MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 15889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003919	CCA	2	6	1708977	1708982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_003919	CGAC	2	8	1709011	1709018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_003919	CGC	2	6	1709041	1709046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_003919	GGC	2	6	1709060	1709065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_003919	GCC	2	6	1709072	1709077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_003919	ATGG	2	8	1709089	1709096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_003919	GCG	2	6	1709117	1709122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_003919	CG	5	10	1709130	1709139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_003919	CGA	2	6	1709176	1709181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_003919	TCG	2	6	1709257	1709262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_003919	ACC	2	6	1709336	1709341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_003919	G	7	7	1710410	1710416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_003919	AGG	2	6	1710418	1710423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_003919	ATT	2	6	1710445	1710450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_003919	TGC	2	6	1710474	1710479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_003919	TCC	2	6	1710554	1710559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_003919	CGG	2	6	1710656	1710661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_003919	TGG	2	6	1710667	1710672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_003919	GC	3	6	1712729	1712734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_003919	CTG	2	6	1712779	1712784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_003919	GGCCCG	2	12	1712830	1712841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_003919	GCCGC	2	10	1712846	1712855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5523	NC_003919	CGG	2	6	1712860	1712865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_003919	TGCG	2	8	1718260	1718267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_003919	GGC	2	6	1718269	1718274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_003919	GTC	2	6	1718281	1718286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_003919	TGGC	2	8	1718344	1718351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_003919	GC	3	6	1718382	1718387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_003919	GC	3	6	1718402	1718407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_003919	GCC	2	6	1718500	1718505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_003919	CAT	2	6	1719510	1719515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_003919	CGG	2	6	1719519	1719524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_003919	GC	4	8	1719936	1719943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_003919	GCA	3	9	1720052	1720060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_003919	GCT	2	6	1720067	1720072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_003919	CGT	2	6	1721888	1721893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_003919	TCG	2	6	1723115	1723120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_003919	AGG	2	6	1723181	1723186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_003919	TGA	2	6	1723191	1723196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_003919	TCC	2	6	1723210	1723215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_003919	GGC	2	6	1723281	1723286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_003919	CT	3	6	1723312	1723317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_003919	TGA	2	6	1723382	1723387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_003919	GATG	2	8	1723458	1723465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_003919	GCA	2	6	1723494	1723499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_003919	CGA	2	6	1723655	1723660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_003919	TGG	2	6	1724662	1724667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_003919	ATGG	2	8	1724730	1724737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_003919	GAT	2	6	1724756	1724761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_003919	GGA	2	6	1724772	1724777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_003919	TCC	2	6	1725071	1725076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_003919	TGC	2	6	1725087	1725092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_003919	GTC	2	6	1725111	1725116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_003919	GGC	2	6	1725152	1725157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_003919	GGC	2	6	1725223	1725228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_003919	GGT	2	6	1725255	1725260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_003919	CA	3	6	1725280	1725285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_003919	AGA	2	6	1725373	1725378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_003919	C	6	6	1725416	1725421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5560	NC_003919	CAC	2	6	1725453	1725458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_003919	ATG	2	6	1726629	1726634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_003919	GGT	2	6	1726695	1726700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_003919	A	8	8	1726713	1726720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_003919	AAGA	2	8	1726755	1726762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_003919	GAG	2	6	1726824	1726829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_003919	GAG	2	6	1726890	1726895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_003919	AGT	2	6	1726944	1726949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5569	NC_003919	GAA	2	6	1726983	1726988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_003919	CAA	2	6	1727009	1727014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_003919	TTC	2	6	1727022	1727027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_003919	GCT	2	6	1727043	1727048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_003919	CATG	2	8	1727088	1727095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_003919	ATT	2	6	1727114	1727119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_003919	TTG	2	6	1727711	1727716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5577	NC_003919	AAAAT	2	10	1729940	1729949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_003919	TTGAG	2	10	1729956	1729965	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_003919	T	6	6	1729976	1729981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_003919	GAG	2	6	1731566	1731571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_003919	CTTC	2	8	1731846	1731853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_003919	GC	3	6	1731854	1731859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_003919	GCTC	2	8	1731872	1731879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_003919	TCT	2	6	1731880	1731885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_003919	CT	3	6	1731884	1731889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_003919	TCC	2	6	1731922	1731927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_003919	CGGT	2	8	1731967	1731974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_003919	TGCTG	2	10	1731996	1732005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5597	NC_003919	TTG	2	6	1732117	1732122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_003919	GTT	2	6	1732141	1732146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_003919	CGCT	2	8	1732167	1732174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_003919	CTT	2	6	1732175	1732180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_003919	GAT	2	6	1732202	1732207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5604	NC_003919	CCGAT	2	10	1732315	1732324	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5605	NC_003919	ATC	2	6	1732340	1732345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5608	NC_003919	T	7	7	1732412	1732418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_003919	CAT	2	6	1732420	1732425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_003919	A	7	7	1732551	1732557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_003919	ATT	2	6	1732600	1732605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_003919	GGT	2	6	1732697	1732702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_003919	GATG	2	8	1732821	1732828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_003919	TTA	2	6	1732861	1732866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_003919	CCA	2	6	1732925	1732930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_003919	CAATAA	2	12	1732937	1732948	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5617	NC_003919	A	6	6	1732947	1732952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_003919	GCC	2	6	1732956	1732961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_003919	CAG	2	6	1732965	1732970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_003919	GGAA	2	8	1733014	1733021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_003919	GGT	2	6	1733032	1733037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_003919	TAA	2	6	1736648	1736653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_003919	GAG	2	6	1736662	1736667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_003919	CTC	2	6	1736676	1736681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_003919	T	10	10	1736683	1736692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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