MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 23261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006834	CGC	2	6	1090521	1090526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_006834	GCG	2	6	1090536	1090541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_006834	GCG	2	6	1090566	1090571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_006834	TCT	2	6	1096907	1096912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_006834	CGT	2	6	1096914	1096919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_006834	CTG	2	6	1096921	1096926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_006834	GAG	2	6	1096953	1096958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_006834	A	7	7	1096988	1096994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_006834	CAA	2	6	1097086	1097091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_006834	TGC	2	6	1097104	1097109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_006834	CACT	2	8	1097181	1097188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_006834	GTTG	2	8	1097189	1097196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_006834	GTG	2	6	1097226	1097231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_006834	A	6	6	1097285	1097290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_006834	CCT	2	6	1097291	1097296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_006834	AGCC	2	8	1097298	1097305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_006834	CTG	2	6	1097361	1097366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_006834	TGGA	2	8	1097389	1097396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_006834	GCC	2	6	1097499	1097504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_006834	GCTGG	2	10	1097505	1097514	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5521	NC_006834	CTGG	2	8	1097534	1097541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_006834	CGG	2	6	1097609	1097614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_006834	CCA	2	6	1097638	1097643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_006834	TCG	2	6	1097731	1097736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_006834	CGC	2	6	1097783	1097788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_006834	CGA	2	6	1097852	1097857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_006834	GAC	2	6	1097868	1097873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_006834	GCC	2	6	1097987	1097992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_006834	CG	3	6	1097998	1098003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_006834	CTG	2	6	1098030	1098035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_006834	GC	4	8	1098078	1098085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_006834	TGA	2	6	1098155	1098160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_006834	GCT	2	6	1098164	1098169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_006834	GCC	2	6	1098237	1098242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_006834	AGC	2	6	1098924	1098929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_006834	CCGT	2	8	1098950	1098957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_006834	GGCG	2	8	1098972	1098979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_006834	GC	3	6	1099029	1099034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_006834	GCT	2	6	1099054	1099059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_006834	GTT	2	6	1099068	1099073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_006834	GCC	2	6	1099207	1099212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_006834	CGCCA	2	10	1099323	1099332	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5543	NC_006834	CGC	2	6	1099354	1099359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_006834	GCG	2	6	1099360	1099365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_006834	GCT	2	6	1099378	1099383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_006834	GCC	2	6	1099388	1099393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_006834	TGGG	2	8	1100193	1100200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_006834	GCC	2	6	1100258	1100263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_006834	TCG	2	6	1100289	1100294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_006834	GC	3	6	1100311	1100316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_006834	TG	3	6	1100317	1100322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_006834	TGTGG	2	10	1100395	1100404	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_006834	CGGC	2	8	1100434	1100441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_006834	GC	3	6	1100458	1100463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_006834	TCGG	2	8	1100481	1100488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_006834	CGT	2	6	1100500	1100505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_006834	CTGCG	2	10	1100537	1100546	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5558	NC_006834	TTGG	2	8	1100567	1100574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_006834	TCCA	2	8	1100575	1100582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_006834	GC	3	6	1101440	1101445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_006834	CGG	2	6	1101523	1101528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_006834	TGC	2	6	1101536	1101541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_006834	GTT	2	6	1101603	1101608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_006834	GT	3	6	1101624	1101629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_006834	TCA	2	6	1101702	1101707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_006834	TGA	2	6	1101726	1101731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_006834	CGA	2	6	1101775	1101780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_006834	AAC	2	6	1101794	1101799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_006834	GC	3	6	1101833	1101838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_006834	GCT	2	6	1101922	1101927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_006834	ACC	2	6	1101983	1101988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_006834	GGC	2	6	1102002	1102007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_006834	AGT	2	6	1103727	1103732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_006834	CGGCG	2	10	1103761	1103770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5575	NC_006834	CGC	2	6	1103885	1103890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_006834	CGCT	2	8	1103926	1103933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_006834	GCA	2	6	1103956	1103961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_006834	GCC	2	6	1104302	1104307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_006834	GCG	2	6	1104338	1104343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_006834	GA	3	6	1104418	1104423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_006834	GCA	2	6	1104471	1104476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_006834	CAG	2	6	1104485	1104490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_006834	ACC	2	6	1104509	1104514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_006834	GAA	2	6	1104521	1104526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_006834	CT	3	6	1104543	1104548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_006834	GCG	2	6	1104624	1104629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_006834	GC	3	6	1104640	1104645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_006834	CGA	2	6	1104671	1104676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_006834	CGC	2	6	1104832	1104837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5591	NC_006834	TGT	2	6	1104934	1104939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_006834	GCA	2	6	1104941	1104946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_006834	GC	3	6	1104966	1104971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_006834	TGCA	2	8	1104996	1105003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_006834	ACGTC	2	10	1105054	1105063	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5596	NC_006834	CGA	2	6	1105073	1105078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_006834	CG	3	6	1105084	1105089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_006834	GCTG	2	8	1105184	1105191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_006834	TCA	2	6	1105261	1105266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_006834	AGC	2	6	1105366	1105371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_006834	GCT	2	6	1105406	1105411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_006834	CGGC	2	8	1105438	1105445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_006834	GCA	2	6	1105446	1105451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_006834	ACGG	2	8	1105484	1105491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_006834	CG	3	6	1105494	1105499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_006834	GAAG	2	8	1105613	1105620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_006834	GCC	2	6	1105636	1105641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5608	NC_006834	TCG	2	6	1105654	1105659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5610	NC_006834	AG	3	6	1105845	1105850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_006834	A	6	6	1105855	1105860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_006834	CAA	2	6	1105869	1105874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_006834	CTT	2	6	1106581	1106586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_006834	GCC	2	6	1106653	1106658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_006834	GCA	2	6	1106661	1106666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5617	NC_006834	AC	3	6	1108205	1108210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_006834	GTC	2	6	1108286	1108291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_006834	GCC	2	6	1109949	1109954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_006834	TGT	2	6	1109982	1109987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_006834	GCA	2	6	1109988	1109993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5623	NC_006834	GGTG	2	8	1110180	1110187	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_006834	GCC	3	9	1110266	1110274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_006834	GGC	2	6	1111499	1111504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5627	NC_006834	CAT	2	6	1111548	1111553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_006834	TAA	2	6	1112343	1112348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_006834	AGC	2	6	1112358	1112363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_006834	GC	3	6	1112383	1112388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_006834	GCCT	2	8	1112439	1112446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_006834	CGT	2	6	1112458	1112463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_006834	GGCG	2	8	1112514	1112521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5634	NC_006834	GTG	2	6	1112535	1112540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_006834	CGA	2	6	1112590	1112595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5641	NC_006834	GC	3	6	1113610	1113615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5645	NC_006834	ACCGC	2	10	1118071	1118080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5646	NC_006834	AATA	2	8	1118100	1118107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5653	NC_006834	CAGG	2	8	1123383	1123390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5665	NC_006834	CCG	2	6	1130208	1130213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5666	NC_006834	TGC	2	6	1132517	1132522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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