MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 2443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	CAGC	2	8	15	22	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003919	AAAC	2	8	1545	1552	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003919	TTTG	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003919	CGGC	2	8	3057	3064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003919	AGCG	2	8	3312	3319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003919	ACAA	2	8	3628	3635	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003919	CCTG	2	8	3691	3698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003919	ACCG	2	8	3757	3764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003919	CGGC	2	8	4913	4920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003919	CCGG	2	8	7475	7482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003919	GCCG	2	8	7502	7509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003919	TGCC	2	8	9422	9429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003919	GGCC	2	8	11662	11669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003919	GGTG	2	8	13469	13476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003919	CCTG	2	8	20294	20301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003919	GAGC	2	8	27138	27145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003919	CAGG	2	8	27199	27206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003919	GTGC	2	8	27957	27964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003919	TGCG	2	8	30905	30912	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003919	TGCG	2	8	33791	33798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003919	GCCA	2	8	34152	34159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003919	CTGC	2	8	34532	34539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003919	CGCC	2	8	45629	45636	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_003919	GTCA	2	8	45657	45664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003919	TGGA	2	8	48474	48481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003919	ATCG	2	8	74313	74320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_003919	AGGA	2	8	74323	74330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003919	TCGA	2	8	74365	74372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003919	GGTT	2	8	74392	74399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003919	TCGC	2	8	74522	74529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003919	CTCG	2	8	81374	81381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003919	CGCT	2	8	81482	81489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003919	TGGC	2	8	81614	81621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003919	ATCC	2	8	81699	81706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003919	GGGC	2	8	81709	81716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003919	GCAC	2	8	81765	81772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003919	GGCG	2	8	84001	84008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003919	CGGC	2	8	84256	84263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003919	CGGA	2	8	90529	90536	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003919	ATGA	2	8	94454	94461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003919	GTCA	2	8	94516	94523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_003919	GCCG	2	8	98484	98491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003919	GCCT	2	8	98629	98636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003919	GCCG	2	8	99416	99423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003919	AGGC	2	8	100037	100044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003919	TGTC	2	8	104225	104232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003919	GCAG	2	8	104980	104987	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003919	GCAC	2	8	105031	105038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003919	GCAG	2	8	105606	105613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003919	CCTG	2	8	106145	106152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003919	CTTG	2	8	111161	111168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_003919	GGCT	2	8	111425	111432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003919	GGTG	2	8	111594	111601	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003919	CTGT	2	8	111605	111612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003919	GCGG	2	8	111643	111650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003919	GGAA	2	8	114843	114850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003919	TGCG	2	8	115987	115994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003919	GGCA	2	8	116033	116040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003919	GCGG	2	8	117426	117433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003919	GCCG	2	8	117506	117513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_003919	CGCA	2	8	117741	117748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_003919	ACCA	2	8	117804	117811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_003919	CTCG	2	8	125588	125595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003919	GGAT	2	8	128914	128921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003919	TGCG	2	8	131351	131358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003919	TTTC	2	8	143059	143066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003919	GCAT	2	8	145044	145051	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_003919	AGCA	2	8	147078	147085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003919	CCCG	2	8	150688	150695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_003919	GATG	2	8	153519	153526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003919	CAGT	2	8	154190	154197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003919	GGCT	2	8	154335	154342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003919	GCAG	2	8	154397	154404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003919	ACGG	2	8	157426	157433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003919	CAGC	2	8	158684	158691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_003919	GCGG	2	8	160630	160637	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003919	TCCT	2	8	160793	160800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003919	CGCC	2	8	172320	172327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_003919	ACTG	2	8	176733	176740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003919	GTGC	2	8	183471	183478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003919	TCGG	2	8	185644	185651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003919	CGCC	2	8	185676	185683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_003919	TTGG	2	8	185714	185721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003919	GTCG	2	8	185953	185960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003919	GGGT	2	8	194857	194864	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003919	ATCG	2	8	203295	203302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_003919	GCCG	2	8	205106	205113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_003919	GCCC	2	8	205157	205164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_003919	AGGC	2	8	206455	206462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003919	CTTC	2	8	208949	208956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_003919	CCAA	2	8	209068	209075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003919	AGTC	2	8	209772	209779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003919	CGCA	2	8	211508	211515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003919	GACG	2	8	215576	215583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003919	TCGT	2	8	215658	215665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003919	CAGC	2	8	215691	215698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003919	