MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 9558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002488	CCGTG	2	10	309034	309043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_002488	TCC	2	6	309101	309106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_002488	CAA	2	6	309470	309475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_002488	CGA	2	6	309493	309498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_002488	AGG	2	6	309528	309533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002488	GTT	2	6	309562	309567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002488	TCA	2	6	309577	309582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_002488	GCA	2	6	309673	309678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_002488	TGC	2	6	309722	309727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_002488	TGC	2	6	309758	309763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_002488	GTC	2	6	309789	309794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_002488	CTC	2	6	309800	309805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_002488	TGA	2	6	309814	309819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002488	CTC	2	6	309920	309925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_002488	GTGAG	2	10	309946	309955	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_002488	GTT	2	6	310003	310008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002488	GGC	2	6	310027	310032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_002488	GCG	2	6	310071	310076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_002488	TGAG	2	8	310104	310111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_002488	GTG	2	6	310125	310130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_002488	GAA	2	6	310196	310201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_002488	AAG	2	6	310224	310229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_002488	GCC	2	6	310268	310273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_002488	GCA	3	9	310330	310338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_002488	GCA	2	6	310405	310410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_002488	ACC	2	6	310425	310430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_002488	TCGC	2	8	310477	310484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_002488	GCA	2	6	310495	310500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_002488	AGC	2	6	310566	310571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_002488	CCT	2	6	310642	310647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_002488	CCA	2	6	310666	310671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_002488	CCA	2	6	310681	310686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_002488	GCG	2	6	310692	310697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_002488	GT	3	6	310738	310743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_002488	CTT	2	6	310751	310756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_002488	GCA	2	6	310813	310818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_002488	A	6	6	310964	310969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_002488	GGCA	2	8	310988	310995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_002488	CAT	2	6	311015	311020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_002488	TGGTC	2	10	311038	311047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_002488	GAT	2	6	311165	311170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_002488	GCC	2	6	311187	311192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_002488	TCA	2	6	311235	311240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_002488	ACACGT	2	12	311245	311256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_002488	GCAG	2	8	311263	311270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_002488	GAT	2	6	311309	311314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_002488	TTG	2	6	311361	311366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_002488	TGC	3	9	311388	311396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_002488	CAG	2	6	311405	311410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_002488	CAG	2	6	311522	311527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_002488	GC	3	6	311616	311621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_002488	GCA	2	6	311635	311640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_002488	TGC	2	6	311685	311690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_002488	GAA	2	6	311717	311722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002488	TCT	2	6	311748	311753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_002488	AGT	2	6	311812	311817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002488	CAG	2	6	311855	311860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_002488	CGA	2	6	311941	311946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_002488	CAC	2	6	311948	311953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_002488	TGA	2	6	311965	311970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_002488	TGCG	2	8	311998	312005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_002488	GGT	2	6	312006	312011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_002488	GT	3	6	312056	312061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_002488	CGGT	2	8	312080	312087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_002488	GTC	2	6	312101	312106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_002488	CGC	2	6	312121	312126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_002488	GCCAG	2	10	312130	312139	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_002488	TGG	2	6	312160	312165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_002488	CCA	2	6	312187	312192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_002488	GAA	2	6	312260	312265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_002488	CGC	2	6	312277	312282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_002488	GC	3	6	312293	312298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_002488	TCC	2	6	312300	312305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_002488	TGAT	2	8	312310	312317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_002488	GT	3	6	312385	312390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_002488	AGC	2	6	313720	313725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_002488	GAT	2	6	313802	313807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_002488	TTG	2	6	313869	313874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_002488	GCC	2	6	313927	313932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_002488	TCC	2	6	313945	313950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_002488	CAGG	2	8	313952	313959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_002488	CGG	2	6	313987	313992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_002488	CGC	2	6	314025	314030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_002488	TTG	2	6	314041	314046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_002488	GCT	2	6	314065	314070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_002488	GTG	2	6	314071	314076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_002488	GCA	2	6	314096	314101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_002488	TGC	2	6	314147	314152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_002488	GGAGCC	2	12	314172	314183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_002488	ACC	2	6	314209	314214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_002488	TGC	2	6	314251	314256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_002488	GCC	2	6	314289	314294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_002488	CCG	2	6	314335	314340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_002488	GGTT	2	8	314346	314353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_002488	CCA	2	6	314368	314373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_002488	GCTG	2	8	314399	314406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_002488	CGC	2	6	314434	314439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_002488	GAT	2	6	314465	314470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_002488	TGG	2	6	314542	314547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_002488	CGA	2	6	314563	314568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_002488	TGA	2	6	314578	314583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_002488	CGCA	2	8	314599	314606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_002488	TG	3	6	314644	314649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_002488	GAA	2	6	314678	314683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_002488	GTA	2	6	314722	314727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_002488	CGC	2	6	314812	314817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_002488	GAA	2	6	314888	314893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_002488	ACGG	2	8	314918	314925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_002488	GTC	2	6	314969	314974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_002488	GCA	2	6	315049	315054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_002488	TCG	3	9	315126	315134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_002488	GCA	2	6	315169	315174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_002488	CGC	2	6	315205	315210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_002488	GGC	2	6	315221	315226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_002488	GCCGTC	2	12	315267	315278	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_002488	GT	3	6	315569	315574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002488	GTG	2	6	315591	315596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_002488	CGATG	2	10	315633	315642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_002488	CGA	2	6	315699	315704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_002488	TGA	2	6	315711	315716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_002488	GATG	2	8	315726	315733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_002488	GCG	3	9	315824	315832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_002488	GAC	2	6	316060	316065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_002488	AGG	2	6	316082	316087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_002488	GCTG	2	8	316105	316112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_002488	GCT	2	6	316150	316155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_002488	TGAG	2	8	316186	316193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_002488	GGA	2	6	316206	316211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_002488	TGAC	2	8	316228	316235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_002488	CT	3	6	316353	316358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_002488	TAAA	2	8	316420	316427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_002488	TGAA	2	8	316457	316464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_002488	TGG	2	6	316529	316534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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