MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 12439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004556	TGAA	2	8	163938	163945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004556	A	7	7	163944	163950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004556	G	6	6	166304	166309	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004556	CAG	2	6	166367	166372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_004556	TGC	2	6	166385	166390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_004556	TGTT	2	8	166409	166416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_004556	GT	3	6	166422	166427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004556	GGAT	2	8	166433	166440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_004556	T	6	6	166444	166449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_004556	T	6	6	167639	167644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_004556	GT	3	6	167658	167663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004556	A	6	6	169095	169100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004556	TCT	2	6	169213	169218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_004556	TAT	2	6	169226	169231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004556	TAC	2	6	169260	169265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_004556	AAT	2	6	169268	169273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_004556	ATTT	2	8	170546	170553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004556	GT	3	6	170588	170593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_004556	TGAT	2	8	170623	170630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004556	AAAAC	2	10	170654	170663	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_004556	ATA	3	9	170673	170681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004556	T	6	6	170726	170731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_004556	TAAG	2	8	170742	170749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_004556	TTA	2	6	170775	170780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_004556	T	6	6	170844	170849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004556	T	6	6	170853	170858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_004556	AGT	2	6	170900	170905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004556	GGC	2	6	170920	170925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004556	TG	3	6	170973	170978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004556	GT	3	6	171034	171039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004556	CTG	2	6	171066	171071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_004556	T	7	7	171098	171104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_004556	GGC	2	6	171161	171166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_004556	GCA	2	6	171192	171197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_004556	GTA	2	6	171203	171208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_004556	CGA	2	6	171400	171405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_004556	GAT	2	6	171425	171430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_004556	GCA	2	6	171474	171479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_004556	GAA	2	6	171533	171538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_004556	GAA	2	6	171570	171575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_004556	GTT	2	6	171596	171601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_004556	CAG	2	6	171642	171647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004556	GGT	2	6	171707	171712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004556	TGT	2	6	171723	171728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004556	AGG	2	6	171832	171837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_004556	GGC	2	6	171853	171858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_004556	ACACTG	2	12	171870	171881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_004556	CGC	2	6	172001	172006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_004556	GAA	2	6	172097	172102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004556	TGC	2	6	172173	172178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_004556	GTC	2	6	172185	172190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_004556	TCGTG	2	10	172194	172203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_004556	TGG	2	6	172263	172268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_004556	GGA	2	6	172299	172304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_004556	TCA	2	6	172324	172329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_004556	AC	3	6	172350	172355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_004556	TAC	2	6	172357	172362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_004556	TGC	2	6	172490	172495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_004556	AC	3	6	172520	172525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_004556	TTG	2	6	172547	172552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_004556	GAG	2	6	172578	172583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_004556	CCT	2	6	172661	172666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_004556	GTC	2	6	172820	172825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_004556	CCA	2	6	172845	172850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_004556	GGT	2	6	172878	172883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004556	GGT	2	6	172913	172918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004556	TCC	2	6	172924	172929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_004556	CCA	2	6	172935	172940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_004556	ATT	2	6	172952	172957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_004556	TGA	2	6	173023	173028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004556	TTA	2	6	173050	173055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004556	TGG	2	6	173154	173159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004556	CAA	2	6	173222	173227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_004556	AGG	2	6	173300	173305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004556	AGT	2	6	173368	173373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004556	G	6	6	173524	173529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004556	TCC	2	6	173534	173539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_004556	GACC	2	8	173556	173563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_004556	AC	3	6	174056	174061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_004556	CGTC	2	8	174074	174081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_004556	AAC	2	6	174093	174098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_004556	AGG	2	6	174167	174172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_004556	AGC	2	6	174183	174188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_004556	AAAG	2	8	174197	174204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_004556	ATA	2	6	174383	174388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004556	GTTG	2	8	174564	174571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004556	AGG	2	6	174582	174587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_004556	T	6	6	174647	174652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_004556	ACCGT	2	10	174711	174720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_004556	AGGT	2	8	174731	174738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_004556	GA	3	6	174762	174767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_004556	TGG	2	6	174828	174833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_004556	CGG	2	6	175015	175020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_004556	GCG	2	6	175097	175102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_004556	TGAAAT	2	12	175124	175135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004556	ACG	2	6	175252	175257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_004556	ACC	2	6	175286	175291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_004556	TGG	2	6	175346	175351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004556	TCC	2	6	175372	175377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_004556	GGA	2	6	175389	175394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004556	TG	3	6	175433	175438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004556	GGT	2	6	175509	175514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004556	CGG	2	6	175596	175601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_004556	TCA	2	6	175624	175629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_004556	CGT	2	6	175704	175709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_004556	GCT	2	6	175758	175763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_004556	GC	3	6	175879	175884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_004556	GTG	2	6	175939	175944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004556	GT	3	6	175955	175960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004556	GCA	2	6	175965	175970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_004556	TCA	2	6	176082	176087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_004556	ACC	2	6	176168	176173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_004556	ATCCC	2	10	176176	176185	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1114	NC_004556	GTTT	2	8	176297	176304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004556	CT	3	6	176354	176359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_004556	CCA	2	6	177217	177222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_004556	GAT	2	6	177229	177234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004556	TTG	2	6	177237	177242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004556	ATC	2	6	177256	177261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_004556	AT	3	6	178195	178200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004556	AAT	2	6	178321	178326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004556	TGA	2	6	178331	178336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004556	TA	3	6	178358	178363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004556	A	6	6	178409	178414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004556	ATTTT	2	10	178445	178454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004556	CAT	2	6	178502	178507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_004556	GAT	2	6	178552	178557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004556	TTACA	2	10	180516	180525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_004556	GATT	2	8	180570	180577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004556	ACT	2	6	180620	180625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_004556	T	6	6	180644	180649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004556	ATT	2	6	180651	180656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004556	ATT	2	6	180659	180664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004556	TCC	2	6	180691	180696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_004556	TGA	2	6	180750	180755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004556	TGA	2	6	180884	180889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004556	ATT	2	6	180891	180896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_004556	AACTG	2	10	181712	181721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1145	NC_004556	TGG	2	6	181976	181981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_004556	ATT	2	6	183857	183862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_004556	ATG	2	6	184537	184542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_004556	GCAAGT	2	12	200498	200509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1271	NC_004556	CAG	2	6	201896	201901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1274	NC_004556	TG	3	6	202605	202610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_004556	GTT	2	6	202626	202631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1280	NC_004556	CA	3	6	202819	202824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1293	NC_004556	TGA	2	6	203355	203360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1300	NC_004556	TTG	2	6	204144	204149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_004556	TGC	2	6	204163	204168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1402	NC_004556	ATA	3	9	223262	223270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_004556	TGT	2	6	223385	223390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_004556	GT	3	6	223402	223407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_004556	CTA	2	6	223453	223458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1445	NC_004556	GTTA	3	12	229852	229863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_004556	TGATG	2	10	241730	241739	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

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