	6	31189	31194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006834	GAG	2	6	31222	31227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006834	TGC	2	6	32203	32208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006834	GGC	2	6	32211	32216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006834	AAG	2	6	32283	32288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006834	TAG	2	6	34338	34343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006834	GTA	2	6	35403	35408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006834	CAG	2	6	35527	35532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006834	GGC	2	6	35627	35632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006834	CAT	2	6	35729	35734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006834	GAA	3	9	35870	35878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006834	ATG	2	6	37041	37046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006834	ACG	3	9	37108	37116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006834	TCA	2	6	37986	37991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006834	CTG	2	6	38054	38059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006834	CGT	2	6	38611	38616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006834	CTA	2	6	38716	38721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006834	CGA	2	6	38955	38960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006834	CCG	2	6	39042	39047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_006834	GCG	2	6	39048	39053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006834	CGC	2	6	39112	39117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_006834	GTA	2	6	39130	39135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006834	GCG	2	6	39186	39191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006834	GCC	2	6	39196	39201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_006834	AGC	2	6	39320	39325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006834	CAG	3	9	39367	39375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006834	GAT	2	6	39415	39420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006834	GCC	3	9	39426	39434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_006834	CGA	2	6	39459	39464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006834	CAT	2	6	39475	39480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006834	GAT	2	6	39496	39501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006834	CAA	2	6	39505	39510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006834	CAG	2	6	39565	39570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006834	GCA	2	6	39639	39644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006834	CGG	2	6	40332	40337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006834	GAC	2	6	40342	40347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006834	CTA	2	6	40390	40395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006834	GCG	2	6	40455	40460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006834	GCC	2	6	41506	41511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_006834	TGG	2	6	41519	41524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006834	CCT	2	6	41642	41647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_006834	CGA	2	6	41693	41698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006834	CGG	2	6	41730	41735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006834	GCA	2	6	41855	41860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006834	CAA	2	6	41867	41872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006834	ACA	2	6	41893	41898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006834	TGA	3	9	42635	42643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006834	GCG	2	6	43439	43444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006834	CGC	2	6	43550	43555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006834	GCG	2	6	44153	44158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006834	GCA	2	6	44339	44344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006834	GCC	2	6	44485	44490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006834	GGC	2	6	44515	44520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006834	GCA	2	6	44578	44583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006834	CGG	2	6	44655	44660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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