MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 9558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002488	T	6	6	191605	191610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002488	T	6	6	191628	191633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002488	TC	3	6	191721	191726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_002488	GTG	2	6	191751	191756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002488	GGA	2	6	191763	191768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002488	GAA	2	6	192176	192181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_002488	AGG	2	6	192193	192198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_002488	AACC	2	8	192208	192215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_002488	CTT	2	6	192469	192474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_002488	AGT	2	6	192496	192501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002488	TGC	2	6	192537	192542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_002488	A	6	6	192575	192580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002488	GCT	2	6	192602	192607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002488	CAG	2	6	192615	192620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002488	CA	3	6	192640	192645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_002488	GTG	2	6	192646	192651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002488	TTG	2	6	192675	192680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002488	GATC	2	8	192683	192690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_002488	AGT	2	6	195407	195412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002488	T	6	6	195460	195465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002488	GCT	2	6	195514	195519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_002488	GCT	2	6	195546	195551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_002488	TG	3	6	195626	195631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002488	GCG	2	6	195662	195667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002488	TGAT	2	8	200114	200121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002488	TTGT	2	8	200214	200221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002488	TGA	2	6	200241	200246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002488	GAT	2	6	200247	200252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002488	CAT	2	6	200481	200486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002488	TTC	2	6	200540	200545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_002488	GAT	2	6	200566	200571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002488	ACG	2	6	200609	200614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_002488	AGA	2	6	200660	200665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_002488	GAA	2	6	200877	200882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002488	T	6	6	200913	200918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002488	AATT	2	8	200923	200930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_002488	TGA	2	6	200934	200939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002488	GAT	2	6	200974	200979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002488	ATC	2	6	201001	201006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_002488	TC	3	6	201104	201109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_002488	ATGG	2	8	201130	201137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_002488	AGG	2	6	201147	201152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002488	T	6	6	201159	201164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002488	TCC	2	6	201169	201174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_002488	TCT	2	6	201192	201197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_002488	T	6	6	201228	201233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_002488	TGG	2	6	201329	201334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_002488	TGA	2	6	201357	201362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_002488	CAC	2	6	201407	201412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_002488	GC	3	6	201496	201501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_002488	TGC	2	6	201551	201556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_002488	GCAAGT	2	12	201641	201652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1053	NC_002488	CAG	2	6	203039	203044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_002488	TCA	2	6	203457	203462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_002488	TGG	2	6	203480	203485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_002488	TCT	2	6	203849	203854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_002488	AGTC	2	8	203870	203877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_002488	ATG	2	6	203898	203903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002488	GGC	2	6	204232	204237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_002488	GTT	2	6	204308	204313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002488	TGCTTG	2	12	204324	204335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1062	NC_002488	GTGCC	2	10	204350	204359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_002488	TGA	2	6	204393	204398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002488	GTT	2	6	204443	204448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_002488	TGA	2	6	204492	204497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_002488	GCT	2	6	204503	204508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_002488	TAAT	2	8	205064	205071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_002488	CAT	2	6	205079	205084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_002488	GGC	2	6	205127	205132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_002488	GAT	2	6	205139	205144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_002488	GT	3	6	205204	205209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002488	TTG	2	6	205281	205286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_002488	TG	3	6	205303	205308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_002488	ATC	2	6	205433	205438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_002488	GTGTT	2	10	205462	205471	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_002488	GCG	2	6	206223	206228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_002488	ATC	2	6	206242	206247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_002488	TG	3	6	206252	206257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_002488	GTG	2	6	206261	206266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002488	CGC	2	6	206276	206281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_002488	GTT	2	6	206315	206320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_002488	ATTT	2	8	206331	206338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002488	TTTG	2	8	206352	206359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002488	CTT	3	9	206375	206383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_002488	ATT	2	6	206436	206441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_002488	TGA	3	9	206448	206456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002488	CATA	2	8	206643	206650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_002488	GAT	2	6	206679	206684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002488	CTT	2	6	206695	206700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_002488	CTG	2	6	206708	206713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_002488	ATG	2	6	206727	206732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_002488	AGG	2	6	206733	206738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002488	TGA	2	6	206792	206797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002488	GTGG	2	8	207541	207548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002488	TGA	2	6	207595	207600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002488	