MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 23261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006834	GCC	2	6	118967	118972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_006834	GA	3	6	119012	119017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006834	CA	3	6	119089	119094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_006834	CCA	2	6	119111	119116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_006834	GTG	2	6	119300	119305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006834	GCT	2	6	119321	119326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_006834	ACT	2	6	119358	119363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_006834	GC	3	6	119433	119438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_006834	GCT	2	6	119458	119463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_006834	GC	3	6	121849	121854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_006834	CTT	2	6	121857	121862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_006834	CAA	2	6	121876	121881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_006834	GAA	2	6	121898	121903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006834	AATCCG	2	12	121951	121962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_006834	ATGG	2	8	123469	123476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006834	GC	3	6	123546	123551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_006834	CTG	2	6	123565	123570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_006834	CAG	2	6	123624	123629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_006834	GTTG	2	8	123636	123643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006834	AT	3	6	123675	123680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006834	AGA	2	6	127741	127746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006834	TAT	2	6	129336	129341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_006834	GGC	2	6	129351	129356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_006834	CGACC	2	10	129374	129383	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
525	NC_006834	TGG	2	6	129437	129442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006834	GC	3	6	129451	129456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_006834	CGG	2	6	129473	129478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_006834	TGG	2	6	129482	129487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006834	CGG	2	6	129698	129703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_006834	CGG	2	6	129743	129748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006834	GATC	2	8	129790	129797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_006834	TGA	2	6	129850	129855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006834	T	6	6	129863	129868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_006834	TCG	2	6	129891	129896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_006834	ACGG	2	8	129912	129919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_006834	TGCT	2	8	129975	129982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_006834	GAG	2	6	130034	130039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006834	CCG	2	6	130054	130059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_006834	GTC	2	6	130093	130098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_006834	GCG	3	9	130398	130406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_006834	GCC	2	6	130438	130443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_006834	CA	3	6	130493	130498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_006834	GCG	2	6	130539	130544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_006834	CGCC	2	8	130583	130590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
545	NC_006834	CTG	2	6	130609	130614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006834	GCCGT	2	10	130633	130642	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
547	NC_006834	AGTGC	2	10	130656	130665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
548	NC_006834	GAT	2	6	130704	130709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006834	GCG	2	6	130755	130760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_006834	CGG	2	6	130767	130772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_006834	GATTG	2	10	130796	130805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006834	GGCCT	2	10	130823	130832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
553	NC_006834	GCC	2	6	130894	130899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_006834	CCG	2	6	130995	131000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_006834	CAG	2	6	131098	131103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_006834	TGA	2	6	131147	131152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006834	CG	3	6	131180	131185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_006834	GC	4	8	131202	131209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_006834	CCT	2	6	131351	131356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_006834	CTGGC	2	10	131359	131368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
561	NC_006834	CG	3	6	131383	131388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_006834	GAC	2	6	131414	131419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_006834	GCA	2	6	131519	131524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006834	TGCC	2	8	131578	131585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_006834	GCCT	2	8	131588	131595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_006834	AC	3	6	131654	131659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_006834	GCG	2	6	133125	133130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_006834	T	7	7	133170	133176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006834	CGG	2	6	133235	133240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_006834	AAC	2	6	133260	133265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_006834	GC	3	6	133299	133304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_006834	GCC	2	6	133361	133366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_006834	AGCGC	2	10	133375	133384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
574	NC_006834	GCG	2	6	133966	133971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_006834	CAA	2	6	133979	133984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006834	GCC	2	6	133999	134004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_006834	CGGG	2	8	134036	134043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
578	NC_006834	GC	3	6	134069	134074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_006834	GCG	2	6	134100	134105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_006834	GTC	3	9	134521	134529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_006834	GGC	2	6	134535	134540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006834	GAG	2	6	134556	134561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006834	TTG	2	6	134573	134578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006834	CGCAT	2	10	134581	134590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
585	NC_006834	CGAG	2	8	134595	134602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_006834	CGT	2	6	134604	134609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_006834	CGA	2	6	134689	134694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_006834	CTG	2	6	134716	134721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_006834	GCA	2	6	134753	134758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_006834	CTG	2	6	134784	134789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_006834	GTT	2	6	134861	134866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006834	GCG	2	6	134887	134892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006834	CG	3	6	136244	136249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_006834	ACG	2	6	136285	136290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006834	GCC	2	6	136326	136331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_006834	GCG	3	9	136334	136342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_006834	ACA	2	6	136343	136348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_006834	GT	3	6	136353	136358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006834	CGC	2	6	136391	136396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_006834	TTAA	2	8	136614	136621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_006834	AAT	2	6	136625	136630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006834	TG	3	6	136695	136700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006834	GTTG	2	8	136751	136758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_006834	AAC	2	6	136810	136815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006834	ATC	2	6	136855	136860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_006834	GTT	2	6	137941	137946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006834	CCTT	2	8	137951	137958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_006834	GCG	2	6	137972	137977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_006834	A	6	6	137997	138002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006834	TGA	2	6	138018	138023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006834	GCA	3	9	138100	138108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_006834	GTTGG	2	10	138198	138207	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006834	CTT	2	6	138285	138290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006834	TGA	2	6	138306	138311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006834	GAG	2	6	138314	138319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006834	TCCT	2	8	138409	138416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
617	NC_006834	GA	3	6	138443	138448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006834	A	6	6	138448	138453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006834	GC	3	6	138491	138496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_006834	AGG	2	6	138549	138554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_006834	GTC	2	6	138564	138569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006834	GGC	2	6	138605	138610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_006834	CA	3	6	138703	138708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_006834	TGCA	2	8	138775	138782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_006834	CGC	2	6	138855	138860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_006834	GCG	2	6	140565	140570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_006834	CAG	2	6	140574	140579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_006834	CTT	2	6	140659	140664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_006834	GAT	2	6	140683	140688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006834	TCGC	2	8	140766	140773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_006834	GC	3	6	140779	140784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_006834	CG	3	6	140789	140794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_006834	GCCGGT	2	12	140834	140845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_006834	GCCG	2	8	140855	140862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_006834	CGA	2	6	140926	140931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_006834	TGG	2	6	140937	140942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006834	GCA	2	6	140968	140973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_006834	CCTGC	2	10	141004	141013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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640	NC_006834	CCA	2	6	141081	141086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_006834	TCC	2	6	141101	141106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_006834	CCG	2	6	141120	141125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_006834	TCC	2	6	141172	141177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_006834	CG	3	6	141207	141212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_006834	TGG	3	9	141221	141229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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651	NC_006834	GC	3	6	141459	141464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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661	NC_006834	GC	3	6	142612	142617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
662	NC_006834	GTT	2	6	142624	142629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_006834	GGTG	2	8	143257	143264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
664	NC_006834	CGG	2	6	143726	143731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_006834	TGG	2	6	143751	143756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
666	NC_006834	TGT	2	6	143983	143988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_006834	GCA	2	6	144295	144300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_006834	CTTAT	2	10	144375	144384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
674	NC_006834	AGAA	2	8	144392	144399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
675	NC_006834	CAG	2	6	144457	144462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_006834	ACG	3	9	153274	153282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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773	NC_006834	AAG	2	6	153502	153507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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779	NC_006834	GC	4	8	155037	155044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
780	NC_006834	GCG	2	6	155092	155097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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