MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879

Total Repeats: 114593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020815	GC	3	6	550367	550372	0 %	0 %	50 %	50 %	471266015
12003	NC_020815	CGC	2	6	550382	550387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266015
12004	NC_020815	TGCG	2	8	550530	550537	0 %	25 %	50 %	25 %	471266015
12005	NC_020815	GGT	2	6	550634	550639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266015
12006	NC_020815	CTG	2	6	550646	550651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266015
12007	NC_020815	CGGGT	2	10	550671	550680	0 %	20 %	60 %	20 %	471266015
12008	NC_020815	CTG	2	6	550757	550762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266015
12009	NC_020815	GC	3	6	550797	550802	0 %	0 %	50 %	50 %	471266015
12010	NC_020815	GC	3	6	550819	550824	0 %	0 %	50 %	50 %	471266015
12011	NC_020815	CAG	2	6	550850	550855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266015
12012	NC_020815	CGA	2	6	550906	550911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266015
12013	NC_020815	GC	3	6	550942	550947	0 %	0 %	50 %	50 %	471266015
12014	NC_020815	GC	4	8	550961	550968	0 %	0 %	50 %	50 %	471266015
12015	NC_020815	CGC	2	6	551086	551091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266015
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12018	NC_020815	GCC	2	6	551207	551212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266015
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12021	NC_020815	GCC	2	6	551366	551371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266015
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12024	NC_020815	GGTC	2	8	551428	551435	0 %	25 %	50 %	25 %	471266015
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12033	NC_020815	GCGCA	2	10	551666	551675	20 %	0 %	40 %	40 %	471266015
12034	NC_020815	CGG	2	6	551713	551718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266015
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12042	NC_020815	TTCG	2	8	552102	552109	0 %	50 %	25 %	25 %	471266016
12043	NC_020815	CGT	2	6	552116	552121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266016
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12050	NC_020815	CTG	2	6	552275	552280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266016
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12053	NC_020815	GGT	2	6	552391	552396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266016
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12059	NC_020815	TGGA	2	8	552671	552678	25 %	25 %	50 %	0 %	471266016
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12069	NC_020815	GGC	2	6	553015	553020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266016
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12072	NC_020815	GGCGT	2	10	553125	553134	0 %	20 %	60 %	20 %	471266016
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12086	NC_020815	CGCA	2	8	554023	554030	25 %	0 %	25 %	50 %	471266017
12087	NC_020815	CGGCG	2	10	554034	554043	0 %	0 %	60 %	40 %	471266017
12088	NC_020815	GCA	2	6	554050	554055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266017
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12101	NC_020815	GTG	2	6	554795	554800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266017
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12104	NC_020815	CGA	2	6	554953	554958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266017
12105	NC_020815	GCG	2	6	554984	554989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266017
12106	NC_020815	CG	3	6	555072	555077	0 %	0 %	50 %	50 %	471266017
12107	NC_020815	ACT	2	6	555093	555098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471266017
12108	NC_020815	CAC	2	6	555160	555165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266017
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12112	NC_020815	CCG	2	6	555369	555374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266017
12113	NC_020815	CGC	2	6	555388	555393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266017
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12115	NC_020815	GC	3	6	555469	555474	0 %	0 %	50 %	50 %	471266017
12116	NC_020815	GT	3	6	555486	555491	0 %	50 %	50 %	0 %	471266017
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12120	NC_020815	TGG	2	6	556146	556151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266018
12121	NC_020815	GC	4	8	556178	556185	0 %	0 %	50 %	50 %	471266018
12122	NC_020815	GCC	2	6	556187	556192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266018
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12124	NC_020815	GTC	2	6	556238	556243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266018
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12143	NC_020815	CG	3	6	556805	556810	0 %	0 %	50 %	50 %	471266018
12144	NC_020815	ATC	2	6	556824	556829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471266018
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12155	NC_020815	CGC	2	6	557735	557740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266019
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12238	NC_020815	GAT	2	6	560691	560696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471266020
12239	NC_020815	CGG	2	6	560736	560741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266020
12240	NC_020815	GCG	2	6	560825	560830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266020
12241	NC_020815	CAC	2	6	560971	560976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266021
12242	NC_020815	CA	3	6	561040	561045	50 %	0 %	0 %	50 %	471266021
12243	NC_020815	TGG	2	6	561069	561074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266021
12244	NC_020815	GCA	2	6	561097	561102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266021
12245	NC_020815	CTC	2	6	561113	561118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471266021
12246	NC_020815	GGCAC	2	10	561178	561187	20 %	0 %	40 %	40 %	471266021
