MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 15889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003919	TGC	2	6	1553510	1553515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_003919	G	8	8	1553520	1553527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_003919	TCCTGT	2	12	1553866	1553877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_003919	AGG	2	6	1553905	1553910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_003919	GCC	2	6	1553947	1553952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_003919	GTT	2	6	1553977	1553982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_003919	CGG	2	6	1553994	1553999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_003919	AAG	2	6	1554080	1554085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_003919	TCG	2	6	1554442	1554447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_003919	GC	3	6	1554470	1554475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_003919	ATG	2	6	1554483	1554488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_003919	GGC	2	6	1555769	1555774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_003919	GC	4	8	1555784	1555791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_003919	CCAT	2	8	1555852	1555859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_003919	CCGTG	2	10	1559939	1559948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5016	NC_003919	A	6	6	1559955	1559960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_003919	GC	3	6	1561300	1561305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_003919	AGCG	2	8	1561330	1561337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_003919	GGC	2	6	1561355	1561360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_003919	GC	3	6	1561359	1561364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_003919	G	6	6	1561384	1561389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_003919	GC	3	6	1562007	1562012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_003919	TGCGCA	2	12	1562075	1562086	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_003919	ATGCGG	2	12	1562147	1562158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_003919	CG	3	6	1562182	1562187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_003919	GC	4	8	1562211	1562218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_003919	AATGC	2	10	1562248	1562257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5028	NC_003919	GT	3	6	1562270	1562275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_003919	AAC	2	6	1562359	1562364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_003919	CGA	2	6	1562375	1562380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_003919	ACA	2	6	1562385	1562390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_003919	TGC	2	6	1562571	1562576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_003919	TCT	2	6	1562649	1562654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_003919	GC	4	8	1562712	1562719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_003919	TG	3	6	1563122	1563127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_003919	GCC	2	6	1563535	1563540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_003919	GCA	2	6	1563578	1563583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_003919	ACATC	2	10	1564193	1564202	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5039	NC_003919	ATGC	2	8	1564267	1564274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_003919	GGCA	2	8	1564304	1564311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_003919	ATGC	2	8	1564320	1564327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_003919	GGTG	2	8	1564352	1564359	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_003919	CG	3	6	1564375	1564380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_003919	GCG	2	6	1564384	1564389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_003919	CGC	2	6	1564420	1564425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_003919	ACG	2	6	1564476	1564481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_003919	ATGA	2	8	1564514	1564521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_003919	GACG	2	8	1564526	1564533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_003919	AAAC	2	8	1564538	1564545	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_003919	ACA	2	6	1564572	1564577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_003919	CGT	2	6	1564645	1564650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_003919	GC	3	6	1564652	1564657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_003919	TGG	2	6	1564669	1564674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_003919	GCC	2	6	1564691	1564696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_003919	GCGA	2	8	1564766	1564773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_003919	GCTGG	2	10	1564775	1564784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5057	NC_003919	CCT	2	6	1564818	1564823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_003919	GC	4	8	1564864	1564871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_003919	AGC	2	6	1564961	1564966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_003919	TAC	2	6	1566411	1566416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_003919	CGC	2	6	1566498	1566503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_003919	GC	4	8	1566514	1566521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_003919	GAT	2	6	1567017	1567022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_003919	CGCA	2	8	1567064	1567071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_003919	CAT	2	6	1567092	1567097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_003919	GGC	2	6	1567139	1567144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_003919	CGT	2	6	1567209	1567214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_003919	GCG	2	6	1567244	1567249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_003919	GTG	2	6	1567283	1567288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_003919	GGCA	2	8	1567292	1567299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_003919	ACG	2	6	1567307	1567312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_003919	TCGG	2	8	1567330	1567337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_003919	CG	3	6	1568389	1568394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_003919	GGC	2	6	1568465	1568470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_003919	TCGA	2	8	1568488	1568495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5076	NC_003919	CGC	2	6	1570580	1570585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_003919	TGG	3	9	1570610	1570618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_003919	GCG	2	6	1570674	1570679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_003919	GTG	2	6	1570718	1570723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_003919	CTG	2	6	1570739	1570744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_003919	AAT	2	6	1570753	1570758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_003919	ACCGAT	2	12	1570791	1570802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_003919	TTC	2	6	1570805	1570810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_003919	GCA	2	6	1572052	1572057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_003919	GCA	2	6	1572081	1572086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_003919	TCAA	2	8	1572140	1572147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_003919	CCG	2	6	1572183	1572188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_003919	GCC	2	6	1572252	1572257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_003919	AGC	2	6	1572259	1572264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_003919	GGCGG	2	10	1572275	1572284	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5091	NC_003919	CTG	2	6	1572343	1572348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_003919	GAT	2	6	1572394	1572399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_003919	GCGA	2	8	1572426	1572433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_003919	CAGCG	2	10	1572520	1572529	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_003919	CCGAT	2	10	1573042	1573051	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5096	NC_003919	CGCGG	2	10	1573117	1573126	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5097	NC_003919	CATG	2	8	1573192	1573199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_003919	CCG	2	6	1573235	1573240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_003919	CTT	2	6	1573243	1573248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_003919	CAGG	2	8	1573249	1573256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_003919	CG	3	6	1573899	1573904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_003919	GTCCG	2	10	1574538	1574547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5103	NC_003919	CTTGGT	2	12	1576263	1576274	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5104	NC_003919	GCC	2	6	1576287	1576292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_003919	GGC	2	6	1576337	1576342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_003919	GCC	2	6	1576349	1576354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_003919	ATG	2	6	1576390	1576395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_003919	CTT	2	6	1576404	1576409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_003919	GCC	2	6	1576482	1576487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_003919	CG	4	8	1576513	1576520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_003919	CTG	2	6	1579103	1579108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_003919	AGG	2	6	1579116	1579121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_003919	TGCA	2	8	1579123	1579130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_003919	TGCA	2	8	1579182	1579189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_003919	CAC	2	6	1580422	1580427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_003919	GC	3	6	1580450	1580455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_003919	GCAC	2	8	1580460	1580467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_003919	CTG	2	6	1580489	1580494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_003919	GC	3	6	1580510	1580515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_003919	GTG	2	6	1580524	1580529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_003919	CAA	2	6	1580555	1580560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_003919	CGG	2	6	1580565	1580570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_003919	CGT	2	6	1585131	1585136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5125	NC_003919	GGT	2	6	1587348	1587353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_003919	GCG	2	6	1587367	1587372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_003919	GCG	2	6	1587375	1587380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_003919	AGT	2	6	1587423	1587428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_003919	TCG	2	6	1587479	1587484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_003919	CGAA	2	8	1587514	1587521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5253	NC_003919	TGCG	2	8	1637413	1637420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5254	NC_003919	ACG	2	6	1637492	1637497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5258	NC_003919	GAC	2	6	1638571	1638576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5260	NC_003919	TGG	2	6	1639485	1639490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_003919	TGC	2	6	1639572	1639577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_003919	GGC	2	6	1639628	1639633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5389	NC_003919	GCG	2	6	1680358	1680363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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