MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 15889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003919	GCAT	2	8	445482	445489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_003919	CAG	2	6	445497	445502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_003919	AAG	2	6	446661	446666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_003919	CAC	2	6	446718	446723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_003919	GCT	2	6	446747	446752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_003919	CACGCG	2	12	446845	446856	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_003919	GTC	2	6	447584	447589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_003919	GTC	2	6	447722	447727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_003919	GATG	2	8	447733	447740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_003919	CGTCG	2	10	447768	447777	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_003919	GGGC	2	8	449737	449744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_003919	CGT	2	6	449840	449845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_003919	CG	3	6	449893	449898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_003919	T	6	6	449948	449953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_003919	TGT	2	6	450052	450057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_003919	G	6	6	450087	450092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_003919	A	6	6	450149	450154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_003919	CA	3	6	450168	450173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_003919	CCT	2	6	450735	450740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_003919	GCG	2	6	450828	450833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_003919	AGG	2	6	450855	450860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_003919	ATG	2	6	452454	452459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_003919	GC	3	6	453053	453058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_003919	GGTG	2	8	453104	453111	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_003919	G	6	6	454040	454045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_003919	G	6	6	454047	454052	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_003919	AGC	2	6	454077	454082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_003919	GCA	2	6	454087	454092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_003919	CTG	2	6	454093	454098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_003919	CGT	2	6	454099	454104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_003919	CCA	2	6	454113	454118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_003919	CCG	2	6	454182	454187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_003919	CGA	2	6	454249	454254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_003919	CCG	2	6	454268	454273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_003919	GTG	2	6	455206	455211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_003919	CGA	2	6	455214	455219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_003919	CGA	2	6	456043	456048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_003919	GC	3	6	456816	456821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_003919	CA	3	6	456881	456886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_003919	GCC	2	6	457256	457261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_003919	CG	3	6	457279	457284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_003919	GCAC	2	8	457319	457326	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_003919	GC	3	6	457378	457383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_003919	CGT	2	6	457407	457412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_003919	CG	3	6	457439	457444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_003919	GCCA	2	8	457458	457465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_003919	TAGCG	2	10	458717	458726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_003919	GCC	2	6	458747	458752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_003919	CGA	2	6	458755	458760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_003919	CGG	2	6	460595	460600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_003919	CCG	2	6	460601	460606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_003919	CT	3	6	460642	460647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_003919	CGG	2	6	460706	460711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_003919	AGA	2	6	460722	460727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_003919	TGG	2	6	460753	460758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_003919	CGA	2	6	460803	460808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_003919	AGC	2	6	461757	461762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_003919	GGC	2	6	461807	461812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_003919	ACG	2	6	461872	461877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_003919	GCG	2	6	461920	461925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_003919	AAC	2	6	462510	462515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_003919	GCG	2	6	462516	462521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_003919	AGCGA	2	10	462551	462560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_003919	CGG	2	6	462620	462625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_003919	CCG	2	6	462634	462639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_003919	TGCC	2	8	462665	462672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_003919	TCG	2	6	464378	464383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_003919	TGC	2	6	464397	464402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_003919	AGA	2	6	464413	464418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_003919	ACGC	2	8	464448	464455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_003919	GCC	2	6	464498	464503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_003919	CGC	2	6	464513	464518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_003919	CG	3	6	464525	464530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_003919	GGCT	2	8	464674	464681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_003919	TGCGA	2	10	464707	464716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_003919	TCA	2	6	464720	464725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_003919	TGC	2	6	464791	464796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_003919	AC	3	6	464859	464864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_003919	GGT	2	6	464887	464892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_003919	GCG	2	6	465018	465023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_003919	CAT	2	6	465088	465093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_003919	GCA	2	6	465108	465113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_003919	CGT	2	6	465114	465119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_003919	CGA	2	6	467733	467738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_003919	A	6	6	467751	467756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_003919	GCT	2	6	467792	467797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_003919	CG	3	6	467802	467807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_003919	CTG	2	6	467832	467837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_003919	CAT	2	6	467848	467853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_003919	GCT	2	6	467930	467935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_003919	ATG	3	9	467958	467966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_003919	TGA	2	6	467987	467992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_003919	TAGT	2	8	468003	468010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_003919	TG	3	6	468026	468031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_003919	GCC	2	6	468039	468044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_003919	GAT	2	6	468093	468098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_003919	CCG	2	6	468124	468129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_003919	TGG	2	6	468201	468206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_003919	GCG	2	6	468235	468240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_003919	GC	4	8	468253	468260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_003919	GGCGAA	2	12	468427	468438	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1602	NC_003919	GCCG	2	8	468450	468457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_003919	CGG	2	6	468492	468497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_003919	CTG	2	6	468747	468752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_003919	GGAG	2	8	468915	468922	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_003919	TGT	2	6	468962	468967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_003919	GCA	2	6	468971	468976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_003919	GA	4	8	469862	469869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_003919	GCA	2	6	469937	469942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_003919	GCA	2	6	470040	470045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_003919	CCT	2	6	470878	470883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_003919	CTG	2	6	470907	470912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_003919	GC	3	6	474773	474778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_003919	GA	3	6	474804	474809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_003919	TCC	2	6	474858	474863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_003919	GGC	2	6	475516	475521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_003919	TGG	2	6	478580	478585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_003919	TG	3	6	478608	478613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_003919	GCC	2	6	478682	478687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_003919	GC	3	6	478691	478696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_003919	C	6	6	478705	478710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1622	NC_003919	CTT	2	6	484413	484418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_003919	ATC	2	6	486359	486364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_003919	GCGT	2	8	486383	486390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_003919	GT	3	6	486389	486394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_003919	ACC	2	6	486415	486420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_003919	GAT	2	6	486426	486431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_003919	GCG	2	6	486438	486443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_003919	CAT	2	6	486645	486650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_003919	GCA	2	6	486673	486678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_003919	GAT	2	6	486693	486698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_003919	A	6	6	486726	486731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_003919	TGAC	2	8	486792	486799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_003919	GCT	2	6	486819	486824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_003919	CTGT	2	8	486838	486845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1907	NC_003919	GTGAG	2	10	565927	565936	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1908	NC_003919	GCC	2	6	565958	565963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1909	NC_003919	GC	3	6	566012	566017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1910	NC_003919	CG	3	6	566018	566023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1914	NC_003919	CTG	2	6	566163	566168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1938	NC_003919	TGC	2	6	571623	571628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1940	NC_003919	GCCC	2	8	571676	571683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1941	NC_003919	GGC	2	6	573223	573228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1943	NC_003919	AATCG	2	10	573462	573471	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1944	NC_003919	CGG	2	6	575222	575227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1956	NC_003919	CCG	2	6	577626	577631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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