AGGC	2	8	219695	219702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003919	GCCT	2	8	219816	219823	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_003919	CTTC	2	8	219843	219850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003919	GCCT	2	8	226075	226082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003919	GCTG	2	8	227523	227530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003919	GGGC	2	8	229854	229861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_003919	GCTT	2	8	229905	229912	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003919	GTGC	2	8	230006	230013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_003919	GCCC	2	8	236275	236282	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_003919	CCGC	2	8	236372	236379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_003919	CCAG	2	8	236535	236542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_003919	TGGA	2	8	241629	241636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003919	GCAT	2	8	242376	242383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003919	GTAC	2	8	246890	246897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003919	GCCA	2	8	247658	247665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_003919	CGGC	2	8	247670	247677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_003919	CCAC	2	8	249760	249767	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_003919	GCAG	2	8	249835	249842	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003919	GAGG	2	8	250673	250680	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003919	CCTG	2	8	250856	250863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_003919	TGAC	2	8	252501	252508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003919	GCCG	2	8	252527	252534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_003919	CCGG	2	8	254409	254416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003919	ACGC	2	8	254568	254575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003919	GCCG	2	8	258206	258213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_003919	GCCG	2	8	258242	258249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003919	GATG	2	8	258857	258864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003919	GCAG	2	8	258866	258873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003919	ATGC	2	8	258987	258994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003919	GCGG	2	8	259118	259125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_003919	TGCC	2	8	260678	260685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_003919	GCCG	2	8	265433	265440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003919	CAAA	2	8	266370	266377	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_003919	TGGC	2	8	266423	266430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003919	GGCA	2	8	266466	266473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003919	CCCG	2	8	267657	267664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_003919	CGCT	2	8	269897	269904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_003919	TTTG	2	8	269991	269998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003919	ACGC	2	8	270062	270069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_003919	CGTG	2	8	270137	270144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003919	AGAA	2	8	270159	270166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003919	CCAG	2	8	280793	280800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_003919	CGGC	2	8	284983	284990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003919	GGCA	2	8	291882	291889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_003919	GCGG	2	8	292942	292949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003919	TGCG	2	8	298306	298313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003919	GCAT	2	8	298317	298324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003919	CAAA	2	8	298344	298351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003919	TGCC	2	8	298494	298501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_003919	CAGC	2	8	299819	299826	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_003919	CGCT	2	8	300593	300600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_003919	TGCA	2	8	301993	302000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003919	GCTG	2	8	303403	303410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003919	GCAC	2	8	303499	303506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_003919	TCGC	2	8	303523	303530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_003919	GCAC	2	8	306414	306421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_003919	TTCC	2	8	306468	306475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_003919	TCTT	2	8	308006	308013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_003919	GGCC	2	8	308084	308091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_003919	TGGC	2	8	312305	312312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_003919	TGGA	2	8	312428	312435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003919	CGCA	2	8	312477	312484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_003919	TCGG	2	8	313534	313541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_003919	GCCG	2	8	315750	315757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_003919	GGTT	2	8	317939	317946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_003919	GCGG	2	8	320906	320913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
164	NC_003919	CGTG	2	8	322674	322681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
165	NC_003919	TTGA	2	8	322782	322789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_003919	CAAG	2	8	330920	330927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_003919	CGGC	2	8	333313	333320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_003919	TGAG	2	8	334083	334090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003919	AAAT	2	8	335503	335510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_003919	TGCA	2	8	348136	348143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_003919	GCCA	2	8	351530	351537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
178	NC_003919	TGGA	2	8	351668	351675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_003919	GGCC	2	8	359360	359367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_003919	GCAC	2	8	360482	360489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
183	NC_003919	TGCC	2	8	369272	369279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_003919	GCAC	2	8	370901	370908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
188	NC_003919	GTCG	2	8	374215	374222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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190	NC_003919	CTCG	2	8	374361	374368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_003919	GCCA	2	8	396334	396341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_003919	GCAT	2	8	445482	445489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_003919	GCCT	2	8	516310	516317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_003919	GGCT	2	8	1050539	1050546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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490	NC_003919	CGAT	2	8	1050847	1050854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_003919	GGCG	2	8	1053180	1053187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_003919	GCTG	2	8	1053558	1053565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_003919	TGGC	2	8	1054780	1054787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_003919	CGCC	2	8	1054886	1054893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_003919	CGGC	2	8	1057001	1057008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_003919	TGGC	2	8	1057011	1057018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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