MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 15889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003919	AGC	2	6	1096868	1096873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_003919	GCG	2	6	1096908	1096913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_003919	CAA	2	6	1097039	1097044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_003919	CGG	2	6	1097089	1097094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_003919	CCGT	2	8	1097096	1097103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_003919	CGAA	2	8	1098068	1098075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_003919	GTC	2	6	1098085	1098090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_003919	GC	3	6	1098108	1098113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_003919	GAT	2	6	1098172	1098177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_003919	GGT	2	6	1098204	1098209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_003919	ACC	2	6	1098218	1098223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_003919	GCC	2	6	1099233	1099238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_003919	TG	3	6	1099239	1099244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_003919	AGCC	2	8	1099265	1099272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_003919	TGC	2	6	1099276	1099281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_003919	CGC	2	6	1099283	1099288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_003919	CAC	2	6	1101500	1101505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_003919	CAG	2	6	1103582	1103587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_003919	GC	3	6	1103597	1103602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_003919	GC	3	6	1104125	1104130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_003919	CAC	2	6	1104309	1104314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_003919	TCC	2	6	1104318	1104323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_003919	AGG	2	6	1104350	1104355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_003919	GCCAT	2	10	1104401	1104410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3525	NC_003919	CAG	2	6	1104423	1104428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_003919	GCA	2	6	1104441	1104446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_003919	TTGC	2	8	1108548	1108555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_003919	GGC	2	6	1108564	1108569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_003919	CGAA	2	8	1111977	1111984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_003919	CCA	2	6	1112015	1112020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_003919	CGC	3	9	1112038	1112046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_003919	GA	3	6	1112049	1112054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_003919	CTG	2	6	1112077	1112082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_003919	GCC	2	6	1113048	1113053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_003919	CGC	2	6	1113089	1113094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_003919	GC	3	6	1113786	1113791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_003919	GCT	2	6	1114424	1114429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_003919	TTG	2	6	1115625	1115630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_003919	CAA	2	6	1115648	1115653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_003919	GCT	2	6	1115662	1115667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_003919	CCGAA	2	10	1115673	1115682	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3542	NC_003919	GTA	2	6	1115707	1115712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_003919	CTG	2	6	1115759	1115764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_003919	GGT	2	6	1115777	1115782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_003919	CCTC	2	8	1115792	1115799	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3546	NC_003919	AGT	2	6	1115839	1115844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_003919	CCT	2	6	1115967	1115972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_003919	AGG	3	9	1115978	1115986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_003919	TGG	2	6	1117276	1117281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_003919	AGC	2	6	1117382	1117387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_003919	CCT	2	6	1117421	1117426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_003919	CTC	2	6	1117436	1117441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_003919	TGC	2	6	1118497	1118502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_003919	GGC	2	6	1118558	1118563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_003919	CAA	2	6	1118578	1118583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_003919	CCT	2	6	1119881	1119886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_003919	CGG	2	6	1119927	1119932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_003919	CGA	2	6	1119969	1119974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_003919	CCGG	2	8	1120047	1120054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_003919	CG	3	6	1120092	1120097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_003919	CCA	2	6	1120140	1120145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_003919	AGGA	2	8	1120176	1120183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_003919	AGT	2	6	1120222	1120227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_003919	GCT	2	6	1120268	1120273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_003919	GGA	2	6	1120324	1120329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_003919	GCA	2	6	1121399	1121404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_003919	ATC	2	6	1121412	1121417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_003919	GCC	2	6	1121527	1121532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_003919	TCC	2	6	1125848	1125853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_003919	CGG	2	6	1130094	1130099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_003919	AGG	2	6	1130128	1130133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_003919	CAG	2	6	1130169	1130174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_003919	TCC	2	6	1130203	1130208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_003919	GCCT	2	8	1130247	1130254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_003919	ATCA	2	8	1130282	1130289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_003919	GAA	2	6	1130290	1130295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_003919	GCC	2	6	1131240	1131245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_003919	GGC	2	6	1131250	1131255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_003919	TAGT	2	8	1133452	1133459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_003919	GTG	2	6	1134737	1134742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_003919	GC	3	6	1134780	1134785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_003919	GTT	2	6	1134924	1134929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_003919	TTG	2	6	1134940	1134945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_003919	GGA	2	6	1135004	1135009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_003919	CAG	2	6	1135021	1135026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_003919	CG	3	6	1135029	1135034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_003919	TCA	2	6	1135041	1135046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_003919	GAAG	2	8	1135102	1135109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_003919	GA	3	6	1136093	1136098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_003919	GGAAA	2	10	1138470	1138479	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_003919	GGA	2	6	1140490	1140495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_003919	CAA	2	6	1141745	1141750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_003919	GGAA	2	8	1142303	1142310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_003919	CTG	2	6	1143296	1143301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_003919	CCG	2	6	1143332	1143337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_003919	CTTCA	2	10	1143390	1143399	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3597	NC_003919	TCAA	3	12	1143430	1143441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_003919	CAA	2	6	1144000	1144005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_003919	TCA	2	6	1146014	1146019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_003919	CG	3	6	1146072	1146077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_003919	CG	4	8	1146084	1146091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_003919	GGT	2	6	1146102	1146107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_003919	ATCC	2	8	1146268	1146275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_003919	CGGC	2	8	1148870	1148877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_003919	T	6	6	1149396	1149401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_003919	G	8	8	1149415	1149422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_003919	TCGG	2	8	1149444	1149451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_003919	TGC	2	6	1149460	1149465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_003919	GTGC	2	8	1149524	1149531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_003919	TTG	2	6	1149573	1149578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_003919	CCA	2	6	1149646	1149651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_003919	GCCC	2	8	1149667	1149674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3613	NC_003919	GAC	2	6	1150345	1150350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_003919	TCG	2	6	1150410	1150415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_003919	TGCGC	2	10	1150426	1150435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3616	NC_003919	TGC	2	6	1150479	1150484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_003919	TGCGTC	2	12	1150493	1150504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_003919	TGG	2	6	1150576	1150581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_003919	TGC	2	6	1150686	1150691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_003919	CG	3	6	1152883	1152888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_003919	GAGG	2	8	1152895	1152902	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_003919	TGT	2	6	1152904	1152909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_003919	TGT	2	6	1152976	1152981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_003919	GCC	2	6	1153002	1153007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_003919	CGG	2	6	1153033	1153038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_003919	GCG	2	6	1154518	1154523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_003919	C	6	6	1154583	1154588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3628	NC_003919	AGG	2	6	1154591	1154596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3630	NC_003919	GCC	2	6	1155755	1155760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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