MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 plasmid pXcaw58

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020817	GC	3	6	146	151	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
2	NC_020817	CG	3	6	159	164	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
3	NC_020817	CG	3	6	250	255	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
4	NC_020817	CG	3	6	517	522	0 %	0 %	50 %	50 %	471265494
5	NC_020817	AG	3	6	1012	1017	50 %	0 %	50 %	0 %	471265494
6	NC_020817	GC	3	6	1540	1545	0 %	0 %	50 %	50 %	471265495
7	NC_020817	AT	4	8	1984	1991	50 %	50 %	0 %	0 %	471265496
8	NC_020817	GC	3	6	2070	2075	0 %	0 %	50 %	50 %	471265496
9	NC_020817	GC	3	6	4109	4114	0 %	0 %	50 %	50 %	471265497
10	NC_020817	CG	3	6	4984	4989	0 %	0 %	50 %	50 %	471265500
11	NC_020817	GT	3	6	5319	5324	0 %	50 %	50 %	0 %	471265500
12	NC_020817	GC	3	6	6390	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
13	NC_020817	CG	3	6	6521	6526	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
14	NC_020817	CG	3	6	7011	7016	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
15	NC_020817	GC	3	6	7094	7099	0 %	0 %	50 %	50 %	471265502
16	NC_020817	TG	3	6	7538	7543	0 %	50 %	50 %	0 %	471265502
17	NC_020817	GC	3	6	9330	9335	0 %	0 %	50 %	50 %	471265503
18	NC_020817	GC	3	6	9817	9822	0 %	0 %	50 %	50 %	471265504
19	NC_020817	AG	3	6	9958	9963	50 %	0 %	50 %	0 %	471265504
20	NC_020817	AC	3	6	10154	10159	50 %	0 %	0 %	50 %	471265504
21	NC_020817	CG	3	6	11774	11779	0 %	0 %	50 %	50 %	471265508
22	NC_020817	CG	3	6	13119	13124	0 %	0 %	50 %	50 %	471265510
23	NC_020817	GC	3	6	13131	13136	0 %	0 %	50 %	50 %	471265510
24	NC_020817	AC	3	6	13303	13308	50 %	0 %	0 %	50 %	471265510
25	NC_020817	AC	3	6	13399	13404	50 %	0 %	0 %	50 %	471265510
26	NC_020817	CT	3	6	16482	16487	0 %	50 %	0 %	50 %	471265511
27	NC_020817	CG	3	6	16977	16982	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
28	NC_020817	GC	3	6	17243	17248	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
29	NC_020817	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
30	NC_020817	CG	3	6	17347	17352	0 %	0 %	50 %	50 %	471265511
31	NC_020817	GC	3	6	17705	17710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265512
32	NC_020817	GC	3	6	18034	18039	0 %	0 %	50 %	50 %	471265513
33	NC_020817	CA	3	6	18269	18274	50 %	0 %	0 %	50 %	471265514
34	NC_020817	GC	3	6	18324	18329	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
35	NC_020817	GC	3	6	19117	19122	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
36	NC_020817	GC	3	6	19615	19620	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
37	NC_020817	CG	3	6	19795	19800	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
38	NC_020817	GC	3	6	19830	19835	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
39	NC_020817	GC	3	6	19956	19961	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
40	NC_020817	CG	3	6	19966	19971	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
41	NC_020817	CG	5	10	20051	20060	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
42	NC_020817	GC	3	6	20919	20924	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
43	NC_020817	GC	3	6	20992	20997	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
44	NC_020817	CG	4	8	21176	21183	0 %	0 %	50 %	50 %	471265514
45	NC_020817	GC	3	6	21990	21995	0 %	0 %	50 %	50 %	471265516
46	NC_020817	GT	3	6	25334	25339	0 %	50 %	50 %	0 %	471265518
47	NC_020817	GT	3	6	25430	25435	0 %	50 %	50 %	0 %	471265518
48	NC_020817	GC	3	6	25602	25607	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
49	NC_020817	CG	3	6	25614	25619	0 %	0 %	50 %	50 %	471265518
50	NC_020817	CG	3	6	26291	26296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265519
51	NC_020817	GC	3	6	27269	27274	0 %	0 %	50 %	50 %	471265520
52	NC_020817	GC	3	6	28412	28417	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
53	NC_020817	GC	3	6	28505	28510	0 %	0 %	50 %	50 %	471265522
54	NC_020817	AT	3	6	28875	28880	50 %	50 %	0 %	0 %	471265522
55	NC_020817	TC	3	6	29254	29259	0 %	50 %	0 %	50 %	471265523
56	NC_020817	GC	3	6	30714	30719	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