TGGT	2	8	207626	207633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_002488	T	6	6	207703	207708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_002488	TGA	2	6	207826	207831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_002488	CTT	2	6	207888	207893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_002488	AGT	2	6	207901	207906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002488	CGATG	2	10	208564	208573	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_002488	TTCA	2	8	209080	209087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_002488	CGC	2	6	209153	209158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_002488	GTA	2	6	209160	209165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002488	GGC	2	6	209233	209238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002488	TG	4	8	210268	210275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002488	CTG	2	6	210278	210283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_002488	GAG	2	6	213914	213919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_002488	AGG	2	6	213920	213925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_002488	GTCATC	2	12	213970	213981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_002488	GTG	2	6	213982	213987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002488	GC	3	6	214039	214044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_002488	CAG	2	6	214085	214090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002488	GT	3	6	214101	214106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002488	CGT	2	6	215112	215117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_002488	T	8	8	215295	215302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002488	GAT	2	6	215309	215314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002488	GTC	2	6	215331	215336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_002488	GTG	2	6	215377	215382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002488	GTG	2	6	215412	215417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002488	TCA	2	6	215438	215443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_002488	T	6	6	215520	215525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_002488	TCTT	2	8	215546	215553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_002488	GTG	2	6	216694	216699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002488	CGT	2	6	216702	216707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_002488	ACT	2	6	216753	216758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_002488	GT	3	6	216780	216785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002488	TG	3	6	216874	216879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002488	T	6	6	216881	216886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_002488	TG	3	6	216899	216904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_002488	TTG	2	6	216924	216929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002488	TGC	2	6	216937	216942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_002488	TGA	2	6	216980	216985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_002488	T	6	6	217504	217509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_002488	CCGTTG	2	12	217524	217535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_002488	AGGA	2	8	217556	217563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_002488	AG	3	6	219049	219054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_002488	CGATT	2	10	219164	219173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1140	NC_002488	CGT	2	6	219822	219827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_002488	GA	3	6	219841	219846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_002488	TTCT	2	8	220943	220950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1143	NC_002488	GCA	3	9	222540	222548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_002488	AC	3	6	222564	222569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_002488	T	6	6	222572	222577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_002488	GCG	2	6	222658	222663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1147	NC_002488	TGG	2	6	222665	222670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_002488	TCG	2	6	222693	222698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1149	NC_002488	CAT	2	6	222728	222733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_002488	GTT	2	6	222826	222831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_002488	TGTC	2	8	222914	222921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_002488	TGA	2	6	222949	222954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_002488	GAAGG	2	10	222995	223004	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_002488	CTAT	2	8	223056	223063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1155	NC_002488	TGT	2	6	223134	223139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_002488	TTA	2	6	223365	223370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_002488	TAT	2	6	223382	223387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_002488	ATA	2	6	223390	223395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_002488	AT	3	6	224042	224047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_002488	CGTA	2	8	224342	224349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1164	NC_002488	GTG	2	6	224437	224442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_002488	AGG	2	6	224449	224454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_002488	ACG	2	6	224482	224487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_002488	CTT	2	6	224592	224597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1169	NC_002488	AT	3	6	224599	224604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_002488	AAG	2	6	224624	224629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_002488	TGT	2	6	224653	224658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_002488	TG	3	6	224669	224674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_002488	CTA	2	6	224721	224726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1176	NC_002488	TTA	2	6	224826	224831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1201	NC_002488	TG	4	8	231056	231063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_002488	TTG	2	6	243132	243137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_002488	TAA	2	6	243252	243257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_002488	TAAA	2	8	243275	243282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_002488	TTAGT	2	10	243302	243311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_002488	GCTCA	2	10	243322	243331	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1257	NC_002488	CCT	2	6	243344	243349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1262	NC_002488	ATC	2	6	243704	243709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_002488	AAC	2	6	245884	245889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_002488	TGT	2	6	248682	248687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_002488	CTG	2	6	249185	249190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_002488	TTC	2	6	249201	249206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_002488	T	6	6	250139	250144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_002488	GGT	2	6	250250	250255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_002488	TGT	2	6	283259	283264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_002488	ATG	2	6	283854	283859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_002488	TGTGGG	2	12	283879	283890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_002488	GAT	2	6	284080	284085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1433	NC_002488	CAT	2	6	295339	295344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_002488	GA	3	6	298122	298127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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