MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 114593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020815	GCC	2	6	47509	47514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265607
1002	NC_020815	AGC	2	6	47520	47525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1003	NC_020815	TGC	2	6	47527	47532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1004	NC_020815	GCG	2	6	47549	47554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265607
1005	NC_020815	CAAC	2	8	47617	47624	50 %	0 %	0 %	50 %	471265607
1006	NC_020815	CGC	2	6	47633	47638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265607
1007	NC_020815	GGC	2	6	47669	47674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265607
1008	NC_020815	GCAC	2	8	47720	47727	25 %	0 %	25 %	50 %	471265607
1009	NC_020815	TGA	2	6	47748	47753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265607
1010	NC_020815	GCT	2	6	47815	47820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1011	NC_020815	GCA	2	6	47821	47826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1012	NC_020815	CAG	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1013	NC_020815	CTT	2	6	48001	48006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265607
1014	NC_020815	CGTG	2	8	48031	48038	0 %	25 %	50 %	25 %	471265607
1015	NC_020815	ACG	2	6	48105	48110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265607
1016	NC_020815	TTC	2	6	48212	48217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471265608
1017	NC_020815	TGC	2	6	48244	48249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1018	NC_020815	CG	4	8	48265	48272	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1019	NC_020815	CGCC	2	8	48275	48282	0 %	0 %	25 %	75 %	471265608
1020	NC_020815	CAT	2	6	48311	48316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265608
1021	NC_020815	CCA	2	6	48352	48357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265608
1022	NC_020815	TGT	2	6	48385	48390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265608
1023	NC_020815	TGT	2	6	48418	48423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265608
1024	NC_020815	GCG	2	6	48498	48503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265608
1025	NC_020815	GTT	2	6	48530	48535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471265608
1026	NC_020815	CCG	2	6	48616	48621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265608
1027	NC_020815	CCG	2	6	48643	48648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265608
1028	NC_020815	CG	4	8	48673	48680	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1029	NC_020815	CCA	2	6	48712	48717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265608
1030	NC_020815	CGC	2	6	48724	48729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265608
1031	NC_020815	GCA	2	6	48740	48745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1032	NC_020815	GCC	2	6	48759	48764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265608
1033	NC_020815	GTG	2	6	48783	48788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265608
1034	NC_020815	GC	3	6	48841	48846	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1035	NC_020815	GCA	2	6	48848	48853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1036	NC_020815	GC	3	6	48859	48864	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1037	NC_020815	GC	4	8	48902	48909	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1038	NC_020815	GCGT	2	8	48920	48927	0 %	25 %	50 %	25 %	471265608
1039	NC_020815	CCG	2	6	48982	48987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265608
1040	NC_020815	GCCG	2	8	48995	49002	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1041	NC_020815	AGCGC	2	10	49004	49013	20 %	0 %	40 %	40 %	471265608
1042	NC_020815	GGT	2	6	49025	49030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265608
1043	NC_020815	CG	3	6	49068	49073	0 %	0 %	50 %	50 %	471265608
1044	NC_020815	GGC	2	6	49091	49096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265608
1045	NC_020815	GAC	2	6	49107	49112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1046	NC_020815	GCT	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1047	NC_020815	CGCCTG	2	12	49266	49277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471265608
1048	NC_020815	CTG	2	6	49347	49352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1049	NC_020815	GTG	2	6	49364	49369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265608
1050	NC_020815	ATG	2	6	49375	49380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265608
1051	NC_020815	ACA	2	6	49435	49440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265608
1052	NC_020815	ACG	2	6	49453	49458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265608
1053	NC_020815	GGCGC	2	10	49499	49508	0 %	0 %	60 %	40 %	471265608
1054	NC_020815	AGA	2	6	49553	49558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471265608
1055	NC_020815	CAAG	2	8	49604	49611	50 %	0 %	25 %	25 %	471265608
1056	NC_020815	GCA	2	6	49815	49820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1057	NC_020815	CG	3	6	49843	49848	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1058	NC_020815	ACCC	2	8	49891	49898	25 %	0 %	0 %	75 %	471265609
1059	NC_020815	GGT	2	6	49937	49942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
1060	NC_020815	CCG	2	6	50005	50010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1061	NC_020815	C	6	6	50084	50089	0 %	0 %	0 %	100 %	471265609
1062	NC_020815	GCA	2	6	50101	50106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1063	NC_020815	CGA	2	6	50132	50137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1064	NC_020815	CAGC	2	8	50272	50279	25 %	0 %	25 %	50 %	471265609
1065	NC_020815	CG	3	6	50289	50294	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1066	NC_020815	CGG	2	6	50357	50362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1067	NC_020815	CCCG	2	8	50453	50460	0 %	0 %	25 %	75 %	471265609
1068	NC_020815	GCG	2	6	50482	50487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1069	NC_020815	CGC	2	6	50560	50565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1070	NC_020815	GCG	2	6	50580	50585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1071	NC_020815	CGC	2	6	50615	50620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1072	NC_020815	ATCT	2	8	50655	50662	25 %	50 %	0 %	25 %	471265609
1073	NC_020815	CGA	2	6	50666	50671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1074	NC_020815	GCG	2	6	50689	50694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1075	NC_020815	CG	3	6	50702	50707	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1076	NC_020815	CGG	2	6	50738	50743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1077	NC_020815	CCAC	2	8	50799	50806	25 %	0 %	0 %	75 %	471265609
1078	NC_020815	GCA	2	6	50807	50812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1079	NC_020815	CAG	2	6	50847	50852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1080	NC_020815	GTG	2	6	50859	50864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
