MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 23261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_006834	GGCT	2	8	3082607	3082614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14502	NC_006834	CGCGG	2	10	3082761	3082770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14503	NC_006834	AGC	2	6	3082788	3082793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_006834	ACGC	2	8	3082797	3082804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_006834	GCC	2	6	3082860	3082865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_006834	A	7	7	3084143	3084149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_006834	ACC	2	6	3085801	3085806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14508	NC_006834	GACT	2	8	3086881	3086888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14509	NC_006834	CGT	2	6	3086911	3086916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_006834	CGGAT	2	10	3086974	3086983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14511	NC_006834	CGG	4	12	3087039	3087050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_006834	CGG	2	6	3087055	3087060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_006834	TGC	2	6	3087076	3087081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_006834	CCA	2	6	3087176	3087181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14515	NC_006834	GCG	2	6	3087231	3087236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_006834	CGGC	2	8	3089614	3089621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_006834	CGG	2	6	3089638	3089643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_006834	ACG	2	6	3089662	3089667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_006834	CGC	2	6	3089691	3089696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14520	NC_006834	GATC	2	8	3089698	3089705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14521	NC_006834	GCA	2	6	3089736	3089741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_006834	TGC	2	6	3089861	3089866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_006834	TGC	2	6	3089945	3089950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_006834	GTGCCG	2	12	3089956	3089967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_006834	GC	3	6	3089973	3089978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14526	NC_006834	CGCAG	2	10	3089991	3090000	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14527	NC_006834	GC	3	6	3090010	3090015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14528	NC_006834	GC	3	6	3090048	3090053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14529	NC_006834	GCCG	2	8	3090060	3090067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14530	NC_006834	GAA	2	6	3090070	3090075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_006834	GCT	2	6	3090141	3090146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_006834	CA	3	6	3090242	3090247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14533	NC_006834	CTG	2	6	3090273	3090278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_006834	TCG	2	6	3090279	3090284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_006834	GCC	2	6	3090340	3090345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14536	NC_006834	GCC	2	6	3090382	3090387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14537	NC_006834	TGG	2	6	3090388	3090393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_006834	CGG	2	6	3090398	3090403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_006834	GTC	2	6	3090440	3090445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_006834	TTGA	2	8	3090449	3090456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_006834	TGCA	2	8	3090468	3090475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14542	NC_006834	AGCA	2	8	3090531	3090538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14543	NC_006834	CCA	2	6	3090568	3090573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_006834	GGTGC	2	10	3090585	3090594	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14545	NC_006834	GGC	2	6	3090617	3090622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14546	NC_006834	GCC	2	6	3090629	3090634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14547	NC_006834	GGT	2	6	3090835	3090840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_006834	TTG	2	6	3090857	3090862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_006834	GGT	2	6	3090867	3090872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_006834	GTT	2	6	3090903	3090908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_006834	A	7	7	3090993	3090999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_006834	CAT	2	6	3091801	3091806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_006834	ATG	2	6	3091814	3091819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_006834	TCT	2	6	3092378	3092383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_006834	AGA	2	6	3092407	3092412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_006834	AAT	2	6	3092446	3092451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_006834	TCAGG	2	10	3093524	3093533	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14558	NC_006834	GCC	2	6	3093581	3093586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14559	NC_006834	GAA	2	6	3093591	3093596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_006834	CCG	2	6	3093656	3093661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14561	NC_006834	CTCAT	2	10	3093698	3093707	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14562	NC_006834	TGG	2	6	3093791	3093796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_006834	CCT	2	6	3093827	3093832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14564	NC_006834	GTG	2	6	3094928	3094933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_006834	GC	3	6	3094955	3094960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14566	NC_006834	GTT	2	6	3094968	3094973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_006834	GC	4	8	3095004	3095011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14568	NC_006834	CGA	2	6	3095020	3095025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_006834	TAG	2	6	3095086	3095091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_006834	CGT	2	6	3095349	3095354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_006834	CCT	2	6	3095462	3095467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14572	