MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 23261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_006834	AACC	2	8	3006082	3006089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_006834	A	7	7	3006093	3006099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_006834	AGC	2	6	3006115	3006120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_006834	TAA	3	9	3006130	3006138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_006834	ATC	2	6	3006183	3006188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_006834	ATA	3	9	3006198	3006206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_006834	AAG	2	6	3006224	3006229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_006834	CTA	2	6	3006355	3006360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_006834	TCA	2	6	3006372	3006377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_006834	AC	3	6	3006446	3006451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_006834	TTTCA	2	10	3006458	3006467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14012	NC_006834	GCC	2	6	3006480	3006485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_006834	GCG	2	6	3006495	3006500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_006834	GCT	2	6	3006516	3006521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_006834	A	8	8	3006566	3006573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_006834	CAG	2	6	3006577	3006582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_006834	T	7	7	3006588	3006594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_006834	CAT	2	6	3006650	3006655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_006834	ATTTT	2	10	3006666	3006675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_006834	CTAA	2	8	3006677	3006684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14021	NC_006834	CAT	2	6	3006725	3006730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_006834	CCA	2	6	3006898	3006903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14023	NC_006834	TCC	2	6	3006955	3006960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_006834	GCT	2	6	3006976	3006981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_006834	GATT	2	8	3007017	3007024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_006834	CT	4	8	3007037	3007044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14027	NC_006834	AATG	2	8	3007125	3007132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_006834	A	6	6	3007184	3007189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_006834	ACCC	2	8	3007208	3007215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14030	NC_006834	CCAC	2	8	3007218	3007225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14031	NC_006834	GAA	2	6	3007266	3007271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_006834	TGC	2	6	3007295	3007300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_006834	CCA	2	6	3007331	3007336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_006834	CG	3	6	3007349	3007354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14035	NC_006834	CAG	2	6	3007374	3007379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_006834	GCT	2	6	3007440	3007445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_006834	CAT	2	6	3007520	3007525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_006834	CCT	2	6	3007609	3007614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_006834	GC	4	8	3007651	3007658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_006834	TCA	2	6	3007660	3007665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_006834	GCC	2	6	3007806	3007811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_006834	CTT	2	6	3007853	3007858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_006834	TCG	2	6	3007870	3007875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_006834	AC	3	6	3007882	3007887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14045	NC_006834	ACCGGC	2	12	3007892	3007903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14046	NC_006834	CTC	2	6	3007959	3007964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14047	NC_006834	CCA	2	6	3007988	3007993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_006834	CAG	2	6	3008001	3008006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_006834	TGA	2	6	3008099	3008104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_006834	CCT	2	6	3008105	3008110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14051	NC_006834	CGT	2	6	3008141	3008146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_006834	TCC	2	6	3008149	3008154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14053	NC_006834	TGCG	2	8	3008200	3008207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14054	NC_006834	CGC	2	6	3008227	3008232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14055	NC_006834	CGT	2	6	3008299	3008304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_006834	GCA	2	6	3008340	3008345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_006834	CG	4	8	3008375	3008382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14058	NC_006834	GGA	2	6	3008385	3008390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_006834	CGTG	2	8	3008399	3008406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_006834	GCC	2	6	3008442	3008447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_006834	TCC	2	6	3008467	3008472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_006834	CCG	2	6	3008513	3008518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_006834	CGT	2	6	3008615	3008620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_006834	CAG	2	6	3008670	3008675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_006834	TGGC	2	8	3008719	3008726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14066	NC_006834	CA	3	6	3008729	3008734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_006834	GC	3	6	3008736	3008741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14068	NC_006834	TGC	2	6	3008749	3008754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_006834	CA	4	8	3008829	3008836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_006834	GCC	2	6	3008848	3008853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_006834	CGC	2	6	3008869	3008874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14072	NC_006834	GGCCCC	2	12	3011572	3011583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_006834	GCC	3	9	3011584	3011592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14074	NC_006834	CGT	2	6	3011610	3011615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_006834	CAC	2	6	3011647	3011652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_006834	CCA	2	6	3011682	3011687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14077	NC_006834	GCA	2	6	3011709	3011714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_006834	CGC	2	6	3011718	3011723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14079	NC_006834	TCA	2	6	3011748	3011753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_006834	C	6	6	3011801	3011806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14081	NC_006834	GC	3	6	3011817	3011822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14082	NC_006834	GGT	2	6	3011868	3011873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_006834	CGA	2	6	3011928	3011933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_006834	CCG	2	6	3012036	3012041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_006834	CCG	2	6	3012065	3012070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14086	NC_006834	CGG	2	6	3012088	3012093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_006834	GCG	2	6	3012096	3012101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_006834	GCCACC	2	12	3012107	3012118	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_006834	TTG	2	6	3012164	3012169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_006834	GCC	2	6	3012212	3012217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14091	NC_006834	GCC	2	6	3012264	3012269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_006834	CCCTGG	2	12	3012275	3012286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_006834	GCC	2	6	3012296	3012301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_006834	CTG	2	6	3012304	3012309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_006834	CTG	3	9	3012319	3012327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_006834	CG	3	6	3012328	