57	NC_020817	GC	3	6	30800	30805	0 %	0 %	50 %	50 %	471265525
58	NC_020817	CG	4	8	31703	31710	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
59	NC_020817	GC	3	6	32210	32215	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
60	NC_020817	GC	3	6	32291	32296	0 %	0 %	50 %	50 %	471265527
61	NC_020817	GC	3	6	33074	33079	0 %	0 %	50 %	50 %	471265528
62	NC_020817	CG	3	6	33380	33385	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
63	NC_020817	CG	3	6	33941	33946	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
64	NC_020817	GC	3	6	33973	33978	0 %	0 %	50 %	50 %	471265529
65	NC_020817	GC	3	6	35026	35031	0 %	0 %	50 %	50 %	471265530
66	NC_020817	AT	3	6	35372	35377	50 %	50 %	0 %	0 %	471265531
67	NC_020817	GT	3	6	35418	35423	0 %	50 %	50 %	0 %	471265531
68	NC_020817	CG	3	6	36014	36019	0 %	0 %	50 %	50 %	471265533
69	NC_020817	CA	3	6	37882	37887	50 %	0 %	0 %	50 %	471265536
70	NC_020817	CT	3	6	38114	38119	0 %	50 %	0 %	50 %	471265537
71	NC_020817	CG	3	6	38353	38358	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
72	NC_020817	GC	3	6	38459	38464	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
73	NC_020817	CG	4	8	38733	38740	0 %	0 %	50 %	50 %	471265537
74	NC_020817	CG	3	6	39695	39700	0 %	0 %	50 %	50 %	471265538
75	NC_020817	AG	3	6	40238	40243	50 %	0 %	50 %	0 %	471265539
76	NC_020817	GC	3	6	40628	40633	0 %	0 %	50 %	50 %	471265540
77	NC_020817	CG	3	6	42145	42150	0 %	0 %	50 %	50 %	471265541
78	NC_020817	GC	3	6	43484	43489	0 %	0 %	50 %	50 %	471265544
79	NC_020817	CG	3	6	43615	43620	0 %	0 %	50 %	50 %	471265544
80	NC_020817	GC	3	6	44565	44570	0 %	0 %	50 %	50 %	471265545
81	NC_020817	GC	3	6	44761	44766	0 %	0 %	50 %	50 %	471265546
82	NC_020817	TC	3	6	45277	45282	0 %	50 %	0 %	50 %	471265547
83	NC_020817	GC	3	6	45834	45839	0 %	0 %	50 %	50 %	471265548
84	NC_020817	CG	3	6	47568	47573	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
85	NC_020817	GC	3	6	47735	47740	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
86	NC_020817	CG	3	6	48380	48385	0 %	0 %	50 %	50 %	471265550
87	NC_020817	CA	3	6	48454	48459	50 %	0 %	0 %	50 %	471265550
88	NC_020817	GC	3	6	49325	49330	0 %	0 %	50 %	50 %	471265552
89	NC_020817	CG	3	6	49696	49701	0 %	0 %	50 %	50 %	471265552
90	NC_020817	GC	3	6	50170	50175	0 %	0 %	50 %	50 %	471265553
91	NC_020817	AC	3	6	50811	50816	50 %	0 %	0 %	50 %	471265554
92	NC_020817	GC	3	6	51265	51270	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
93	NC_020817	GA	3	6	51540	51545	50 %	0 %	50 %	0 %	471265555
94	NC_020817	CG	3	6	52373	52378	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
95	NC_020817	GC	3	6	52463	52468	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
96	NC_020817	CG	3	6	52686	52691	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
97	NC_020817	GC	3	6	52763	52768	0 %	0 %	50 %	50 %	471265555
98	NC_020817	GC	3	6	53060	53065	0 %	0 %	50 %	50 %	471265556
99	NC_020817	GC	3	6	54634	54639	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
100	NC_020817	GC	3	6	54819	54824	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
101	NC_020817	CG	3	6	54891	54896	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
102	NC_020817	CG	5	10	55756	55765	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
103	NC_020817	CG	3	6	55845	55850	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
104	NC_020817	GC	3	6	55855	55860	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
105	NC_020817	GC	3	6	55981	55986	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
106	NC_020817	CG	3	6	56016	56021	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
107	NC_020817	GC	3	6	56196	56201	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
108	NC_020817	GC	3	6	56694	56699	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
109	NC_020817	GC	3	6	57487	57492	0 %	0 %	50 %	50 %	471265559
110	NC_020817	TG	3	6	57542	57547	0 %	50 %	50 %	0 %	471265559
111	NC_020817	GC	3	6	57777	57782	0 %	0 %	50 %	50 %	471265560
112	NC_020817	GC	3	6	58106	58111	0 %	0 %	50 %	50 %	471265561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.