12247	NC_020815	AAT	2	6	561207	561212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471266021
12248	NC_020815	CAT	2	6	561676	561681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471266022
12249	NC_020815	CCA	2	6	561683	561688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266022
12250	NC_020815	CG	3	6	561689	561694	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12251	NC_020815	GTC	2	6	561705	561710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12252	NC_020815	GCA	2	6	561725	561730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12253	NC_020815	CGCC	2	8	561779	561786	0 %	0 %	25 %	75 %	471266022
12254	NC_020815	CAC	2	6	561831	561836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266022
12255	NC_020815	GC	3	6	561888	561893	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12256	NC_020815	CTG	2	6	561900	561905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12257	NC_020815	GGCC	2	8	561932	561939	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12258	NC_020815	GCG	2	6	561949	561954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266022
12259	NC_020815	CG	4	8	561953	561960	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12260	NC_020815	TGGT	2	8	561991	561998	0 %	50 %	50 %	0 %	471266022
12261	NC_020815	GAT	2	6	562023	562028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471266022
12262	NC_020815	CATC	2	8	562082	562089	25 %	25 %	0 %	50 %	471266022
12263	NC_020815	GCC	2	6	562090	562095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266022
12264	NC_020815	G	7	7	562123	562129	0 %	0 %	100 %	0 %	471266022
12265	NC_020815	GCC	2	6	562131	562136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266022
12266	NC_020815	GCT	3	9	562143	562151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12267	NC_020815	CTG	3	9	562173	562181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12268	NC_020815	CG	3	6	562203	562208	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12269	NC_020815	CGG	2	6	562262	562267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266022
12270	NC_020815	GGCCG	2	10	562278	562287	0 %	0 %	60 %	40 %	471266022
12271	NC_020815	CAC	3	9	562311	562319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266022
12272	NC_020815	ATGC	2	8	562345	562352	25 %	25 %	25 %	25 %	471266022
12273	NC_020815	CCG	2	6	562355	562360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266022
12274	NC_020815	GCT	3	9	562412	562420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266022
12275	NC_020815	CGGC	2	8	562462	562469	0 %	0 %	50 %	50 %	471266022
12276	NC_020815	CGG	3	9	562502	562510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266022
12277	NC_020815	GCC	2	6	562646	562651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266023
12278	NC_020815	GC	3	6	562656	562661	0 %	0 %	50 %	50 %	471266023
12279	NC_020815	GCC	2	6	562682	562687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266023
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12284	NC_020815	TGG	2	6	562954	562959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471266023
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12291	NC_020815	CGG	2	6	563167	563172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266023
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12293	NC_020815	TGC	2	6	563227	563232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266023
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12296	NC_020815	CTG	3	9	563360	563368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266023
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12324	NC_020815	CGT	2	6	564858	564863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266025
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12330	NC_020815	ATG	2	6	565130	565135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471266025
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12339	NC_020815	CA	3	6	565363	565368	50 %	0 %	0 %	50 %	471266025
12340	NC_020815	TCT	2	6	565383	565388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471266025
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12342	NC_020815	GC	4	8	565489	565496	0 %	0 %	50 %	50 %	471266025
12343	NC_020815	GCA	2	6	565503	565508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266025
12344	NC_020815	CGGG	2	8	565555	565562	0 %	0 %	75 %	25 %	471266025
12345	NC_020815	GCA	2	6	565584	565589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471266025
12346	NC_020815	CGG	2	6	565608	565613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266025
12347	NC_020815	GCCAAC	4	24	566260	566283	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	471266026
12348	NC_020815	CGC	2	6	566305	566310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266026
12349	NC_020815	CACG	2	8	566321	566328	25 %	0 %	25 %	50 %	471266026
12350	NC_020815	CAC	2	6	566329	566334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471266026
12351	NC_020815	GCC	2	6	566345	566350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266026
12352	NC_020815	CGC	2	6	566361	566366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471266026
12353	NC_020815	GGC	2	6	566450	566455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471266026
12354	NC_020815	GCT	2	6	566458	566463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266026
12355	NC_020815	GCAG	2	8	566473	566480	25 %	0 %	50 %	25 %	471266026
12356	NC_020815	GCAC	2	8	566524	566531	25 %	0 %	25 %	50 %	471266026
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12358	NC_020815	CGCA	2	8	566617	566624	25 %	0 %	25 %	50 %	471266027
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12480	NC_020815	TGC	3	9	573367	573375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471266037
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12483	NC_020815	AGCG	2	8	573577	573584	25 %	0 %	50 %	25 %	471266037
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