MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 15889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003919	GC	3	6	300726	300731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_003919	GCT	2	6	300744	300749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_003919	GC	3	6	301951	301956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_003919	CGCAG	2	10	301982	301991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1005	NC_003919	TGCA	2	8	301993	302000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_003919	GCA	2	6	302025	302030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_003919	TCGGC	2	10	303329	303338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1008	NC_003919	GCTG	2	8	303403	303410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_003919	GAC	2	6	303424	303429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_003919	GCAC	2	8	303499	303506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_003919	TCGC	2	8	303523	303530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_003919	GC	3	6	303555	303560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_003919	TAC	2	6	304611	304616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_003919	GCG	2	6	306352	306357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_003919	GCAC	2	8	306414	306421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_003919	ACG	2	6	306427	306432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_003919	GCC	2	6	306443	306448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_003919	TTCC	2	8	306468	306475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_003919	CGT	2	6	306486	306491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_003919	GCA	2	6	307814	307819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_003919	CGG	2	6	307829	307834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_003919	GCA	2	6	307859	307864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_003919	GAC	2	6	307904	307909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003919	CAG	2	6	307921	307926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_003919	GGGAG	2	10	307947	307956	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003919	T	6	6	307976	307981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003919	TCTT	2	8	308006	308013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_003919	GGCC	2	8	308084	308091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_003919	TCG	2	6	312205	312210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_003919	TTC	2	6	312224	312229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_003919	CGA	2	6	312238	312243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_003919	CGG	2	6	312274	312279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_003919	CGC	2	6	312293	312298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_003919	TGGC	2	8	312305	312312	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_003919	GAAGTG	2	12	312335	312346	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_003919	GCT	2	6	312418	312423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_003919	TGGA	2	8	312428	312435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003919	CGCA	2	8	312477	312484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_003919	GCA	2	6	312493	312498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_003919	TGA	2	6	312499	312504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003919	GCA	3	9	312511	312519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_003919	TGG	2	6	312524	312529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003919	GAA	2	6	312593	312598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003919	AGC	2	6	313394	313399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003919	GGC	2	6	313442	313447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_003919	CGGA	2	8	313456	313463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_003919	ACT	2	6	313464	313469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_003919	TCGG	2	8	313534	313541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_003919	GCT	2	6	313561	313566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_003919	GGC	2	6	313585	313590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_003919	GGC	2	6	315741	315746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_003919	GCCG	2	8	315750	315757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_003919	GC	3	6	315781	315786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_003919	GCG	2	6	317877	317882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_003919	GTC	2	6	317884	317889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_003919	GGTT	2	8	317939	317946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003919	TG	3	6	317959	317964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003919	GCA	2	6	318051	318056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_003919	CAA	2	6	320869	320874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_003919	GCGG	2	8	320906	320913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_003919	CG	3	6	320916	320921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_003919	CAA	2	6	320948	320953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_003919	A	6	6	320952	320957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003919	GC	3	6	322620	322625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_003919	CGTG	2	8	322674	322681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_003919	GAG	2	6	322704	322709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003919	AGA	2	6	322731	322736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003919	ACG	2	6	322757	322762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_003919	TTGA	2	8	322782	322789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003919	GCC	2	6	322865	322870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_003919	GTA	2	6	322891	322896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003919	CTC	2	6	326014	326019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_003919	GGCGA	2	10	326032	326041	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_003919	GTT	2	6	326058	326063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003919	GCG	2	6	326108	326113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_003919	TGCGT	2	10	326868	326877	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_003919	GCA	2	6	326919	326924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_003919	GCGCA	2	10	326959	326968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1079	NC_003919	TGC	3	9	328865	328873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_003919	GAT	2	6	328890	328895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003919	GTC	3	9	328903	328911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_003919	TGA	2	6	328947	328952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_003919	CGG	2	6	328953	328958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_003919	CACCGA	5	30	328971	329000	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_003919	GCG	2	6	329009	329014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_003919	CAG	2	6	329036	329041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_003919	CGG	2	6	329053	329058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_003919	ACC	2	6	329067	329072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_003919	CGC	2	6	329088	329093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_003919	TA	3	6	329537	329542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003919	CTC	2	6	329549	329554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_003919	GCT	2	6	330911	330916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_003919	CAAG	2	8	330920	330927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_003919	GC	3	6	331042	331047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_003919	ACG	2	6	331049	331054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_003919	GCAG	2	8	333294	333301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_003919	CGGC	2	8	333313	333320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_003919	TAT	2	6	333329	333334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_003919	TGAG	2	8	334083	334090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003919	ATTGCC	2	12	335208	335219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_003919	GGT	2	6	335230	335235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003919	GCACT	2	10	335237	335246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1103	NC_003919	GAC	2	6	335275	335280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_003919	CGT	2	6	335290	335295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_003919	GCC	3	9	335379	335387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_003919	GGC	2	6	335396	335401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_003919	C	6	6	335412	335417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1108	NC_003919	GCT	2	6	335421	335426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_003919	AAAT	2	8	335503	335510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003919	ACC	2	6	336104	336109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_003919	GTG	2	6	336567	336572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003919	GCA	2	6	336614	336619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_003919	GGC	2	6	336620	336625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_003919	ACTG	2	8	336668	336675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_003919	ACC	2	6	337527	337532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_003919	GGC	2	6	337540	337545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_003919	CCG	2	6	337598	337603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_003919	GC	3	6	337621	337626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_003919	ATGC	2	8	337653	337660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_003919	GGT	2	6	337681	337686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003919	TGC	2	6	337739	337744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_003919	AGC	2	6	339274	339279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_003919	GCA	2	6	339318	339323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_003919	ATC	2	6	339331	339336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_003919	CCG	2	6	339416	339421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_003919	CAA	2	6	339427	339432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_003919	GCA	2	6	339441	339446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_003919	CGG	2	6	339455	339460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_003919	GCC	2	6	339461	339466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_003919	AGC	2	6	340778	340783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_003919	GTT	2	6	340793	340798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003919	TG	3	6	340814	340819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003919	CTGGCG	2	12	340833	340844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_003919	AGCG	2	8	340883	340890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1166	NC_003919	TGCAG	2	10	351695	351704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1170	NC_003919	GTG	2	6	351945	351950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_003919	CG	4	8	351958	351965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1172	NC_003919	GGC	2	6	352000	352005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_003919	GCGCA	2	10	352085	352094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1191	NC_003919	GCAC	2	8	360482	360489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1234	NC_003919	CACG	2	8	370834	370841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1235	NC_003919	GCG	2	6	370878	370883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_003919	CGCGC	2	10	381249	381258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1397	NC_003919	GCC	2	6	418914	418919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1398	NC_003919	TGC	2	6	418955	418960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1400	NC_003919	C	6	6	419058	419063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1401	NC_003919	CCG	2	6	419082	419087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1402	NC_003919	GGT	2	6	419110	419115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1404	NC_003919	CAG	2	6	419144	419149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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