MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 12439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004556	GAA	2	6	736663	736668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_004556	T	6	6	736813	736818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004556	TTGA	2	8	736824	736831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_004556	GAA	2	6	736979	736984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004556	TGG	2	6	737046	737051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_004556	ATG	2	6	737099	737104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004556	ACTG	2	8	737184	737191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_004556	CTG	2	6	737195	737200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_004556	GAT	2	6	737305	737310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_004556	TCA	2	6	737453	737458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_004556	ATG	2	6	737468	737473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_004556	GTT	2	6	737494	737499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_004556	CATT	2	8	737507	737514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_004556	GT	3	6	737542	737547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004556	TAG	2	6	737592	737597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_004556	CTT	2	6	737611	737616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_004556	AGC	2	6	737691	737696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_004556	GC	3	6	737732	737737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_004556	TGA	2	6	737738	737743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_004556	GGT	2	6	737772	737777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_004556	GGT	2	6	737795	737800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_004556	TTC	2	6	737811	737816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_004556	CAT	2	6	739126	739131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_004556	G	6	6	739151	739156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_004556	GCC	2	6	739173	739178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_004556	CTGGG	2	10	739186	739195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4029	NC_004556	GTT	2	6	741385	741390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004556	GCA	2	6	741428	741433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_004556	TGA	2	6	741498	741503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_004556	GTT	2	6	741507	741512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_004556	TGT	2	6	741604	741609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_004556	GAT	2	6	741615	741620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_004556	GT	3	6	741656	741661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_004556	GT	4	8	741747	741754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004556	TATTT	2	10	741761	741770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_004556	TCG	2	6	743276	743281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4040	NC_004556	AGC	2	6	743355	743360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_004556	TGG	2	6	743437	743442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_004556	TCG	2	6	743489	743494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_004556	CTG	2	6	745640	745645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_004556	CCG	2	6	745653	745658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_004556	TG	3	6	745702	745707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_004556	GT	3	6	745785	745790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_004556	CTGG	2	8	745831	745838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_004556	GAT	2	6	745886	745891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4051	NC_004556	GGCT	2	8	746018	746025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_004556	TGC	2	6	750828	750833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4054	NC_004556	TGC	2	6	750922	750927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_004556	GGC	2	6	750933	750938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_004556	TCC	2	6	750972	750977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_004556	GATG	2	8	751007	751014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004556	ATG	2	6	751073	751078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_004556	ACG	2	6	751080	751085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4062	NC_004556	GGGCT	2	10	753386	753395	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4063	NC_004556	TG	3	6	753426	753431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_004556	GGGGA	2	10	753435	753444	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_004556	GCA	2	6	753461	753466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_004556	AAG	2	6	753526	753531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_004556	CCTTA	2	10	753552	753561	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4071	NC_004556	T	6	6	755109	755114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_004556	GATGCA	2	12	756152	756163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4076	NC_004556	AGT	2	6	756221	756226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_004556	GTTG	2	8	756256	756263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004556	TGCG	2	8	756293	756300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_004556	TGGAG	2	10	756813	756822	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_004556	CTGTT	2	10	759426	759435	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4090	NC_004556	T	6	6	759437	759442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_004556	TTG	2	6	767292	767297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_004556	TTG	2	6	767373	767378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_004556	AT	3	6	767390	767395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_004556	TGG	2	6	767396	767401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004556	AGC	2	6	767422	767427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4106	NC_004556	ATG	2	6	767509	767514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_004556	ATT	2	6	767688	767693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_004556	A	6	6	767704	767709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_004556	GTT	2	6	767748	767753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_004556	AGC	2	6	771741	771746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_004556	TGC	2	6	771788	771793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_004556	TTG	3	9	771833	771841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_004556	GTC	2	6	771856	771861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4119	NC_004556	AAT	2	6	771980	771985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_004556	T	7	7	771992	771998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_004556	TCTAGA	2	12	772051	772062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4122	NC_004556	TTCT	2	8	772082	772089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_004556	TTCTG	2	10	773201	773210	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4124	NC_004556	TTGC	2	8	773213	773220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_004556	G	6	6	773298	773303	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_004556	AATGC	2	10	773877	773886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4127	NC_004556	ATC	2	6	773963	773968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4129	NC_004556	TGG	2	6	773989	773994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_004556	TAC	2	6	773998	774003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_004556	CGC	2	6	774014	774019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_004556	TGT	2	6	774022	774027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_004556	TAG	2	6	774047	774052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4397	NC_004556	TTGA	2	8	831627	831634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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