MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 chromosome

Total Repeats: 23261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006834	GT	3	6	861809	861814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_006834	CA	3	6	861834	861839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_006834	CTTTTC	2	12	861909	861920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_006834	A	6	6	861986	861991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_006834	TAA	2	6	861994	861999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_006834	TGA	2	6	862015	862020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_006834	ATG	2	6	862066	862071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_006834	ACCA	2	8	862121	862128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_006834	CGC	2	6	862150	862155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_006834	GC	3	6	862166	862171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_006834	GTG	2	6	862178	862183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_006834	GTG	2	6	862212	862217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_006834	CAA	2	6	862235	862240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_006834	CGG	2	6	866074	866079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_006834	GGCC	2	8	866138	866145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_006834	GCTG	2	8	866228	866235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_006834	GAC	2	6	866265	866270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_006834	TGA	2	6	866323	866328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_006834	GCC	2	6	866358	866363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_006834	CTG	2	6	866370	866375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_006834	CGGC	2	8	866401	866408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_006834	ACA	2	6	866446	866451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_006834	GCT	2	6	866454	866459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_006834	GCA	3	9	866470	866478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_006834	TGG	2	6	866513	866518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_006834	AGC	2	6	866535	866540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_006834	CCG	2	6	866617	866622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_006834	GGT	3	9	866636	866644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_006834	GAA	2	6	866651	866656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_006834	CCGT	2	8	866661	866668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_006834	TGC	2	6	866692	866697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_006834	GCC	3	9	866724	866732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_006834	GCA	2	6	866774	866779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_006834	CGG	2	6	866804	866809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_006834	GTG	3	9	866853	866861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_006834	TCA	2	6	866932	866937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_006834	CGT	2	6	866955	866960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_006834	GC	3	6	866970	866975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_006834	AGG	2	6	867007	867012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_006834	TGGC	2	8	867115	867122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_006834	GCG	2	6	867169	867174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_006834	CGG	2	6	867215	867220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_006834	TCA	2	6	867261	867266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_006834	GCG	3	9	867279	867287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_006834	CAC	2	6	867340	867345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_006834	GTG	2	6	867347	867352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_006834	ACG	2	6	867366	867371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_006834	CGA	2	6	867373	867378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_006834	CGG	2	6	867442	867447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_006834	GCA	2	6	867471	867476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_006834	GCG	2	6	867498	867503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_006834	CCG	2	6	867565	867570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_006834	TA	3	6	867589	867594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_006834	GGC	2	6	867601	867606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_006834	TGGC	2	8	867629	867636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_006834	GCG	2	6	867658	867663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_006834	GCT	2	6	867708	867713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_006834	AAG	2	6	867715	867720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_006834	CCG	2	6	867745	867750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_006834	TCG	2	6	867776	867781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_006834	CAA	2	6	867867	867872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_006834	GCG	2	6	867893	867898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_006834	CCG	2	6	867899	867904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_006834	TCA	2	6	867956	867961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_006834	CGG	2	6	867966	867971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_006834	ACG	2	6	868028	868033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_006834	CCCG	2	8	868043	868050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4568	NC_006834	TAC	2	6	868096	868101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_006834	GCG	2	6	868117	868122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_006834	AGTA	2	8	868154	868161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_006834	TGCG	2	8	868227	868234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_006834	CCG	2	6	870078	870083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_006834	TGCG	2	8	870107	870114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_006834	GC	5	10	871497	871506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_006834	GC	4	8	871523	871530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_006834	GTC	2	6	871543	871548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4580	NC_006834	TTG	2	6	880353	880358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_006834	GTC	2	6	880372	880377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_006834	ACC	2	6	880443	880448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4584	NC_006834	CAC	2	6	880519	880524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_006834	CATC	2	8	880528	880535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_006834	GCG	2	6	881377	881382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_006834	AGA	2	6	881452	881457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4589	NC_006834	AGC	2	6	882361	882366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4593	NC_006834	CGCAT	2	10	885918	885927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4594	NC_006834	GCG	2	6	885941	885946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_006834	CAA	2	6	885999	886004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4598	NC_006834	GCC	2	6	886110	886115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_006834	CGCC	2	8	886118	886125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4600	NC_006834	TGG	2	6	886126	886131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_006834	CGG	2	6	886182	886187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_006834	GCC	2	6	886230	886235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_006834	CTGC	2	8	886257	886264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_006834	GCCC	2	8	886290	886297	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4605	NC_006834	CGC	2	6	886416	886421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_006834	CGT	2	6	886422	886427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_006834	AGC	3	9	886441	886449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_006834	TGCC	2	8	886458	886465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_006834	CGG	2	6	888839	888844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_006834	ACA	2	6	888845	888850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_006834	TAC	2	6	889126	889131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_006834	GGA	2	6	889179	889184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_006834	CGC	2	6	889238	889243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_006834	GACGC	2	10	889291	889300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4615	NC_006834	CAG	2	6	889364	889369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_006834	GTC	2	6	889441	889446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4619	NC_006834	GT	3	6	889569	889574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_006834	CG	3	6	889590	889595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4623	NC_006834	GC	3	6	889777	889782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_006834	GACGC	2	10	889882	889891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4625	NC_006834	CGTG	2	8	889907	889914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_006834	AGT	2	6	889980	889985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4630	NC_006834	GGT	2	6	890308	890313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_006834	GGTG	2	8	890356	890363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_006834	AGT	2	6	890508	890513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4634	NC_006834	GACGC	2	10	890736	890745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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