3012333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14097	NC_006834	CGG	2	6	3012372	3012377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_006834	GCG	2	6	3012408	3012413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_006834	GGCTGC	2	12	3012438	3012449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_006834	CG	3	6	3012481	3012486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14101	NC_006834	CTG	2	6	3012508	3012513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_006834	GAA	2	6	3013738	3013743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_006834	ACG	2	6	3013793	3013798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_006834	GC	3	6	3013824	3013829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_006834	CTG	2	6	3013846	3013851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_006834	CAC	2	6	3013864	3013869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14107	NC_006834	TGGC	2	8	3013870	3013877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14108	NC_006834	GT	3	6	3013886	3013891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_006834	GC	3	6	3013968	3013973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14110	NC_006834	GGC	2	6	3014040	3014045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_006834	CTG	2	6	3014053	3014058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_006834	GCGA	2	8	3014098	3014105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14113	NC_006834	GATC	2	8	3014154	3014161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14114	NC_006834	CAGG	2	8	3014169	3014176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14115	NC_006834	TCG	2	6	3014177	3014182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_006834	CGG	2	6	3014237	3014242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_006834	GGC	2	6	3014246	3014251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_006834	GGTC	2	8	3014291	3014298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14119	NC_006834	GCA	2	6	3014348	3014353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_006834	GCG	2	6	3014388	3014393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_006834	CG	4	8	3014424	3014431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14122	NC_006834	GGAGCA	2	12	3014444	3014455	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14123	NC_006834	CGG	2	6	3014459	3014464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_006834	GC	4	8	3014498	3014505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14125	NC_006834	TCC	2	6	3014517	3014522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_006834	GCT	2	6	3014555	3014560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_006834	GA	3	6	3014584	3014589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_006834	ACG	2	6	3014598	3014603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_006834	GGC	2	6	3014669	3014674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_006834	GGA	2	6	3014747	3014752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_006834	ACG	2	6	3014755	3014760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_006834	CG	3	6	3015729	3015734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14133	NC_006834	TG	3	6	3015737	3015742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_006834	CGC	2	6	3015743	3015748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14135	NC_006834	TTC	2	6	3015827	3015832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14136	NC_006834	TTG	2	6	3015849	3015854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_006834	GAA	2	6	3015867	3015872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14138	NC_006834	GC	3	6	3015876	3015881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14139	NC_006834	AGA	2	6	3015912	3015917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_006834	GAA	2	6	3017218	3017223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_006834	ATT	2	6	3017993	3017998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_006834	T	6	6	3017997	3018002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_006834	GTA	2	6	3018017	3018022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_006834	TCA	3	9	3018024	3018032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14145	NC_006834	AGA	2	6	3018042	3018047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14146	NC_006834	AATTG	2	10	3018124	3018133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14147	NC_006834	CGC	2	6	3018134	3018139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14150	NC_006834	A	6	6	3018347	3018352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14151	NC_006834	T	6	6	3018427	3018432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_006834	GTA	2	6	3018470	3018475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14157	NC_006834	AAGG	2	8	3018623	3018630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14162	NC_006834	CCT	2	6	3019724	3019729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14191	NC_006834	TGCT	2	8	3023617	3023624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14235	NC_006834	TATC	2	8	3028997	3029004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14242	NC_006834	CCG	2	6	3032622	3032627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14243	NC_006834	CGC	2	6	3035388	3035393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14244	NC_006834	CAG	2	6	3035420	3035425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14245	NC_006834	GTT	2	6	3035551	3035556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_006834	CCA	2	6	3035558	3035563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14247	NC_006834	GCTG	2	8	3035625	3035632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14248	NC_006834	GC	3	6	3035762	3035767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14249	NC_006834	A	7	7	3035808	3035814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14250	NC_006834	CT	3	6	3035873	3035878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14251	NC_006834	GCCT	2	8	3035897	3035904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14252	NC_006834	CGG	2	6	3035920	3035925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14253	NC_006834	GACCT	2	10	3035972	3035981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14254	NC_006834	GCC	2	6	3036021	3036026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14255	NC_006834	GC	3	6	3037061	3037066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14256	NC_006834	GC	3	6	3037163	3037168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14257	NC_006834	CGA	2	6	3037207	3037212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14362	NC_006834	TGG	2	6	3057398	3057403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14369	NC_006834	CG	3	6	3058442	3058447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14370	NC_006834	ACCC	2	8	3058469	3058476	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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14375	NC_006834	GTC	2	6	3059075	3059080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14378	NC_006834	AATCCG	2	12	3059209	3059220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14380	NC_006834	GA	3	6	3060758	3060763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14381	NC_006834	CGG	2	6	3060793	3060798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14382	NC_006834	CA	3	6	3060829	3060834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14384	NC_006834	TGC	2	6	3060903	3060908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14385	NC_006834	TTG	2	6	3060917	3060922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14386	NC_006834	C	7	7	3060923	3060929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14387	NC_006834	CG	3	6	3061284	3061289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14389	NC_006834	CAA	2	6	3061355	3061360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14496	NC_006834	G	6	6	3077581	3077586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14497	NC_006834	CGA	2	6	3079309	3079314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14498	NC_006834	GCG	2	6	3080322	3080327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14499	NC_006834	GCAGC	2	10	3082559	3082568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14500	NC_006834	GCA	2	6	3082579	3082584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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