MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c chromosome

Total Repeats: 9558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002488	GGA	2	6	1620105	1620110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_002488	TTAA	2	8	1620391	1620398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_002488	TCG	2	6	1620825	1620830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_002488	CAC	2	6	1620858	1620863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_002488	GAC	2	6	1620897	1620902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_002488	GCC	2	6	1620933	1620938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_002488	CTG	2	6	1620964	1620969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_002488	GCGCC	2	10	1621017	1621026	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6009	NC_002488	CTG	2	6	1621050	1621055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_002488	TTA	2	6	1627903	1627908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_002488	ATT	2	6	1628425	1628430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_002488	TTAA	2	8	1628432	1628439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_002488	TGA	2	6	1629912	1629917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_002488	GA	3	6	1629955	1629960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_002488	TGA	2	6	1629962	1629967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_002488	ACC	2	6	1630038	1630043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_002488	AGC	2	6	1630118	1630123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_002488	A	6	6	1630153	1630158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_002488	GT	3	6	1630552	1630557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_002488	TTA	3	9	1630633	1630641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_002488	ATT	2	6	1630655	1630660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_002488	ATG	2	6	1630672	1630677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_002488	TGA	3	9	1631077	1631085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_002488	TCTT	2	8	1631122	1631129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_002488	GTA	2	6	1631229	1631234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_002488	TGC	2	6	1631251	1631256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_002488	ATC	2	6	1631271	1631276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_002488	CGA	2	6	1631358	1631363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_002488	CCT	2	6	1631364	1631369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_002488	CCG	2	6	1631395	1631400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_002488	CCA	2	6	1631404	1631409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_002488	TATTT	2	10	1631429	1631438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_002488	TGT	2	6	1631442	1631447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_002488	GT	3	6	1631455	1631460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_002488	T	6	6	1631483	1631488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_002488	GT	3	6	1631520	1631525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_002488	ATT	2	6	1631677	1631682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_002488	GTT	2	6	1631684	1631689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_002488	ATT	2	6	1631729	1631734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_002488	TGA	2	6	1631737	1631742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_002488	TA	3	6	1631751	1631756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_002488	ATT	2	6	1631763	1631768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_002488	ATT	2	6	1632768	1632773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_002488	ATC	2	6	1632787	1632792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_002488	TGT	2	6	1632794	1632799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_002488	CGTT	2	8	1634516	1634523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_002488	TGA	2	6	1634536	1634541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_002488	ATT	2	6	1634567	1634572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_002488	AG	3	6	1634673	1634678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_002488	GGC	2	6	1634730	1634735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_002488	ATA	2	6	1634814	1634819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_002488	AG	3	6	1637575	1637580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_002488	TTCT	2	8	1638516	1638523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_002488	TTGGA	2	10	1638576	1638585	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_002488	T	6	6	1638782	1638787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_002488	AGCG	2	8	1638794	1638801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_002488	CCAC	2	8	1638812	1638819	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6058	NC_002488	ACG	2	6	1642893	1642898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_002488	CGC	2	6	1642938	1642943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_002488	CGC	2	6	1644091	1644096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_002488	CTT	2	6	1644169	1644174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_002488	AG	4	8	1644190	1644197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_002488	CG	3	6	1644209	1644214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_002488	CCG	2	6	1644221	1644226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_002488	CGA	2	6	1645324	1645329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_002488	TGA	2	6	1645349	1645354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_002488	GCA	2	6	1646427	1646432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_002488	GCAAG	2	10	1646449	1646458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6069	NC_002488	TGA	2	6	1646518	1646523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_002488	TAAT	2	8	1646550	1646557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_002488	AGC	2	6	1647671	1647676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_002488	GCGA	2	8	1648908	1648915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_002488	GGC	2	6	1648919	1648924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_002488	G	6	6	1648949	1648954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_002488	GCAGCC	2	12	1648989	1649000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_002488	GTT	2	6	1649913	1649918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_002488	GCT	2	6	1649951	1649956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_002488	TGA	2	6	1649998	1650003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_002488	TAG	2	6	1650018	1650023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_002488	GC	3	6	1652266	1652271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_002488	CATTC	2	10	1652282	1652291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6082	NC_002488	GAATC	2	10	1655166	1655175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_002488	TCA	2	6	1660077	1660082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_002488	TCAGG	2	10	1661025	1661034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_002488	CCG	2	6	1661035	1661040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_002488	GCG	2	6	1661059	1661064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_002488	TGC	2	6	1661065	1661070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_002488	GGC	2	6	1662179	1662184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_002488	TCT	2	6	1668782	1668787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_002488	CGC	2	6	1668804	1668809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_002488	CCAT	2	8	1668811	1668818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_002488	GC	3	6	1668853	1668858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_002488	GC	4	8	1668860	1668867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_002488	TGG	2	6	1668870	1668875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_002488	GCG	2	6	1669941	1669946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_002488	CGGCG	2	10	1669965	1669974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6097	NC_002488	ATG	2	6	1670002	1670007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_002488	GGA	2	6	1670037	1670042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_002488	GC	3	6	1671643	1671648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_002488	T	6	6	1671669	1671674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_002488	CGGGC	2	10	1673543	1673552	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6102	NC_002488	TGC	2	6	1673730	1673735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_002488	CCG	2	6	1673748	1673753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_002488	ACCT	2	8	1673823	1673830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_002488	AGC	2	6	1675111	1675116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6107	NC_002488	GAC	2	6	1675188	1675193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_002488	GCG	2	6	1675418	1675423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_002488	GCC	2	6	1675529	1675534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_002488	TGA	2	6	1675543	1675548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_002488	TCG	2	6	1675572	1675577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_002488	CGAG	2	8	1675593	1675600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_002488	CTG	2	6	1675604	1675609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_002488	CGG	2	6	1675612	1675617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_002488	CG	3	6	1675621	1675626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_002488	TCG	2	6	1675698	1675703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_002488	GTG	2	6	1675716	1675721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_002488	GAA	2	6	1675722	1675727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_002488	TGG	2	6	1675741	1675746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_002488	CCGC	2	8	1675772	1675779	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_002488	GAA	2	6	1675806	1675811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_002488	TCC	2	6	1676085	1676090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_002488	CCT	2	6	1676509	1676514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_002488	GAA	2	6	1676515	1676520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_002488	CG	3	6	1676573	1676578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_002488	GCG	2	6	1676580	1676585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_002488	AGA	2	6	1676940	1676945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_002488	CGG	2	6	1676980	1676985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_002488	GCG	2	6	1677008	1677013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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