1081	NC_020815	GCA	2	6	50893	50898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1082	NC_020815	ATC	2	6	50965	50970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265609
1083	NC_020815	GC	3	6	50980	50985	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1084	NC_020815	GCG	2	6	50991	50996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1085	NC_020815	CGC	2	6	51008	51013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1086	NC_020815	TGC	2	6	51031	51036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1087	NC_020815	GACC	2	8	51101	51108	25 %	0 %	25 %	50 %	471265609
1088	NC_020815	CTG	2	6	51117	51122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1089	NC_020815	GTG	2	6	51123	51128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
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1091	NC_020815	GC	4	8	51212	51219	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1092	NC_020815	TGC	2	6	51220	51225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1093	NC_020815	ATC	2	6	51238	51243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265609
1094	NC_020815	GCG	2	6	51306	51311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1095	NC_020815	GC	5	10	51315	51324	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1096	NC_020815	GC	3	6	51326	51331	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1097	NC_020815	TGCA	2	8	51337	51344	25 %	25 %	25 %	25 %	471265609
1098	NC_020815	CCG	2	6	51406	51411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1099	NC_020815	GTC	2	6	51420	51425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1100	NC_020815	GCC	2	6	51494	51499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265609
1101	NC_020815	CAG	2	6	51545	51550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1102	NC_020815	ACA	2	6	51607	51612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471265609
1103	NC_020815	GC	3	6	51613	51618	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1104	NC_020815	GGC	2	6	51636	51641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1105	NC_020815	CGG	2	6	51646	51651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265609
1106	NC_020815	CTG	2	6	51906	51911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1107	NC_020815	CGA	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1108	NC_020815	GCGCAA	2	12	52013	52024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265609
1109	NC_020815	GGT	2	6	52058	52063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
1110	NC_020815	AGCG	2	8	52119	52126	25 %	0 %	50 %	25 %	471265609
1111	NC_020815	GCCGC	2	10	52141	52150	0 %	0 %	40 %	60 %	471265609
1112	NC_020815	GC	3	6	52149	52154	0 %	0 %	50 %	50 %	471265609
1113	NC_020815	TCA	2	6	52210	52215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265609
1114	NC_020815	GACG	2	8	52236	52243	25 %	0 %	50 %	25 %	471265609
1115	NC_020815	TGG	2	6	52300	52305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265609
1116	NC_020815	CCA	2	6	52324	52329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265609
1117	NC_020815	CGTG	2	8	52388	52395	0 %	25 %	50 %	25 %	471265609
1118	NC_020815	CGC	2	6	52612	52617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265610
1119	NC_020815	CTG	2	6	52719	52724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265610
1120	NC_020815	TGG	2	6	52728	52733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265610
1121	NC_020815	TGA	2	6	52767	52772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265610
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1123	NC_020815	CGT	2	6	52793	52798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265610
1124	NC_020815	GGTC	2	8	52864	52871	0 %	25 %	50 %	25 %	471265610
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1126	NC_020815	ACC	2	6	52913	52918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471265610
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1249	NC_020815	TCC	2	6	59197	59202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471265615
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1252	NC_020815	AGC	2	6	59359	59364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1253	NC_020815	CGC	2	6	59393	59398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265616
1254	NC_020815	CGG	2	6	59414	59419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265616
1255	NC_020815	GCA	2	6	59423	59428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1256	NC_020815	CGA	2	6	59498	59503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1257	NC_020815	CGG	2	6	59531	59536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265616
1258	NC_020815	GC	3	6	59570	59575	0 %	0 %	50 %	50 %	471265616
1259	NC_020815	CTG	2	6	59619	59624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1260	NC_020815	CGG	2	6	59671	59676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265616
1261	NC_020815	GC	4	8	59736	59743	0 %	0 %	50 %	50 %	471265616
1262	NC_020815	ATC	2	6	59763	59768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265616
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1264	NC_020815	GCCTGC	2	12	59815	59826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	471265616
1265	NC_020815	TGCC	2	8	59889	59896	0 %	25 %	25 %	50 %	471265616
1266	NC_020815	TGC	2	6	59962	59967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1267	NC_020815	CCCG	2	8	59995	60002	0 %	0 %	25 %	75 %	471265616
1268	NC_020815	GC	4	8	60029	60036	0 %	0 %	50 %	50 %	471265616
1269	NC_020815	CGA	2	6	60041	60046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
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1273	NC_020815	CGG	2	6	60164	60169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265616
1274	NC_020815	GCC	2	6	60196	60201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471265616
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1279	NC_020815	CGG	2	6	60260	60265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471265616
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1282	NC_020815	GCCG	2	8	60348	60355	0 %	0 %	50 %	50 %	471265616
1283	NC_020815	GC	3	6	60371	60376	0 %	0 %	50 %	50 %	471265616
1284	NC_020815	ATC	2	6	60390	60395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471265616
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1286	NC_020815	TGC	3	9	60463	60471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471265616
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1289	NC_020815	ATG	2	6	60534	60539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471265616
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1291	NC_020815	CGA	2	6	60632	60637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
1292	NC_020815	CGA	2	6	60653	60658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471265616
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1374	NC_020815	TGG	2	6	63599	63604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471265619
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