MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 1745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004556	AAAT	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004556	TTTA	2	8	2998	3005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004556	TTTC	2	8	9012	9019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004556	TTTA	2	8	10364	10371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004556	CAAT	2	8	10500	10507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004556	AATC	2	8	13105	13112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004556	ATAC	2	8	13247	13254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004556	AAAG	2	8	13419	13426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004556	GCAG	2	8	18145	18152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004556	TCCT	2	8	18255	18262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004556	CTGC	2	8	18417	18424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004556	CAAT	2	8	18794	18801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004556	GTGG	2	8	19715	19722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004556	TCAG	2	8	19998	20005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004556	GTCA	2	8	20588	20595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004556	CAAC	2	8	20755	20762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004556	AGTT	2	8	21549	21556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004556	AATA	3	12	31895	31906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004556	TCGA	2	8	32118	32125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004556	GGGC	2	8	32687	32694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004556	TGTT	2	8	32704	32711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004556	TGCG	2	8	34365	34372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004556	GATT	2	8	38996	39003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004556	ATCA	2	8	39055	39062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004556	GTGA	2	8	39747	39754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004556	AGGC	2	8	39776	39783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_004556	TGCA	2	8	43729	43736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004556	GATA	2	8	43823	43830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004556	CTTT	2	8	43840	43847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004556	ACAT	2	8	43917	43924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004556	GAAT	2	8	46496	46503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004556	ATTC	2	8	48829	48836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004556	AATT	2	8	49207	49214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004556	GTGA	2	8	49345	49352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004556	AAGC	2	8	49359	49366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004556	GATA	2	8	49660	49667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004556	TCCC	2	8	49681	49688	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_004556	TTTC	2	8	49791	49798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004556	GATA	2	8	51817	51824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004556	TGGT	2	8	51895	51902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004556	AAAT	2	8	52288	52295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004556	TCAA	2	8	52310	52317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004556	ACTC	2	8	52720	52727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004556	GATT	2	8	52766	52773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004556	GCTT	2	8	52980	52987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_004556	GATT	2	8	54642	54649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004556	GATT	2	8	55878	55885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004556	AGTC	2	8	56367	56374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004556	AAAT	2	8	56631	56638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004556	ATCA	2	8	58933	58940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004556	TCTT	2	8	59046	59053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004556	GTCA	2	8	60407	60414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004556	TTGC	2	8	62208	62215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004556	GTCT	2	8	62482	62489	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004556	AATC	2	8	62555	62562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004556	GATT	2	8	62700	62707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004556	ATTA	2	8	62797	62804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004556	TTAT	2	8	62939	62946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004556	ATAA	2	8	62952	62959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004556	AAGG	2	8	63914	63921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004556	CTAT	2	8	64030	64037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004556	CCGT	2	8	64068	64075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004556	GAAT	2	8	64386	64393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004556	ATTT	2	8	64475	64482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004556	AAGT	2	8	65015	65022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004556	CGAT	2	8	65080	65087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004556	TAAG	2	8	65659	65666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004556	GACC	2	8	68473	68480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004556	CGTC	2	8	68991	68998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004556	AAAG	2	8	69114	69121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004556	GTTG	2	8	69481	69488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004556	AGGT	2	8	69648	69655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004556	GTTT	2	8	71214	71221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004556	CTGG	2	8	74657	74664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004556	GGTT	2	8	77533	77540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004556	ATTA	2	8	77625	77632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004556	GATA	2	8	77805	77812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004556	TAAA	2	8	77916	77923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004556	TTGA	2	8	77948	77955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004556	TAGT	2	8	78521	78528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004556	CATA	2	8	78971	78978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004556	ATGA	2	8	82575	82582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004556	ACGT	2	8	82616	82623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004556	TATT	2	8	83379	83386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004556	GTAT	2	8	83399	83406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004556	TGAT	2	8	83452	83459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004556	TAAT	2	8	83553	83560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004556	AAAG	2	8	83913	83920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004556	TTTG	2	8	84171	84178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004556	AAGT	2	8	84244	84251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004556	TTGC	2	8	84277	84284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_004556	CTAA	2	8	84332	84339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004556	GCAG	2	8	84346	84353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004556	GCAG	2	8	84430	84437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004556	TGCT	2	8	84537	84544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004556	ACTT	2	8	84600	84607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004556	GTTT	2	8	88417	88424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004556	TTGT	2	8	94517	94524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004556	CCCT	2	8	96602	96609	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_004556	GTAA	2	8	97072	97079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004556	CGTG	2	8	97291	97298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004556	ATGC	2	8	101236	101243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004556	TTCA	2	8	106919	106926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004556	ACCT	2	8	108054	108061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004556	TCAG	2	8	110067	110074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004556	CAAA	2	8	111658	111665	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_004556	ATGC	2	8	114906	114913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004556	ACTG	2	8	115132	115139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004556	ATGA	2	8	116556	116563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004556	GCCT	2	8	117718	117725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004556	GACG	2	8	118961	118968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004556	TTCG	2	8	119192	119199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004556	TTGA	2	8	122037	122044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004556	TCTA	2	8	122700	122707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_004556	CAAC	2	8	122919	122926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004556	GAGT	2	8	123000	123007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004556	AACA	2	8	123093	123100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004556	TTGT	2	8	123178	123185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004556	ACCC	2	8	126776	126783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_004556	CTTG	2	8	127624	127631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004556	GATG	2	8	133931	133938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004556	GATG	2	8	139155	139162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004556	ATTT	2	8	139307	139314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004556	TGGT	2	8	141387	141394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004556	TGTT	2	8	142809	142816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004556	TGGC	2	8	143070	143077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004556	GGTT	2	8	143098	143105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004556	TGGT	2	8	146921	146928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004556	GATA	2	8	149488	149495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004556	TACA	2	8	152185	152192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004556	ACTT	2	8	152644	152651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004556	TCTG	2	8	159254	159261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004556	GTGC	2	8	159618	159625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004556	TCAT	2	8	161167	161174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004556	GCGG	2	8	161259	161266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_004556	CGTT	2	8	163179	163186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004556	TCAT	2	8	163532	163539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004556	CAGT	2	8	163831	163838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004556	TGAA	2	8	163938	163945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004556	TGTT	2	8	166409	166416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004556	GGAT	2	8	166433	166440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004556	ATTT	2	8	170546	170553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004556	TGAT	2	8	170623	170630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004556	TAAG	2	8	170742	170749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004556	GACC	2	8	173556	173563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004556	CGTC	2	8	174074	174081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_004556	AAAG	2	8	174197	174204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004556	GTTG	2	8	174564	174571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004556	AGGT	2	8	174731	174738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004556	GTTT	2	8	176297	176304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004556	GATT	2	8	180570	180577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004556	AGGT	2	8	182025	182032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004556	CTGC	2	8	182129	182136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_004556	GCGT	2	8	623620	623627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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