MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa Temecula1 chromosome

Total Repeats: 12439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004556	TGC	2	6	1066269	1066274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_004556	A	6	6	1066306	1066311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_004556	TAA	2	6	1066324	1066329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_004556	AATTG	2	10	1066440	1066449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_004556	T	6	6	1066533	1066538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_004556	TAT	2	6	1066576	1066581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_004556	TAT	2	6	1066593	1066598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_004556	T	6	6	1066598	1066603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_004556	T	7	7	1066636	1066642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_004556	TCT	2	6	1066654	1066659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_004556	A	7	7	1066711	1066717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_004556	GTG	2	6	1067213	1067218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_004556	AAT	2	6	1067254	1067259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_004556	CCAT	2	8	1067373	1067380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_004556	A	14	14	1067422	1067435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_004556	ATG	2	6	1067453	1067458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_004556	ACA	2	6	1067467	1067472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_004556	GTG	2	6	1067533	1067538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_004556	ATA	2	6	1067576	1067581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_004556	AGTG	2	8	1067585	1067592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_004556	T	7	7	1067716	1067722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_004556	AT	3	6	1067727	1067732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_004556	CTAA	2	8	1067754	1067761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5524	NC_004556	ATTA	2	8	1067762	1067769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_004556	GTT	2	6	1067781	1067786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_004556	GGATT	2	10	1067787	1067796	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_004556	AGCTA	2	10	1067836	1067845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_004556	ATAA	2	8	1067852	1067859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_004556	TGC	2	6	1068436	1068441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_004556	TCGA	2	8	1068457	1068464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_004556	AG	3	6	1069135	1069140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_004556	GCCA	2	8	1069170	1069177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_004556	TGG	2	6	1069193	1069198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_004556	AGCC	2	8	1069208	1069215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_004556	T	6	6	1069240	1069245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_004556	CAG	2	6	1069290	1069295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_004556	A	8	8	1069359	1069366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_004556	AG	3	6	1069422	1069427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_004556	CAGC	2	8	1069447	1069454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_004556	CA	3	6	1069471	1069476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_004556	GAT	2	6	1069503	1069508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_004556	CAT	2	6	1069517	1069522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_004556	CTTG	2	8	1069523	1069530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_004556	GCAAG	2	10	1069553	1069562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5545	NC_004556	ATT	2	6	1069609	1069614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_004556	TGT	2	6	1069629	1069634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_004556	AGTGTG	2	12	1069638	1069649	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_004556	GT	3	6	1069655	1069660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_004556	CAA	2	6	1073953	1073958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_004556	AC	3	6	1074656	1074661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_004556	TC	3	6	1074685	1074690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_004556	A	6	6	1075501	1075506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_004556	CCTA	2	8	1075558	1075565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_004556	TCA	2	6	1075684	1075689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_004556	AAC	2	6	1075708	1075713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_004556	CAA	2	6	1075718	1075723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_004556	CA	3	6	1075816	1075821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_004556	CAA	2	6	1075937	1075942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_004556	AGA	2	6	1075946	1075951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_004556	GCT	2	6	1076283	1076288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_004556	TGC	2	6	1076303	1076308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_004556	ATGC	2	8	1076392	1076399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_004556	AGCCA	2	10	1076469	1076478	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5564	NC_004556	CAG	3	9	1076558	1076566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_004556	GAG	2	6	1076611	1076616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_004556	GGC	2	6	1076672	1076677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_004556	CGCAG	2	10	1076733	1076742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5568	NC_004556	GC	3	6	1076760	1076765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_004556	CGG	2	6	1076850	1076855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_004556	GC	3	6	1076863	1076868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_004556	GCA	2	6	1076889	1076894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5573	NC_004556	GCGTC	2	10	1076966	1076975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5574	NC_004556	GGC	2	6	1077083	1077088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_004556	TGCT	2	8	1077104	1077111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5578	NC_004556	GAT	2	6	1077251	1077256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5580	NC_004556	CG	3	6	1077563	1077568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_004556	GAT	2	6	1077569	1077574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_004556	TTG	2	6	1077644	1077649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_004556	T	6	6	1082189	1082194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_004556	AATT	2	8	1082197	1082204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_004556	TAT	2	6	1082234	1082239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_004556	TATC	2	8	1082251	1082258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_004556	TGA	2	6	1082264	1082269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_004556	TC	3	6	1083198	1083203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5612	NC_004556	AAT	2	6	1083391	1083396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_004556	T	7	7	1083409	1083415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_004556	A	6	6	1083425	1083430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_004556	TTTATA	2	12	1083437	1083448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_004556	TGC	2	6	1083796	1083801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_004556	T	6	6	1083860	1083865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_004556	A	6	6	1083892	1083897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_004556	TAA	2	6	1083911	1083916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_004556	GAG	2	6	1084602	1084607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5624	NC_004556	TTCCTC	2	12	1084766	1084777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_004556	TCA	2	6	1084818	1084823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5627	NC_004556	T	6	6	1085269	1085274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_004556	T	6	6	1085332	1085337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_004556	CTA	2	6	1085949	1085954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_004556	ACC	2	6	1085980	1085985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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