NC_006834	GCG	2	6	3101973	3101978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_006834	ATCG	2	8	3102008	3102015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14574	NC_006834	GC	4	8	3102083	3102090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14575	NC_006834	GTT	2	6	3102098	3102103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_006834	CATC	2	8	3102109	3102116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14577	NC_006834	ACC	2	6	3102137	3102142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14578	NC_006834	GGCCG	2	10	3102233	3102242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14579	NC_006834	CCG	2	6	3102249	3102254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14580	NC_006834	GCCAGC	2	12	3102315	3102326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14581	NC_006834	GCA	2	6	3103570	3103575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_006834	TGA	2	6	3103593	3103598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_006834	CCG	2	6	3103642	3103647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_006834	CGA	2	6	3103720	3103725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_006834	CAG	3	9	3103755	3103763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_006834	GCCG	2	8	3103782	3103789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14587	NC_006834	GGC	2	6	3103809	3103814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_006834	CG	4	8	3103826	3103833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14589	NC_006834	TGG	2	6	3103847	3103852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_006834	GT	3	6	3103900	3103905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_006834	GAT	2	6	3103911	3103916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_006834	GCC	2	6	3103952	3103957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14593	NC_006834	GAT	2	6	3104033	3104038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_006834	CGG	2	6	3104065	3104070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_006834	CCA	2	6	3104077	3104082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14596	NC_006834	GGT	2	6	3104186	3104191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_006834	CA	3	6	3104221	3104226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14598	NC_006834	GC	3	6	3104287	3104292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14599	NC_006834	GGC	2	6	3104306	3104311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_006834	A	6	6	3104312	3104317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_006834	GCGA	2	8	3104347	3104354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14602	NC_006834	CAC	2	6	3104357	3104362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14603	NC_006834	ACC	2	6	3104370	3104375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14604	NC_006834	GCA	2	6	3104404	3104409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14605	NC_006834	CAG	2	6	3104455	3104460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_006834	GGC	2	6	3104471	3104476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14607	NC_006834	GCT	2	6	3104574	3104579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_006834	CTG	2	6	3104580	3104585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14609	NC_006834	GTT	2	6	3104597	3104602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_006834	CGA	2	6	3104611	3104616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_006834	AGC	2	6	3104629	3104634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_006834	GC	3	6	3104677	3104682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14613	NC_006834	CAGCG	2	10	3104692	3104701	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14614	NC_006834	GTA	2	6	3104705	3104710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_006834	GTC	2	6	3104764	3104769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_006834	GC	3	6	3104803	3104808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14617	NC_006834	GGC	2	6	3104849	3104854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_006834	ACC	2	6	3105073	3105078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14619	NC_006834	CAG	2	6	3105141	3105146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_006834	CG	3	6	3105186	3105191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_006834	GCT	2	6	3105689	3105694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_006834	GCG	2	6	3107643	3107648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_006834	A	6	6	3107708	3107713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_006834	TCC	2	6	3107800	3107805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14625	NC_006834	CGA	2	6	3107810	3107815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_006834	CCG	2	6	3108423	3108428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14627	NC_006834	CCT	2	6	3114064	3114069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14628	NC_006834	TGG	2	6	3114728	3114733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_006834	GCA	2	6	3114819	3114824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14630	NC_006834	GCC	2	6	3115089	3115094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14631	NC_006834	TGC	2	6	3115098	3115103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_006834	GCA	2	6	3115151	3115156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14633	NC_006834	CGT	2	6	3115201	3115206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14636	NC_006834	CCTGA	2	10	3115297	3115306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14637	NC_006834	GA	3	6	3115305	3115310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14638	NC_006834	CTCC	2	8	3115334	3115341	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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14640	NC_006834	GCC	2	6	3116040	3116045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14642	NC_006834	CA	3	6	3116221	3116226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14643	NC_006834	CTG	2	6	3116279	3116284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14667	NC_006834	GCCT	2	8	3122493	3122500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14999	NC_006834	ACGA	2	8	3201129	3201136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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